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| コンテンツ | |
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| 説明 | 翻訳後修飾データベース。 |
| 接触 | |
| 研究センター | マックス・プランク生化学研究所 |
| 研究室 | プロテオミクス・シグナル伝達部門 |
| 著者 | フロリアン・グナード |
| 主要引用文献 | Gnad ら (2011) [ 1 ] |
| 発売日 | 2009 |
| アクセス | |
| Webサイト | http://www.phosida.com |
PHO sphorylation SI te DAタブレPHOSIDA は、質量分析技術に基づいてさまざまな種で同定された、信頼性の高い数千のin vivoリン酸化部位を統合しています。各リン酸化部位について、PHOSIDA は、一致するキナーゼモチーフ、予測される二次構造、保存パターン、およびキナーゼ阻害などの刺激やその他の処理による動的な制御をリストします。これには、ヒトや酵母などの真核生物から、大腸菌やLactococcus lactisなどの細菌まで、さまざまな生物のリン酸化プロテオームが含まれます。古細菌であるHalobacterium salinarium のリン酸化プロテオームも利用可能です。系統樹を代表的にカバーする生物で同定されたリン酸化プロテオームの統合により、保存と時間的進化保存を含むグローバルな観点からリン酸化イベントを調べることができます。 [ 1 ]
さらに、PHOSIDAはサポートベクターマシンに基づいてリン酸化部位を予測します。