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ミルトロンは、宿主遺伝子をコードするmRNAのイントロンに位置するマイクロRNAの一種です。[1] [2]これらの短いヘアピンイントロンは、非定型のmiRNA生合成経路によって形成されます。[3] [4]ミルトロンはスプライスアウトされたイントロンから発生し、遺伝子発現に機能することが知られています。
ミルトロンは、最初にキイロショウジョウバエと線虫Caenorhabditis elegansで同定されました。[5] [6]現在までに同定されたミルトロンの数は、キイロショウジョウバエ、線虫、哺乳類でそれぞれ14、9、19です。[7]ミルトロンは、マイクロRNA生合成の代替前駆体です。短いヘアピンイントロンは、スプライシングを利用して、標準的な動物マイクロRNAの生成に不可欠なDROSHA切断を回避します。ミルトロンは、スプライスされたイントロンから発生し、古典的なマイクロRNA（miR）のように機能し、mRNAの不安定化、翻訳の阻害、または標的mRNAの切断によって遺伝子発現を制御することが知られています。[8]
現在、植物にミルトロンが存在することを裏付けるさらなる証拠が出てきています。植物のすべてのmiRNAは、プリmiRNAから連続的にDCL1切断されてプレmiRNA（またはmiRNA前駆体）を生成することから生じますが、ミルトロンはDCL1切断を回避し、miRNA成熟経路にプレmiRNAとして入り込みます。[7]
ミルトロンは標準的なmiRNA配列とは異なり、データ分析における機械学習手法で区別することができます。[9]
参考文献
- ^ Ruby, JG; Jan, CH; Bartel, DP (2007 年 7 月 5 日). 「Drosha 処理を回避するイントロンマイクロ RNA 前駆体」. Nature . 448 (7149): 83–6. Bibcode :2007Natur.448...83R. doi :10.1038/nature05983. PMC 2475599. PMID 17589500 .
- ^ Wen, Jiayu; Ladewig, Erik; Shenker, Sol; Mohammed, Jaaved; Lai, Eric C. (2015). 「約1,000個の哺乳類ミルトロンの分析によりダイサー基質の新しい特徴が明らかに」. PLOS Computational Biology . 11 (9): e1004441. Bibcode :2015PLSCB..11E4441W. doi : 10.1371/journal.pcbi.1004441 . PMC 4556696. PMID 26325366 .
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- ^ ダ・フォンセカ、ブルーノ・エンリケ・リベイロ;ドミンゲス、ダグラス・シルバ。パショール、アレクサンドル・ロッシ（2019-10-01）。 「mirtronDB: mirtron 知識ベース」。バイオインフォマティクス。35 (19): 3873–3874。土井：10.1093/バイオインフォマティクス/btz153。ISSN 1367-4803。PMC 6761972。PMID 30874795。
- ^ Ruby, JG; Jan, CH; Bartel, DP (2007 年 7 月 5 日). 「Drosha 処理を回避するイントロンマイクロ RNA 前駆体」. Nature . 448 (7149): 83–6. Bibcode :2007Natur.448...83R. doi :10.1038/nature05983. PMC 2475599. PMID 17589500 .
- ^ Jan, CH; Ruby, JG; Friedman, R; Bartel, DP (2011年1月6日). 「Caenorhabditis elegans 3′UTRの形成、制御、進化」(PDF) . Nature . 469 (7328): 97–101. Bibcode :2011Natur.469...97J. doi :10.1038/nature09616. PMC 3057491. PMID 21085120 .
- ^ ab Zhu, Q.-H.; Spriggs, A.; Matthew, L.; Fan, L.; Kennedy, G.; Gubler, F.; Helliwell, C. (2008 年 7 月 30 日). 「発育中の米粒における多様なマイクロ RNA とマイクロ RNA 様小分子 RNA」.ゲノム研究. 18 (9): 1456–1465. doi :10.1101/gr.075572.107. PMC 2527712. PMID 18687877 .
- ^ "mirtron". mirtron.gene-quantification.info . 2022年12月10日閲覧。
- ^ ロールバッハ、グジェゴシュ;アンノルド、オルギエルド。コノプカ、ボグミル M. (2018)。 「データ探索と機械学習手法を使用してミルトロンを標準 miRNA から区別する」。科学的報告書。8 (1): 7560。ビブコード:2018NatSR...8.7560R。土井：10.1038/s41598-018-25578-3。PMC 5953923。PMID 29765080。