ニトロ還元酵素

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
電子データ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
電子データ	PDB : 1bkj PDB : 1ds7 PDB : 1f5v PDB : 1icr PDB : 1icu PDB : 1icv PDB : 1idtPDB : 1kqb PDB : 1kqc PDB :1kqd

ニトロ還元酵素
ニトロ還元酵素
識別子
シンボル	ニトロ還元酵素
パム	PF00881
インタープロ	著作権
医療機器	cd02062
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
電子データ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
電子データ	PDB : 1bkj PDB : 1ds7 PDB : 1f5v PDB : 1icr PDB : 1icu PDB : 1icv PDB : 1idtPDB : 1kqb PDB : 1kqc PDB :1kqd

ニトロ還元酵素は、ニトロ官能基を含む窒素含有化合物の還元に関与する進化的に関連したタンパク質のファミリーです。このファミリーのメンバーは、フラビンモノヌクレオチドを補因子として利用し、多くの場合ホモ二量体であることがわかっています。^[1]^[2]

このファミリーのメンバーには、酸素非感受性 NAD(P)H ニトロレダクターゼ (フラビンモノヌクレオチド依存性ニトロレダクターゼ) ( 6,7-ジヒドロプテリジンレダクターゼ) ( EC 1.5.1.34) およびNADHデヒドロゲナーゼ( EC 1.6.99.3) が含まれます。これらのタンパク質の多くは酸化還元酵素として説明されています。これらは主に細菌系統に見られますが、真核生物の相同遺伝子もいくつか特定されています: C. elegans P34273、D. melanogaster Q8T3Q0、 Q9VTE7、マウスQ9DCX8、およびヒトO75989。このタンパク質は光合成真核生物には見られません。光合成生物でこのエントリを含む配列は、偽陽性の可能性があります。^[要出典]

Enterobacter cloacaeのニトロ還元酵素は、Bryant と Deluca ^[3]によって、軍需工場から分離された菌株で、TNT (トリニトロトルエン) を代謝する能力に基づいて特定されました。それ以来、多くの相同体が特定され、このファミリーには多様な反応を触媒する多様な生物のメンバーが含まれることが現在知られています。哺乳類のヨードチロシン脱ヨーデナーゼは脱ハロゲン化酵素であり、Sinorhizobium meliloti の BluB は結合したフラビンモノヌクレオチドを分解して、ビタミン B12 生合成の重要な中間体を提供します。

E. cloacaeおよびE. coli酵素の結晶構造は、さまざまな基質および類似体が結合した状態で公開されています。

プロドラッグ療法のための潜在的な低温活性酵素の例として、低温活性ニトロ還元酵素 Ssap-NtrB ^[4] (Çelik and Yetis, 2012) が挙げられています。Ssap-NtrB は中温細菌由来であるにもかかわらず、がんプロドラッグに対して 20°C で最適な活性を示しました。著者らは、この新規酵素の低温活性は凍結療法と組み合わせた療法に有用であり、標的組織を低温にさらすことで酵素活性を誘発し、必要な部分のみで薬剤を活性化できるとコメントしています。さらに、この酵素は、低温で高い活性が求められる領域で爆発性および揮発性の化合物のバイオレメディエーションにも使用できます。

亜科

コブ(II)ピリリン酸α,c-ジアミド還元酵素 InterPro : IPR012825

このドメインを含むヒトタンパク質

ヨードチロシン脱ヨードナーゼ（IYD）

参考文献

^ Hecht HJ、Erdmann H、Park HJ、Sprinzl M、Schmid RD (1995 年 12 月)。「Thermus thermophilus 由来の NADH オキシダーゼの結晶構造」。Nat . Struct. Biol . 2 (12): 1109–14. doi :10.1038/nsb1295-1109. PMID 8846223. S2CID 8384273.
^ de Oliveira IM、Henriques JA、Bonatto D (2007 年 4 月)。「特定の細菌および真菌ニトロレダクターゼ様タンパク質の新しいグループの in silico 同定」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 355 (4): 919–25. doi :10.1016/j.bbrc.2007.02.049. PMID 17331467。
^ Bryant, C.; DeLuca, M. (1991-03-05). 「Enterobacter cloacae 由来の酸素非感受性 NAD(P)H ニトロ還元酵素の精製と特性評価」Journal of Biological Chemistry . 266 (7): 4119–4125. ISSN 0021-9258. PMID 1999405.
^ Çelik, Ayhan; Yetiş, Gülden (2012-06-01). 「プロドラッグ活性化のための異常に低温で活性なニトロレダクターゼ」. Bioorganic & Medicinal Chemistry . 20 (11): 3540–3550. doi :10.1016/j.bmc.2012.04.004. PMID 22546205.

この記事にはパブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR000415からのテキストが組み込まれています。

[pmid8846223-1] Hecht HJ、Erdmann H、Park HJ、Sprinzl M、Schmid RD (1995 年 12 月)。「Thermus thermophilus 由来の NADH オキシダーゼの結晶構造」。Nat . Struct. Biol . 2 (12): 1109–14. doi :10.1038/nsb1295-1109. PMID 8846223. S2CID 8384273.

[pmid17331467-2] Oliveira IM、Henriques JA、Bonatto D (2007 年 4 月)。「特定の細菌および真菌ニトロレダクターゼ様タンパク質の新しいグループの in silico 同定」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 355 (4): 919–25. doi :10.1016/j.bbrc.2007.02.049. PMID 17331467。

[3] Bryant, C.; DeLuca, M. (1991-03-05). 「Enterobacter cloacae 由来の酸素非感受性 NAD(P)H ニトロ還元酵素の精製と特性評価」Journal of Biological Chemistry . 266 (7): 4119–4125. ISSN 0021-9258. PMID 1999405.

[4] Çelik, Ayhan; Yetiş, Gülden (2012-06-01). 「プロドラッグ活性化のための異常に低温で活性なニトロレダクターゼ」. Bioorganic & Medicinal Chemistry . 20 (11): 3540–3550. doi :10.1016/j.bmc.2012.04.004. PMID 22546205.