リラ・カリ

リラ・カリ
リラ・カリ
市民権	ルーマニア語、カナダ語
母校	ブカレスト大学、トゥルク大学
知られている	バイオコンピューティング、DNAコンピューティング
	科学者としてのキャリア
フィールド	コンピュータサイエンス
学術アドバイザー	アルト・サロマ
Webサイト	https://cs.uwaterloo.ca/~lila/

Lila Kari (旧姓Sântean ) は、ルーマニアおよびカナダ出身のコンピューター科学者であり、カナダのウォータールー大学David R. Cheriton School of Computer Scienceの教授です。

バイオグラフィー

カリ教授は1987年にブカレスト大学でゲオルゲ・パウンに師事して修士号を取得し、その後大学院研究のためにフィンランドのトゥルク大学に移り、1991年にアルト・サロマーの指導の下で博士号を取得した。^[1]^{[2] 1993年に}ウエスタンオンタリオ大学に客員教授として着任し、1996年には終身在職権を持つ教員として採用された。^[2]^{[3] 2017年に}ウォータールー大学のコンピューターサイエンスの教授および大学研究委員長に就任した。

研究

カリの学位論文研究は形式言語理論でした。1990年代半ば、サイエンス誌のレナード・エイドルマンの記事に触発され、彼女は興味をDNAコンピューティングに移しました。^{[4]彼女はローラ・ランドウェーバーとともに、}繊毛虫におけるDNA処理の計算能力の研究を開始して探求し、^[5]彼女の専門知識を使用して、これらの生物における遺伝子組み換えによって実行されるDNA操作がチューリング完全であることを示しました。^{[3]その10年間で、彼女はまた、}自己組織化における非決定性や決定不能性など、DNA生体分子に関連する理論的問題も研究しました。^[6] 2000年代初頭から、彼女はゲノムシグネチャと生物多様性情報学のためのアライメントフリー手法の研究に注力してきました。彼女の手法は、DNAゲノム配列のカオスゲーム表現などのさまざまな理論的概念や、教師ありおよび教師なし機械学習などの計算ツールを使用して、異なる種の生物を識別および分類します。^[7]^{[8]彼女の研究の顕著な応用は、微生物の}極限環境生物のゲノムシグネチャの研究であり、彼女と彼女のチームは、分類情報に加えて環境情報もゲノムシグネチャに存在する可能性があることを示唆する証拠を発見しました。^[9]

受賞と栄誉

カリは1991年にフィンランド数学博士論文部門の最優秀賞であるロルフ・ネヴァンリンナ博士論文賞を受賞した。^[10] ^[11] 2002年から2011年まで、彼女はバイオコンピューティングのカナダ研究員を務めた。^[12]

参考文献

^ 数学系譜プロジェクトのリラ・カリ
^ ab "Biography", Journal of Universal Computer Science、2020年7月22日時点のオリジナルよりアーカイブ
^ ab 「バイオコンピューティング研究者がバック賞受賞」、ウェスタンニュース、ウェスタンオンタリオ大学、2002年3月21日。
^ 「ナノバイオテクノロジーのキャリア：数学者の目を通して」、サイエンスキャリア、2001年2月2日、2011年8月21日時点のオリジナルよりアーカイブ
^ Landweber, Laura; Kari, Lila (1999)、「セルラーコンピューティングの進化：計算問題に対する自然の解決策」、Biosystems、52 (1–3): 3–13、CiteSeerX 10.1.1.297.3259、doi :10.1016/s0303-2647(99)00027-1、PMID 10636025 。
^ Adleman, Leonard; Kari, Jarkko; Kari, Lila; Reishus, Dustin; Sosik, Petr (2009)、「無限リボン問題の決定不可能性: 自己組織化による計算への影響」、SIAM J. Comput.、38 (6): 2356–2381、CiteSeerX 10.1.1.158.2098、doi :10.1137/080723971 。
^ カリ、リラ;ヒル、キャスリーン。サイエム、アブ。カラミカリス、ラリス。ブライアンズ、ナサニエル。デイビス、ケイトリン。 Dattani、Nikesh (2015)、「ゲノム署名の空間マッピング」、PLOS ONE、10 (5): e0119815、arXiv : 1406.4105、Bibcode :2015PLoSO..1019815K、doi : 10.1371/journal.pone.0119815、PMC 4441465、PMID 26000734 。
^ Karamichalis, Rallis; Kari, Lila; Konstantinidis, Stavros; Kopecki, Steffen (2015)、「グラフィックゲノムシグネチャのゲノム間およびゲノム内変異の調査」、BMC Bioinformatics、16 : 246、arXiv : 1503.00162、Bibcode :2015arXiv150300162K、doi : 10.1186/s12859-015-0655-4、PMC 4527362、PMID 26249837 。
^ Arias, PM, Butler, J., Randhawa, GS et al. 環境と分類が原核生物極限環境細菌のゲノム特性を形作る。Sci Rep 13, 16105 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-42518-y
^ 「ロルフ・ネヴァンリンナ博士論文賞」。2007年6月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年2月22日閲覧。
^ ハライネン、アンナ＝リーサ (1992 年 12 月)、「Tytto joka haluaa kaiken」(PDF)、Kodin Kuvalehti (フィンランド語): 22–24
^ 「カナダ研究委員長：リラ・カリ」。2014年5月8日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2012年2月22日閲覧。

