NhaBファミリー(TC# 2.A.34 )はイオン輸送体(IT)スーパーファミリーに属します。[ 1 ] NhaBファミリーに属するタンパク質の代表的なリストは、輸送体分類データベースで見つけることができます。
NhaBホモログは通常、長さが約500アミノ酸残基(aas)で、約12個の膜貫通αヘリックススパナー(TMS)を持つが、メンバーによってはTMSの数が異なる。NhaBホモログはまた、らい菌(Mycobacterium leprae )由来の機能不明の46 kDa膜タンパク質(spP46838)と限定的な配列類似性を持つ領域を示し、このタンパク質は細菌、古細菌、真核生物のヒ酸耐性ポンプのメンバー(TC# 3.A.4)とも相同性がある。グラム陰性細菌のタンパク質のみが機能的に特徴付けられている。
大腸菌のNhaBは、相同なビブリオ・アルギノリティカスのNa + /H +アンチポーターと58%の相同性がある。[ 2 ]後者のタンパク質は10個のTMSを示すと予測されているが、NhaB-phoA融合タンパク質の構築により、N末端が細胞質に、C末端がペリプラズムにある9個のTMSモデルの証拠が得られた。[ 3 ] 3番目のTMSの中央に位置するアスパラギン酸残基は、このファミリーのすべてのメンバーで保存されており、活性に重要である。[ 4 ]
大腸菌 のNhaBによって触媒される一般的な輸送反応は以下のとおりです。
2 Na + (in) + 3 H + (out) ⇌ 2 Na + (out) + 3 H + (in).
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