フェオダクティルム

フェオダクティルム
科学的分類
ドメイン：	真核生物
クレード:	発汗抑制剤
クレード:	ロシア
クレード:	ストラメノパイル
門:	ギリスタ
亜門:	オクロフィチナ
クラス：	珪藻類
注文：	ナビキュラ目
家族：	フェオダクティルス科
属:	フェオダクティルム; ・ボーリン
種：	P.トリコルヌツム
二名法名
	フェオダクティルム・トリコルヌツム; ボーリン、1897

Phaeodactylum tricornutumは珪藻類で、 Phaeodactylum属の唯一の種です。他の珪藻類とは異なり、 P. tricornutum はさまざまな形態型（紡錘形、三放射形、楕円形）で存在でき、細胞形状の変化は環境条件によって刺激されます。^[1]この特徴は、細胞形状の制御と形態形成の分子基盤を調査するために使用できます。ほとんどの珪藻類とは異なり、 P. tricornutum はケイ素がなくても成長でき、珪化した殻を作らずに生き残ることができます。^[2]これにより、珪藻類におけるケイ素ベースのナノファブリケーションの実験的調査の機会が得られます。

もう一つの特徴は、無性生殖中は殻が小さくならないように見えることです。これにより、有性生殖を必要とせずに継続的な培養が可能になります。P . tricornutum が有性生殖できるかどうかは不明です。現在まで、実験室やその他の環境で有性生殖を裏付ける実質的な証拠は見つかっていません。P . tricornutum は非典型的な羽状珪藻であると考えられますが、主要な珪藻モデル種の1つです。形質転換プロトコルが確立されており、RNAiベクターが利用可能です。^[3]^[4]これにより、分子遺伝学の研究がはるかに容易になります。

歴史

Phaeodactylum tricornutum は、1897 年に Bohlin によって三放射状形態型として初めて記載されました。^[5]P. tricornutumの最初の培養の記録は、1910 年に Allen と Nelson によって発表されましたが、 Nitzschia colsterium,W. Sm., forma miuntissimaと誤認されていました。^[6]この分離株は、1958 年に JC Lewin によってP. tricorntumとして正しく修正されました。^[7]この株は、他の後の分離株とともに、現在でも世界中の培養コレクションで維持されています。^[8]

ゲノム配列解析

Phaeodactylum tricornutumは、ゲノム配列が解読された数少ない珪藻類の1つです。2023年現在、P. tricornutumはテロメアからテロメアまでのゲノムアセンブリが存在する唯一の珪藻です。 ^[9] P. tricornutumは25対の核染色体を持つ二倍体です。

P. tricornutumは潜在的な微細藻類エネルギー源として浮上しています。この藻類は急速に成長し、標準的な培養条件下では貯蔵脂質が乾燥細胞重量の約20～30%を占めます。^[10]^[11]窒素制限はP. tricornutumに中性脂質の蓄積を誘発する可能性があり、微細藻類バイオディーゼル生産を改善するための戦略の可能性を示しています。

参照

参考文献

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外部リンク

Yongmanitchai, W; Ward, OP (1991). 「異なる培養条件下での Phaeodactylum tricornutum の増殖とオメガ 3 脂肪酸の生産」.応用環境微生物学. 57 (2): 419–425. Bibcode :1991ApEnM..57..419Y. doi :10.1128/aem.57.2.419-425.1991. PMC 182726. PMID 2014989 .
journals.tubitak.gov.tr 植物プランクトン Phaeodactylum Tricornutum の連続培養の成長(pdf)
[1] フェオダクティルム・トリコルヌツムの写真

[1] De Martino, A; Meichenin, A; Shi, J; Pan, KH; Bowler, C (2007). 「Phaeodactylum tricornutum (Bacillariophyceae) の系統の遺伝的および表現型的特徴」Journal of Phycology . 43 (5): 992–1009. doi :10.1111/j.1529-8817.2007.00384.x. S2CID 85769550.

[2] Chuang, Chia-Ying; Santschi, Peter H.; Jiang, Yuelu; Ho, Yi-Fang; Quigg, Antonietta; Guo, Laodong; Ayranov, Marin; Schumann, Dorothea (2014-06-20). 「海洋中のトリウム、プロトアクチニウム、鉛、ポロニウム、ベリリウムの粒子反応性放射性核種の除去における珪藻類由来の生体分子の重要な役割：Phaeodactylum tricornutum のケーススタディ」。Limnology and Oceanography . 59 (4): 1256–1266. Bibcode :2014LimOc..59.1256C. doi :10.4319/lo.2014.59.4.1256. ISSN 0024-3590. S2CID 98646215。

[3] Apt, KE; et al. (1996). 「分子および一般遺伝学珪藻Phaeodactylum tricornutumの安定した核形質転換」分子および一般遺伝学252 ( 5): 572–579. doi :10.1007/BF02172403. PMID 8914518. S2CID 29664801.

[4] De Riso, V; Raniello, R.; Maumus, F.; Rogato, A.; Bowler, C.; Falciatore, A. (2009). 「海洋珪藻 Phaeodactylum tricornutum における遺伝子サイレンシング」。核酸研究。37 (14): e96. doi :10.1093/nar/gkp448. PMC 2724275. PMID 19487243 .

[5] ボーリン、フォン K. (1897)。Zur Morphologie および Biology einzelliger Algen。 p. 520。

[6] アレン、EJ; ネルソン、EW (1910)。海洋プランクトン生物の人工培養について。pp.421–74。

[7] Lewin, JC (1958). 「Phaeodactylum tricornutum の分類学的位置」.一般微生物学ジャーナル. 18 (2): 427–32. doi : 10.1099/00221287-18-2-427 . PMID 13525659.

[8] De Martino, Alessandra; Meichenin, Agnes; Shi, Juan; Pan, Kehou; Bowler, Chris. 「Phaeodactylum tricornutum (Bacillariophyceae) の系統の遺伝的および表現型的特徴」。Journal of Phycology (43): 992–1009。

[9] Giguere, Daniel J.; Bahcheli, Alexander T.; Slattery, Samuel S.; Patel, Rushali R.; Browne, Tyler S.; Flatley, Martin; Bogumil, Karas J.; Edgell, David R.; Gregory, Gloor B. (2022). 「Phaeodactylum tricornutum のテロメア間ゲノムアセンブリ」. PeerJ . 10 (e13607): e13607. doi : 10.7717/peerj.13607 . PMC 9266582 . PMID 35811822.

[10] ^ Chisti, Y (2007 年 5 月 ～ 6 月)。「微細藻類からのバイオディーゼル」。バイオテクノロジーの進歩。25 (3): 294–306。doi : 10.1016 /j.biotechadv.2007.02.001。PMID 17350212。S2CID 18234512 。

[Yang_2013-11] Yang, ZK; Niu, YF; Ma, YH; Xue, J; Zhang, MH; Yang, WD; Liu, JS; Lu, SH; Guan, Y; Li, HY (2013 年 5 月 4 日)。「窒素欠乏後の珪藻における中性脂質蓄積の分子および細胞メカニズム」。バイオ燃料のためのバイオテクノロジー。6 (1): 67。doi : 10.1186 / 1754-6834-6-67。PMC 3662598。PMID 23642220。