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ホスホトランスフェラーゼシステム(PTS -GFL)スーパーファミリーは、グルコース、グルシトール(G)、フルクトース(F)、ラクトース(L )の輸送を促進するホスホトランスフェラーゼ酵素のスーパーファミリーです。分類は系統解析とバイオインフォマティクスによって確立されています。[1] [2]
細菌のホスホエノールピルビン酸:糖ホスホトランスフェラーゼシステム (PTS) は、エネルギー結合した単一のステップで糖基質を輸送し、リン酸化します。この輸送プロセスは、細胞質ホスホリル転移タンパク質 (酵素 I (I)、HPr、酵素 IIA (IIA)、酵素 IIB (IIB)) と膜貫通糖透過酵素 (IIC) に依存しています。PTS 酵素 II 複合体は、独立して進化する 4 つの PTS 酵素 II 複合体スーパーファミリーから派生しており、これには (1) グルコース (Glc)、(2) マンノース (Man)、(3) アスコルビン酸-ガラクチトール (Asc-Gat)、(4) ジヒドロキシアセトン (Dha) スーパーファミリーが含まれます。
PTS-GFL スーパーファミリーを構成する 4 つのファミリーは次のとおりです。
- 4.A.1 – PTS グルコース-グルコシド (Glc) ファミリー
- 4.A.2 – PTS フルクトースマンニトール (Fru) ファミリー
- 4.A.3 – PTS ラクトース-N,N'-ジアセチルキトビオース-β-グルコシド (Lac) ファミリー
- 4.A.4 – PTS グルシトール(腸)ファミリー
参照
さらに読む
- 「TCDB - PTS-GFL スーパーファミリー」。www.tcdb.org。
- Chang, Abraham B.; Lin, Ron; Keith Studley, W.; Tran, Can V.; Saier, Milton H. (2004-06-01). 「膜輸送タンパク質の構造と機能のガイドとしての系統発生」。分子膜生物学 21 (3): 171–181. doi :10.1080/09687680410001720830. ISSN 0968-7688. PMID 15204625.
参考文献
- ^ Chen, Jonathan S.; Reddy, Vamsee; Chen, Joshua H.; Shlykov, Maksim A.; Zheng, Wei Hao; Cho, Jaehoon; Yen, Ming Ren; Saier, Milton H. (2012-01-01). 「輸送タンパク質スーパーファミリーの系統学的特徴付け: 複数のアラインメントに基づくプログラムに対するスーパーファミリーツリー プログラムの優位性」. Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology . 21 (3–4): 83–96. doi :10.1159/000334611. ISSN 1464-1801. PMC 3290041. PMID 22286036 .
- ^ Nguyen, Thai X.; Yen, Ming-Ren; Barabote, Ravi D.; Saier, Milton H. (2006-01-01). 「ホスホエノールピルビン酸: 糖ホスホトランスフェラーゼシステムの膜透過酵素のトポロジカル予測」。Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology . 11 (6): 345–360. doi :10.1159/000095636. ISSN 1464-1801. PMID 17114898.
