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生化学において、メタロームとは細胞区画内の金属 イオンの分布のことである。この用語はプロテオームとの類似性から造られたもので、[1]メタロミクスはメタロームの研究であり、「細胞または組織型内の金属および半金属種の全体の包括的な分析」である。[2]したがって、金属は通常は代謝物とは見なされないが、メタロミクスはメタボロミクスの分野と見なすことができる[要出典]。
「メタロム」の別の定義としては、金属タンパク質またはその他の金属含有生体分子、およびそのような生体分子の研究としての「メタロミクス」がある。[3]
メタロインタラクトーム
メタロームの研究では、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボロームがメタローム全体を構成します。メタロームの研究は、メタロインタラクトームに到達するために行われます。
メタロトランスクリプトーム
メタロトランスクリプトーム[4]は、それぞれ生物学的または環境的に関連する濃度の必須金属または毒性金属が存在する場合のトランスクリプトーム全体のマップとして定義できます。メタロメタボロームは、任意の時点で細胞内の小さな代謝物の完全なプールを構成します。これにより、メタロインタラクトーム全体が生成され、これに関する知識は、毒性と創薬を扱う比較メタロミクスにおいて重要です。[4]
参照
参考文献
- ^ ウィリアムズ 2001
- ^ シュプナール 2005
- ^ 原口 2004
- ^ ab シャンケル、ジャナギラマン、ヴェンカテシュワルル 2009
出典
- Banci, Lucia; Bertini, Ivano (2013)。「第 1 章 メタロミクスと細胞: いくつかの定義と一般的なコメント」。Banci, Lucia (編)。メタロミクスと細胞。生命科学における金属イオン。第 12 巻。Springer。pp. 1–13。doi : 10.1007 /978-94-007-5561-1_1。ISBN 978-94-007-5560-4. PMID 23595668。電子書籍ISBN 978-94-007-5561-1 ISSN 1559-0836 電子版ISSN 1868-0402
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- Wackett, LP; Dodge, AG; Ellis, LBM (2004). 「微生物ゲノミクスと周期表」.応用環境微生物学. 70 (2): 647–655. doi :10.1128/AEM.70.2.647-655.2004. PMC 348800. PMID 14766537 .
- Williams, RJP (2001). 「細胞による元素の化学的選択」.配位化学レビュー. 216–217: 583–595. doi :10.1016/s0010-8545(00)00398-2.