外部リンク

ウォータールー大学のホームページ
Google Scholarにインデックスされた Lila Kari の出版物

[1] 数学系譜プロジェクトのリラ・カリ

[jucs-2] "Biography", Journal of Universal Computer Science、2020年7月22日時点のオリジナルよりアーカイブ

[bucke-3] 「バイオコンピューティング研究者がバック賞受賞」、ウェスタンニュース、ウェスタンオンタリオ大学、2002年3月21日。

[sm1-4] 「ナノバイオテクノロジーのキャリア：数学者の目を通して」、サイエンスキャリア、2001年2月2日、2011年8月21日時点のオリジナルよりアーカイブ

[5] Landweber, Laura; Kari, Lila (1999)、「セルラーコンピューティングの進化：計算問題に対する自然の解決策」、Biosystems、52 (1–3): 3–13、CiteSeerX 10.1.1.297.3259、doi :10.1016/s0303-2647(99)00027-1、PMID 10636025 。

[6] Adleman, Leonard; Kari, Jarkko; Kari, Lila; Reishus, Dustin; Sosik, Petr (2009)、「無限リボン問題の決定不可能性: 自己組織化による計算への影響」、SIAM J. Comput.、38 (6): 2356–2381、CiteSeerX 10.1.1.158.2098、doi :10.1137/080723971 。

[7] カリ、リラ;ヒル、キャスリーン。サイエム、アブ。カラミカリス、ラリス。ブライアンズ、ナサニエル。デイビス、ケイトリン。 Dattani、Nikesh (2015)、「ゲノム署名の空間マッピング」、PLOS ONE、10 (5): e0119815、arXiv : 1406.4105、Bibcode :2015PLoSO..1019815K、doi : 10.1371/journal.pone.0119815、PMC 4441465、PMID 26000734 。

[8] Karamichalis, Rallis; Kari, Lila; Konstantinidis, Stavros; Kopecki, Steffen (2015)、「グラフィックゲノムシグネチャのゲノム間およびゲノム内変異の調査」、BMC Bioinformatics、16 : 246、arXiv : 1503.00162、Bibcode :2015arXiv150300162K、doi : 10.1186/s12859-015-0655-4、PMC 4527362、PMID 26249837 。

[9] Arias, PM, Butler, J., Randhawa, GS et al. 環境と分類が原核生物極限環境細菌のゲノム特性を形作る。Sci Rep 13, 16105 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-42518-y

[10] 「ロルフ・ネヴァンリンナ博士論文賞」。2007年6月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年2月22日閲覧。

[11] ハライネン、アンナ＝リーサ (1992 年 12 月)、「Tytto joka haluaa kaiken」(PDF)、Kodin Kuvalehti (フィンランド語): 22–24

[12] 「カナダ研究委員長：リラ・カリ」。2014年5月8日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2012年2月22日閲覧。