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| メタプラノコッカス | |
|---|---|
科学的分類 
| |
| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | バシロタ |
| クラス： | バチルス |
| 注文： | ナデシコ目 |
| 家族： | ナデシコ科 |
| 属: | メタプラノコッカス グプタとパテル 2020 |
| 種 | |
LPSN 2021に基づく | |
メタプラノコッカスは、ナデシコ目ナデシコ科に属するグラム陽性またはグラム可変性の球菌または短桿菌の属である。[1]この属のタイプ種はMetaplanococcus flavidusである。[2]
Metaplanococcus属は、以前は Planococcus 属に属していた種である。Planococcus属の種と分岐する代わりに、本種と無名のPlanomicrobium属は、保存されたゲノム配列に基づいて構築されたさまざまな系統樹において単系統の分岐を形成し、系統学的関連性を示した。[1] Caryophanaceae科には、このような分岐異常が多く含まれていたが、これは分類方法として 16S rRNA 配列に依存していたことが一因であり、この配列は解像度が低く、使用するアルゴリズムによって結果が異なることが知られている。[3] 2020 年、比較ゲノム研究によりこの科が修正され、 Metaplanococcus 属を含む 3 つの新しい属が確立された。[1]
Metaplanococcusという名前は、ギリシャ語の形容詞meta（ 「に加えて」と翻訳される）と、属名を指すラテン語Planococcusに由来している。これらを合わせると、 MetaplanococcusはPlanococcus以外の属と翻訳できる。[1]
生化学的特性と分子シグネチャー[1]
この属の生物は単一の極性鞭毛によって運動する。
ゲノム解析により、この属に特有に存在する17個の保存されたシグネチャーインデル（CSI）が以下のタンパク質として特定されました：ABCトランスポーター基質結合タンパク質、メチオニン-tRNAリガーゼ、MetQ/NlpAファミリーABCトランスポーター基質結合タンパク質、ABCトランスポーター透過酵素、胞子プロテアーゼYyaC、N-アセチル-α-D-グルコサミニル-5′L-リンゴ酸シンターゼBshA、オロチジン-5-リン酸脱炭酸酵素、およびホスホ-N-アセチルムラモイル-ペンタペプチド-トランスフェラーゼ。[1]これらのCSIは、 Metaplanococcus属をCaryophanaceae科の他の属および他のすべての細菌と区別するための信頼性の高い分子的手段を提供します。
分類
2021年現在、メタプラノコッカス属には、有効な名前が公表されている種が1種含まれています。 [2]この属は、科内の分類学的関係を調べた研究において、単系統群であり、ナデシコ科の他の種とは系統学的に無関係であると特定されました。[1]
参考文献
- ^ abcdefg Gupta, Radhey S.; Patel, Sudip (2020-01-14). 「系統ゲノム解析と高度に特異的な分子シグネチャーに基づく Caryophanaceae 科 (Planococcaceae) とそのさまざまな属 (3 つの新規属を含む) の確実な区分」。Frontiers in Microbiology 。10 : 2821。doi : 10.3389 / fmicb.2019.02821。ISSN 1664-302X。PMC 6971209。PMID 32010063。
- ^ ab “Genus: Metaplanococcus”. lpsn.dsmz.de . 2021年6月5日閲覧。
- ^ Ludwig, Wolfgang; Schleifer, Karl‐Heinz; Whitman, William B. (2015-09-14). 「Planococcaceae」. Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria : 1. doi :10.1002/9781118960608.fbm00116. ISBN 9781118960608。