マイコバクテロイデス

マイコバクテロイデス
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	放線菌類
クラス：	放線菌
注文：	結核菌
家族：	マイコバクテリア科
属:	マイコバクテロイデス; ・グプタら 2018
タイプ種
	マイコバクテロイデス・アブセッサス; (Moore と Frerichs 1953) Gupta et al. 2018年
種
	M. abscessus (Moore and Frerichs 1953) Gupta et al. 2018年; M. chelonae (Bergey et al. 1923) Gupta et al. 1923 2018年; M. フランクリン (Nogueira et al. 2015) Gupta et al. 2018年; M. イムノジェナム (ウィルソンら 2001) グプタら 2018; M. salmoniphilum (Whipps et al. 2007) Gupta et al. 2018; M. saopaulense (Nogueira et al. 2015) Gupta et al. 2018;
同義語
	M. chelonae – M. abscessusグループ (MCAG); マイコバクテリウム・ケロナエ–アブセッサス複合体 (MCAC);

マイコバクテロイデスは、マイコバクテリア目マイコバクテリア科に属するグラム陽性桿菌の属である。^[1]

2018年にグプタらは、保存されたゲノム配列、比較ゲノム解析、平均アミノ酸同一性値に基づいて構築されたさまざまな系統樹の証拠に基づいて、マイコバクテロイデス属をより大規模な属であるマイコバクテリウムから区別しました。[ 1 ]この^属に加えて、この研究ではマイコバクテリウムを合計5つの異なる属に分割することを提案しましたが、科学界の一部から抵抗がありました。抵抗の理由は、マイコバクテリウムには臨床的に関連する種がいくつか含まれており、名前の変更は臨床医や他の研究者の間で混乱を引き起こす可能性があるというものでした。^[4]

2020年に山田らは、細胞径、細胞長、細胞周囲長、細胞円形度、アスペクト比など、新属の基本的な形態学的特性を分析し、5つの属の間に有意な差があることを判定し、新しい分類を支持した。^[5]

マイコバクテロイデスという名前は、ラテン語の名詞Mycobacterium（細菌の属を指す）とラテン語の接尾辞「-oides 」（「似ている」と訳される）に由来しています。この名前は、 Mycobacteriumに似た属を指します。^[1]

生化学的特性と分子シグネチャー

Mycobacteroides属は急速に増殖する細菌で、7 日以内にコロニーを形成します。この属の特徴には、硝酸還元酵素が陰性で、鉄の吸収が悪く、ポリミキシン B に耐性があることなどが挙げられます。最適な生育温度は 30 °C ですが、35 °C でも増殖することがあります。また、3 日間のアリルスルファターゼ試験で陽性の結果を示します。Mycobacteroides 属のゲノムサイズは4.5 ～ 5.6 Mbp で、G+C 含有量は 63.9 ～ 64.8 mol% です。一部の種は病原性があり、肺、皮膚、軟組織の感染症に関与することが実証されています。さらに、一部の種はいくつかの抗菌薬に耐性があります。

この属に特有に存在する27 個の保存されたシグネチャーインデル(CSI) が、次のようなタンパク質で特定されました: DEAD/DEAH ボックスヘリカーゼ、アニオントランスポーター、膜タンパク質、ニコチン酸ヌクレオチドアデニル基転移酵素、CoA エステルリアーゼ、ウラシルホスホリボシルトランスフェラーゼ、L-ヒスチジン N(α)-メチルトランスフェラーゼ、DUF58 ドメイン含有タンパク質、NADH-キノン酸化還元酵素サブユニット G、ATP 依存性ヘリカーゼ、tRNA (シチジン (34)-2′- O )-メチルトランスフェラーゼ、グルタミン-フルクトース-6-リン酸トランスアミナーゼ (異性化)、エラーを起こしやすい DNA ポリメラーゼ、および2-アミノ-4-ヒドロキシ-6-ヒドロキシメチルジヒドロプテリジンジホスホキナーゼ。^{[1]これらの分子シグネチャーは、}Mycobacteroides属のゲノム配列の解析を通じて特定され、この属をMycobacteriaceae科内の理論上の他の属や他のすべての細菌と区別するための信頼性の高い分子的方法を提供します。さらに、この属には24の固有の保存されたシグネチャータンパク質（CSP）が特定されました。^[1]

全ゲノム配列解析は、この属の種を互いに区別する最良の方法です。^[6]

系統発生

マイコバクテロイデスの系統発生は全ゲノム解析に基づいています。^[1]

