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| 外膜排出タンパク質 | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | 電子ブック | ||||||||
| パム | PF02321 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| SCOP2 | 1ek9 / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 1.B.17 | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 34 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 1yc9 | ||||||||
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外膜排出タンパク質は、グラム陰性細菌においてさまざまな基質の排出を可能にする三量体（3ピース）チャネルを形成するタンパク質ファミリーのメンバーです。各排出タンパク質は2つの繰り返しで構成されています。三量体チャネルは、外膜にまたがる12本鎖のβバレルと、ペリプラズムにまたがる長い尾のらせん状バレルで構成されています。
例としては、外膜タンパク質遺伝子の適切な発現に必要な大腸菌TolC 外膜タンパク質、根粒菌の根粒形成タンパク質、フザリン酸耐性に関与する Pseudomonas FusA タンパク質などが挙げられます。
参考文献
- Johnson JM、Church GM (1999年4 月)。「多様なタンパク質ファミリーのアラインメントと構造予測: 細菌排出ポンプのペリプラズムおよび外膜タンパク質」。Journal of Molecular Biology。287 ( 3 ): 695– 715。CiteSeerX 10.1.1.73.559。doi :10.1006/jmbi.1999.2630。PMID 10092468 。