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アンダース・クロッグ | |
|---|---|
| 国籍 | デンマーク語 |
| 母校 | コペンハーゲン大学 |
| 職業 | 教授 |
| 知られている | 隠れマルコフモデル、ニューラルネットワーク |
| 受賞歴 | ISCBフェロー（2017） |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | バイオインフォマティクス |
| 機関 | コペンハーゲン大学 |
| Webサイト | people.binf.ku.dk/クロッグ |
アンダース・クロウはコペンハーゲン大学のバイオインフォマティクス研究者であり、[1]同大学のバイオインフォマティクスセンターを率いています。彼はバイオインフォマティクスにおける隠れマルコフモデルの使用に関する先駆的な研究（デイヴィッド・ハウスラーと共著）で知られており、[2] [3] [4]バイオインフォマティクスで広く使用されている教科書の共著者でもあります。[5]さらに、彼はニューラルネットワークに関する初期の教科書の1つも共著者としています。[6]彼の現在の研究対象は、プロモーター解析、[7] [8] [9]非コードRNA、[10] [11] [12]遺伝子予測[13] [14] [15]およびタンパク質構造予測です。[16] [17] [18] [19] [20]
2017年、クロウは国際計算生物学会（ISCB）のフェローに選出された。[21]
参照
参考文献
- ^ 「User:Krogh - BINF - Bioinformatics Centre」。2011年9月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。2011年4月14日閲覧。コペンハーゲン大学分子生物学部バイオインフォマティクスセンターのアンダース・クロウ教授
- ^ Krogh A, Brown M, Mian IS, Sjölander K, Haussler D (1994). 「計算生物学における隠れマルコフモデル。タンパク質モデリングへの応用」J. Mol. Biol . 235 (5): 1501–31. doi :10.1006/jmbi.1994.1104. PMID 8107089.
- ^ Krogh A、Mian IS、Haussler D (1994)。「大腸菌DNA内の遺伝子を見つける隠れマルコフモデル」。Nucleic Acids Res . 22 (22): 4768–78. doi :10.1093/nar/22.22.4768. PMC 308529 . PMID 7984429。
- ^ Sjölander K, Karplus K, Brown M, et al. (1996). 「ディリクレ混合物: 弱いが有意なタンパク質配列相同性の検出を改善するための方法」Comput. Appl. Biosci . 12 (4): 327–45. doi : 10.1093/bioinformatics/12.4.327 . PMID 8902360.
- ^ ダービン、リチャード・M. ;エディ、ショーン・R. ; クロウ、アンダース; ミッチソン、グレアム（1998）、生物学的配列分析：タンパク質と核酸の確率モデル（第1版）、ケンブリッジ、ニューヨーク：ケンブリッジ大学出版局、ISBN 0-521-62971-3、OCLC 593254083
- ^ 神経計算理論入門（サンタフェ研究所複雑性科学研究）。（1991）ジョン・A・ハーツ、リチャード・G・パーマー、アンダース・クロッグ、ウェストビュー・プレス
- ^ Marstrand TT、Frellsen J、Moltke I、et al. (2008). Copley R (ed.). 「Asap: 転写因子結合部位の過剰表現統計のためのフレームワーク」. PLOS ONE . 3 (2): e1623. Bibcode :2008PLoSO...3.1623M. doi : 10.1371/journal.pone.0001623 . PMC 2229843. PMID 18286180 .
- ^ Frith MC, Valen E, Krogh A, Hayashizaki Y, Carninci P, Sandelin A (2008). 「哺乳類ゲノムにおける転写開始のコード」Genome Res . 18 (1): 1–12. doi :10.1101/gr.6831208. PMC 2134772. PMID 18032727 .
