リグD

検索する
構造	スイスモデル
ドメイン	インタープロ

多機能非相同末端結合タンパク質LigD
多機能非相同末端結合タンパク質LigD
識別子
生物	ミコリシバクテリウム・スメグマティス ATCC 700084
シンボル	ライトD
ユニプロット	A0R3R7
構造
検索する
構造	スイスモデル
ドメイン	インタープロ

LigD は、細菌の非相同末端結合(NHEJ) DNA 修復システムで見られる多機能リガーゼ/ポリメラーゼ/ヌクレアーゼ(3'-ホスホエステラーゼ)です。^[1] LigD は、複数の酵素を使用してその役割を果たす NHEJ のより複雑な真核生物システムよりもエラーが発生しやすいです。^[2]このポリメラーゼは rNTP (RNA ヌクレオチド) を優先的に使用するため、休眠細胞では有利である可能性があります。^[3]

LigD の実際の構造は可変です。

Bacillus subtilisの LigD ホモログにはヌクレアーゼドメインがありません。
リガーゼドメインを人工的に除去したLigDは、リガーゼとして機能する別のLigCを使用することで（忠実度は低下するが）その機能を果たすことができる。^[2]
古細菌メタノセラ・パルディコラのLigDホモログは、オペロンを共有する3つの単一ドメインタンパク質に分割されています。^[4]

参考文献

^ Della M, Palmbos PL, Tseng HM, et al. (2004年10月). 「Mycobacterial Kuとリガーゼタンパク質は2成分NHEJ修復機構を構成する」. Science . 306 (5696): 683– 5. Bibcode :2004Sci...306..683D. doi :10.1126/science.1099824. PMID 15499016. S2CID 38823696.
^ ab Gong C、Bongiorno P、Martins A、et al. (2005 年 4 月)。「マイコバクテリアの非相同末端結合のメカニズム: Ku、リガーゼ D、リガーゼ C によって駆動される低忠実度修復システム」。Nat . Struct. Mol. Biol . 12 (4): 304– 12. doi :10.1038/nsmb915. PMID 15778718. S2CID 6879518。
^ Pitcher RS、Green AJ、Brzostek A、Korycka-Machala M、Dziadek J、Doherty AJ (2007 年 9 月)。「NHEJ は静止期のマイコバクテリアを乾燥の有害な影響から保護する」( PDF )。DNA Repair (Amst.)。6 (9): 1271– 6。doi :10.1016/j.dnarep.2007.02.009。PMID 17360246 。
^ Bartlett, EJ; Brissett, NC; Doherty, AJ (2013 年 5 月 28 日)。「リボ核酸切断は、鎖置換された非相同末端結合中間体の修復に必要である」。米国科学アカデミー紀要。110 (22): E1984-91。Bibcode : 2013PNAS..110E1984B。doi : 10.1073 / pnas.1302616110。PMC 3670387。PMID 23671117 。

[pmid15499016-1] Della M, Palmbos PL, Tseng HM, et al. (2004年10月). 「Mycobacterial Kuとリガーゼタンパク質は2成分NHEJ修復機構を構成する」. Science . 306 (5696): 683– 5. Bibcode :2004Sci...306..683D. doi :10.1126/science.1099824. PMID 15499016. S2CID 38823696.

[pmid15778718-2] Gong C、Bongiorno P、Martins A、et al. (2005 年 4 月)。「マイコバクテリアの非相同末端結合のメカニズム: Ku、リガーゼ D、リガーゼ C によって駆動される低忠実度修復システム」。Nat . Struct. Mol. Biol . 12 (4): 304– 12. doi :10.1038/nsmb915. PMID 15778718. S2CID 6879518。

[pmid17360246-3] Pitcher RS、Green AJ、Brzostek A、Korycka-Machala M、Dziadek J、Doherty AJ (2007 年 9 月)。「NHEJ は静止期のマイコバクテリアを乾燥の有害な影響から保護する」( PDF )。DNA Repair (Amst.)。6 (9): 1271– 6。doi :10.1016/j.dnarep.2007.02.009。PMID 17360246 。

[4] Bartlett, EJ; Brissett, NC; Doherty, AJ (2013 年 5 月 28 日)。「リボ核酸切断は、鎖置換された非相同末端結合中間体の修復に必要である」。米国科学アカデミー紀要。110 (22): E1984-91。Bibcode : 2013PNAS..110E1984B。doi : 10.1073 / pnas.1302616110。PMC 3670387。PMID 23671117 。