| マイコリシバクター | |
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| 科学的分類 | |
| ドメイン: | 細菌 |
| 門: | 放線菌類 |
| クラス: | 放線菌 |
| 注文: | 結核菌 |
| 家族: | マイコバクテリア科 |
| 属: | マイコリシバクター ・グプタら。 2018年[1] |
| タイプ種 | |
| マイコリシバクターテラエ (Wayne 1966) Gupta et al. 2018年
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| 種[2] | |
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| 同義語 | |
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マイコリシバクターは、マイコバクテリア目マイコバクテリア科に属するグラム陽性 桿菌の属である。 [1]
2018年にグプタらは、保存されたゲノム配列、比較ゲノム解析、平均アミノ酸同一性値に基づいて構築されたさまざまな系統樹の証拠に基づいて、ミコリシバクター属をより大規模な属であるミコバクテリウムから区別しました。 [1]この属に加えて、この研究ではミコバクテリウムを合計5つの異なる属に分割することを提案しましたが、科学界の一部から抵抗がありました。この抵抗は、ミコバクテリウムには臨床的に関連する種がいくつか含まれており、名前の変更は臨床医や他の研究者の間で混乱を引き起こす可能性があるという理由に基づいていました。[3]
2020年に山田らは、細胞径、細胞長、細胞周囲長、細胞円形度、アスペクト比など、新属の基本的な形態学的特性を分析し、5つの属の間に有意な差があることを判定し、新しい分類を支持した。[4]
ミコリシバクターという名前は、ラテン語の名詞acidum mycolicum(ミコール酸)とラテン語の名詞bacter(棒)に由来しています。この名前は、棒状の細菌を含むミコール酸の属を指します。[1]
生化学的特性と分子シグネチャー[1]
Mycolicibacter属は成長が遅く (コロニー形成に 7 日以上かかる)、非色素性 (色素を生成しない) の細菌種です。一部の種は成長速度が中程度で、コロニー形成に 5 ~ 15 日かかります。Mycolicibacter 属のほとんどの種は非病原性ですが、一部の種は動物宿主やヒト患者から分離されています。これらの種は G+C 含有量が高く (66.3 ~ 70.3 mol%)、ゲノムは比較的短く (3.87 ~ 5.11 Mbp) なっています。
Mycolicibacterのゲノム配列の解析により、非リボソームペプチド合成酵素、ヌクレオシド加水分解酵素、TetR ファミリー転写調節因子、炭素飢餓タンパク質 A、エラーを起こしやすい DNA ポリメラーゼ、アミド加水分解酵素、カルボキシムノラクトン脱炭酸酵素ファミリータンパク質、ポリケチドシクラーゼ、スピロシクラーゼ AveC ファミリータンパク質、TobH タンパク質、UDP-N-アセチルムラマート-L-アラニンリガーゼ、DUF2236 ドメイン含有タンパク質、コバルトキラターゼサブユニット CobN、アルファ/ベータ加水分解酵素、カリウムトランスポーターKef、膜タンパク質、DUF222 ドメイン含有タンパク質、MFS トランスポーター、アデニル酸/グアニル酸シクラーゼドメイン含有タンパク質、DUF2029 ドメイン含有タンパク質などのタンパク質において、この属に特有の 26 個の保存されたシグネチャーインデル (CSI) が特定されました。仮説的タンパク質。[1]これらのCSIは、 Mycolicibacter属をMycobacteriaceae科の他の属から識別および区別するための信頼性の高い分子的方法を提供します。さらに、この属のほとんどまたはすべてのメンバーに特異的な15の固有の保存されたシグネチャータンパク質(CSP)が特定されました。
系統発生
ミコリシバクターの系統発生は全ゲノム解析に基づいている。[1] [a]
注記
- ^ Mycolicibacter paraterraeと「Mycolicibacter virginiensis」はこの系統樹には含まれません。
参考文献
- ^ abcdefg Gupta, Radhey S.; Lo, Brian; Son, Jeen (2018-02-13). 「系統ゲノム学と比較ゲノム研究は、Mycobacterium 属を修正された Mycobacterium 属と 4 つの新規属に分割することを強力に支持する」. Frontiers in Microbiology . 9:67 . doi : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN 1664-302X. PMC 5819568. PMID 29497402 .
- ^ Euzéby JP, Parte AC. 「Mycolicibacter」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2022年6月26日閲覧。
- ^ トルトリ、エンリコ;ブラウン・エリオット、バーバラ・A.チャーマーズ、ジェームス D.シリロ、ダニエラ M.デイリー、チャールズ L.エムラー、ステファン。フロート、R. アンドレス。ガルシア、マリア J.ホーフスルート、ワウター。コ・ウォンジョン。ランゲ、クリストフ (2019-07-01)。 「同じ肉、異なるグレービーソース: マイコバクテリアの新しい名前は無視してください。」ヨーロッパ呼吸器ジャーナル。54 (1)。土井: 10.1183/13993003.00795-2019。ISSN 0903-1936。PMID 31296783。S2CID 195893005 。
- ^ 山田裕之;近松絹代。青野 明夫;村田和義;宮崎直之;香山洋子バット、アプールヴァ。藤原長俊;前田真治;御手洗 聡 (2020) 「新規 5 属の種の基本的な細胞形態をクライオ TEM で調べたところ、マイコバクテリア科の新しい分類と強い相関がある。」微生物学のフロンティア。11 : 562395.土井: 10.3389/fmicb.2020.562395。ISSN 1664-302X。PMC 7701246。PMID 33304323。
