モルイド

フォックスチェイスがんセンターのダンブラックグループによって開発されたMolIDEは、タンパク質構造の比較モデリングのためのオープンソースの クロスプラットフォームプログラムです。MolIDEは、既知の相同構造に基づいてタンパク質構造を予測する一般的なタスクに対するグラフィカルユーザーインターフェイスとして機能します。モデリングに関連する最も頻繁に使用される手順、つまり二次構造予測、複数ラウンドのpsiblastアライメント、アライメント編集支援（テンプレートビューアと二次構造予測の統合）、側鎖置換、ループ構築を実装しています。

• Wang, Qiang; Canutescu, Adrian A; Dunbrack, Roland L (2008). 「SCWRL と MolIDE: 側鎖の立体配座予測と相同性モデリングのためのコンピュータ プログラム」. Nature Protocols . 3 (12): 1832–47. doi :10.1038/nprot.2008.184. PMC 2682191.  PMID 18989261  .
• Canutescu, AA; Dunbrack, RL (2005). 「MollDE: クリックするだけで使える相同性モデリングフレームワーク」.バイオインフォマティクス. 21 (12): 2914–6. doi : 10.1093/bioinformatics/bti438 . PMID  15845657.

• ダンブラックグループ