マザー

mothurは、バイオインフォマティクスデータ処理用のオープンソースソフトウェアパッケージです。^[7]このパッケージは、培養されていない微生物のDNAの分析に頻繁に使用されます。mothurは、454パイロシーケンシング、イルミナHiSeqおよびMiSeq、サンガー、PacBio、IonTorrentなど、いくつかのDNAシーケンシング方法から生成されたデータを処理できます。 ^[8] mothurの最初のリリースは2009年に行われました。^{[9] mothurのリリースは、}Applied and Environmental Microbiology誌の出版物で発表されました。^[1] 2022年10月26日の時点で、mothurをリリースした論文は約15,000件の他の研究で引用されています。

外部リンク

^ abcde Schloss, PD; Westcott, SL; Ryabin, T.; Hall, JR; Hartmann, M.; Hollister, EB; Lesniewski, RA; Oakley, BB; Parks, DH; Robinson, CJ; Sahl, JW; Stres, B.; Thallinger, GG; Van Horn, DJ; Weber, CF (2009). 「mothur の紹介: 微生物群集を記述および比較するためのオープンソースでプラットフォームに依存しないコミュニティサポート型ソフトウェア」.応用環境微生物学. 75 (23). アメリカ微生物学会: 7537–7541. doi :10.1128/aem.01541-09. ISSN 0099-2240. PMC 2786419 . PMID 19801464.
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^ “mothur/mothur”. GitHub . 2019年11月27日閲覧。
^ 「インストール」。mothur wiki 。 2019年11月27日閲覧。
^ “バージョン 1.48.0”. GitHub . 2022年9月16日閲覧。
^ “License.md”. GitHub . 2019年11月27日閲覧。
^ Ricke, SC; Atungulu, GG; Rainwater, C.; Park, SH (2017). 食品および飼料安全システムと分析。エルゼビアサイエンス。p. 359。ISBN 978-0-12-849888-0. 2018年6月13日閲覧。
^ Orcutt, BN; Sylvan, JB; Santelli, CM (2017). 海洋地殻の地質微生物学における最近の進歩。Frontiers Research Topics。p. 264。ISBN 978-2-88945-283-5. 2018年6月13日閲覧。
^ カーター、DO; トンバーリン、JK; ベンボウ、ME; メトカーフ、JL (2017)。法医学微生物学。法医学の焦点。ワイリー。p. 180。ISBN 978-1-119-06257-8. 2018年6月13日閲覧。