参考文献

^ abcdefg Gupta, Radhey S.; Lo, Brian; Son, Jeen (2018-02-13). 「系統ゲノム学と比較ゲノム研究は、Mycobacterium 属を修正された Mycobacterium 属と 4 つの新規属に分割することを強力に支持する」. Frontiers in Microbiology . 9:67 . doi : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN 1664-302X. PMC 5819568. PMID 29497402 .
^ Euzéby JP, Parte AC. 「Mycobacteroides」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2022年6月25日閲覧。
^ Richardson, ET; Samson, D.; Banaei, N. (2009年5月). 「マルチプレックスリアルタイムPCRによる結核菌および非結核性抗酸菌の迅速同定」J. Clin. Microbiol . 47 (5): 1497–502. doi :10.1128/JCM.01868-08. PMC 2681835. PMID 19297596 .
^ トルトリ、エンリコ;ブラウン・エリオット、バーバラ・A.チャーマーズ、ジェームス D.シリロ、ダニエラ M.デイリー、チャールズ L.エムラー、ステファン。フロート、R. アンドレス。ガルシア、マリア J.ホーフスルート、ワウター。コ・ウォンジョン。ランゲ、クリストフ (2019-07-01)。「同じ肉、異なるグレービーソース: マイコバクテリアの新しい名前は無視してください。」ヨーロッパ呼吸器ジャーナル。54 (1)。土井: 10.1183/13993003.00795-2019。ISSN 0903-1936。PMID 31296783。S2CID 195893005 。
^ 山田裕之;近松絹代。青野明夫;村田和義；宮崎直之；香山洋子バット、アプールヴァ。藤原長俊；前田真治；御手洗聡 (2020) 「新規 5 属の種の基本的な細胞形態をクライオ TEM で調べたところ、マイコバクテリア科の新しい分類と強い相関がある。」微生物学のフロンティア。11 : 562395.土井: 10.3389/fmicb.2020.562395。ISSN 1664-302X。PMC 7701246。PMID 33304323。
^ ノゲイラ CL、デアルメイダ LGP、メネンデス MC、ガルシア MJ、ディジャンピエトリ LA、キマラ E、クノッカルト M、パロミノ JC、ポルタルス F、マーティン A、ヴァンダム P、レアン SC。（2017年）。「比較ゲノミクスによるマイコバクテリウム・ケロナエ様株の特徴付け」。フロント微生物。8 : 789.土井: 10.3389/fmicb.2017.00789。PMC 5420552。PMID 28533767。

[:0-1] Gupta, Radhey S.; Lo, Brian; Son, Jeen (2018-02-13). 「系統ゲノム学と比較ゲノム研究は、Mycobacterium 属を修正された Mycobacterium 属と 4 つの新規属に分割することを強力に支持する」. Frontiers in Microbiology . 9:67 . doi : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN 1664-302X. PMC 5819568. PMID 29497402 .

[LPSN-2] Euzéby JP, Parte AC. 「Mycobacteroides」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2022年6月25日閲覧。

[3] Richardson, ET; Samson, D.; Banaei, N. (2009年5月). 「マルチプレックスリアルタイムPCRによる結核菌および非結核性抗酸菌の迅速同定」J. Clin. Microbiol . 47 (5): 1497–502. doi :10.1128/JCM.01868-08. PMC 2681835. PMID 19297596 .

[4] トルトリ、エンリコ;ブラウン・エリオット、バーバラ・A.チャーマーズ、ジェームス D.シリロ、ダニエラ M.デイリー、チャールズ L.エムラー、ステファン。フロート、R. アンドレス。ガルシア、マリア J.ホーフスルート、ワウター。コ・ウォンジョン。ランゲ、クリストフ (2019-07-01)。「同じ肉、異なるグレービーソース: マイコバクテリアの新しい名前は無視してください。」ヨーロッパ呼吸器ジャーナル。54 (1)。土井: 10.1183/13993003.00795-2019。ISSN 0903-1936。PMID 31296783。S2CID 195893005 。

[5] 山田裕之;近松絹代。青野明夫;村田和義；宮崎直之；香山洋子バット、アプールヴァ。藤原長俊；前田真治；御手洗聡 (2020) 「新規 5 属の種の基本的な細胞形態をクライオ TEM で調べたところ、マイコバクテリア科の新しい分類と強い相関がある。」微生物学のフロンティア。11 : 562395.土井: 10.3389/fmicb.2020.562395。ISSN 1664-302X。PMC 7701246。PMID 33304323。

[6] ノゲイラ CL、デアルメイダ LGP、メネンデス MC、ガルシア MJ、ディジャンピエトリ LA、キマラ E、クノッカルト M、パロミノ JC、ポルタルス F、マーティン A、ヴァンダム P、レアン SC。（2017年）。「比較ゲノミクスによるマイコバクテリウム・ケロナエ様株の特徴付け」。フロント微生物。8 : 789.土井: 10.3389/fmicb.2017.00789。PMC 5420552。PMID 28533767。