- ^ Bryne JC、Valen E、Tang MH、他 (2008)。「JASPAR、転写因子結合プロファイルのオープンアクセスデータベース：2008年更新版の新しいコンテンツとツール」。Nucleic Acids Res . 36 (データベース号): D102–6。doi :10.1093/ nar /gkm955。PMC 2238834。PMID 18006571。
- ^ Lindow M、Jacobsen A、Nygaard S、Mang Y、Krogh A (2007)。「イントゲノムマッチングは、植物における miRNA を介した制御の大きな可能性を明らかにしました」。PLOS Comput. Biol . 3 (11): e238。Bibcode : 2007PLSCB ... 3..238L。doi : 10.1371 / journal.pcbi.0030238。PMC 2098865。PMID 18052543。
- ^ Lindgreen S、Gardner PP、 Krogh A (2007)。「MASTR: シミュレーテッドアニーリングを用いた非コードRNAの多重アラインメントと構造予測」バイオインフォマティクス。23 ( 24): 3304–11。CiteSeerX 10.1.1.563.7072。doi :10.1093/bioinformatics/btm525。PMID 18006551 。
- ^ Lindgreen S、Gardner PP、 Krogh A (2006)。「RNAアラインメントの共変動の測定：物理的リアリズムが情報測定を改善する」バイオインフォマティクス。22 （24）：2988–95。doi ：10.1093/bioinformatics/btl514。PMID 17038338 。
- ^ Munch K, Krogh A (2006). 「真核生物種のための遺伝子ファインダーの自動生成」BMC Bioinformatics . 7 : 263. doi : 10.1186/1471-2105-7-263 . PMC 1522026 . PMID 16712739.
- ^ Munch K、 Gardner PP、Arctander P、Krogh A (2006)。「ゲノムタイリングマイクロアレイから発現を決定するための隠れマルコフモデルアプローチ」 。BMC Bioinformatics。7 : 239。doi : 10.1186 / 1471-2105-7-239。PMC 1481622。PMID 16672042。
- ^ Nielsen P, Krogh A (2005). 「大規模原核生物遺伝子予測とゲノム注釈との比較」バイオインフォマティクス. 21 (24): 4322–9. doi : 10.1093/bioinformatics/bti701 . PMID 16249266.
- ^ Krogh A, Larsson B, von Heijne G, Sonnhammer EL (2001). 「隠れマルコフモデルによる膜貫通タンパク質トポロジーの予測：完全ゲノムへの応用」J Mol Biol . 305 (3): 567–580. doi :10.1006/jmbi.2000.4315. PMID 11152613.
- ^ Winther O, Krogh A (2004). 「コンピューターにタンパク質を折りたたむように教える」. Phys. Rev. E. 70 ( 3): 030903. arXiv : cond-mat/0309497 . Bibcode :2004PhRvE..70c0903W. doi :10.1103/PhysRevE.70.030903. PMID 15524499. S2CID 103560.
- ^ Won KJ、Hamelryck T、Prügel-Bennett A 、 Krogh A (2007)。「HMM構造を学習 するための進化的手法：タンパク質二次構造の予測」。BMC Bioinformatics。8 ： 357。doi ：10.1186 / 1471-2105-8-357。PMC 2072961。PMID 17888163。
- ^ Hamelryck T、Kent JT、Krogh A (2006)。「局所構造バイアスを用いた現実的なタンパク質構造のサンプリング」。PLOS Comput . Biol . 2 ( 9): e131。Bibcode : 2006PLSCB ... 2..131H。doi : 10.1371/journal.pcbi.0020131。PMC 1570370。PMID 17002495 。
- ^ Boomsma W, Mardia KV, Taylor CC, Ferkinghoff-Borg J, Krogh A, Hamelryck T (2008). 「タンパク質の局所構造の生成的確率モデル」. PNAS . 105 (26): 8932–8937. Bibcode :2008PNAS..105.8932B. doi : 10.1073/pnas.0801715105 . PMC 2440424. PMID 18579771 .
- ^ 「2017年2月13日：国際計算生物学会が2017年度ISCBフェローに7名を指名」www.iscb.org 。 2017年2月13日閲覧。
外部リンク
Scholia には Anders Krogh (Q4753847) のプロフィールがあります。
- コペンハーゲン大学のホームページ