LSID

ライフサイエンス識別子^{[1] [2]}は、Web 上の情報に名前を付けて検索する方法です。基本的に、LSID は一部のデータの一意の識別子であり、LSID プロトコルはデータを検索する標準的な方法 (およびそのデータを記述する標準的な方法) を指定します。LSID は、多くの出版社が使用するDOIに少し似ています。

LSID は、次の形式の Uniform Resource Name (URN) として表されます。

• urn:lsid:⟨Authority⟩:⟨Namespace⟩:⟨ObjectID⟩[:⟨Version⟩]

ただし、 lsid :名前空間はInternet Assigned Numbers Authority (IANA)に登録されていないため、厳密にはURNやURIではありません。^[3]

LSID は URL で解決できます。例: http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:CDC8D258-8F57-41DC-B560-247E17D3DC8C

LSIDはバイオインフォマティクスと生物多様性の両コミュニティで大きな関心を集めており、後者は引き続きグローバルカタログで種を識別する方法としてLSIDを使用しています。^{[4]しかし、最近では、} HTTP URIが同様の命名タスクを実行できる ことへの理解が深まるにつれて、 ^{[5] [6]} LSIDを識別子として使用することは、既存のURIスキームを再利用するWebアーキテクチャのベストプラクティスに違反しているとして批判されています。 [ ^{7 ] [8]} それでも、データとメタデータの明示的な分離、データ取得のための複数の場所を発見する方法の仕様、識別された物体のメタデータの複数の独立したソースを発見する機能は、LSIDとその解決仕様の重要な部分であり、HTTPのみのアプローチではうまく模倣されていません。

World Wide Web は、バイオインフォマティクスを含むほぼすべての科学的コラボレーションに不可欠な、グローバルに分散した通信フレームワークを提供します。しかし、いくつかの制限や不備が存在すると考えられていました。その 1 つは、ネットワーク上に広く分散している可能性のあるローカルに名前が付けられたオブジェクトをプログラムで識別できないことです。この認識された欠点は、バイオインフォマティクスでよく見られるように、共有ドメインの部分的な情報を提供する複数の知識ベースを統合する能力を制限することになります。ライフ サイエンス識別子 (LSID) と LSID 解決システム (LSRS) は、既存のインターネット技術の拡張に基づいて、次世代のセマンティック Webおよびセマンティック グリッドと一致する、この問題に対するシンプルで洗練されたソリューションを提供するために設計されました。しかし、最近、これらの認識された欠点のいくつかは HTTP URI に固有のものではなく、LSID が提供する機能の多く (すべてではありませんが) は、適切に作成された HTTP URI を使用して取得できることが指摘されています。^[5]

生物に対してはDOIシステムなどの代替識別子が提案されている。民間企業NamesforLife (N4L)は生物にDOIを適用するシステムを構築した。例えば、doi:10.1601/nm.3093は大腸菌のDOIであり、doi:10.1601/tx.3093は対応する分類群である。^[9]

• リソース記述フレームワーク
• マイクロアレイと遺伝子発現
• ズーバンク
• マイコバンク
• MIRIAM URI
• 国際ジオサンプル番号
• サイクランチ

• LSID解決プロジェクト
• テキサス大学オースティン校の LSID 割り当ておよび解決機関
• LSID に関する立場 - LSID の実装と展開に携わった人物からの考察