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ジャン・マ | |
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| 馬坚 | |
| 市民権 | アメリカ合衆国 |
| 受賞歴 |
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| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | |
| 機関 |
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| 学術アドバイザー | デビッド・ハウスラー（ポスドク指導教員）、ウェッブ・ミラー（博士課程指導教員） |
| Webサイト | 翻訳: |
ジャン・マー（中国語：馬坚）は、アメリカのコンピュータ科学者、計算生物学者です。[1]彼は、カーネギーメロン大学コンピュータサイエンス学部のレイ・アンド・ステファニー・レーン計算生物学教授です。[2] [3] [4]彼は、レイ・アンド・ステファニー・レーン計算生物学部の教員です。
彼の研究室では、ヒトゲノム[5]と細胞構成の構造と機能、およびそれらが健康や病気に与える影響を研究するためのAI / ML手法を開発しています。博士課程とポスドク研修中に、祖先哺乳類ゲノムと進化の歴史を再構築するためのアルゴリズムを開発しました。 [6]彼の研究グループは最近、3Dゲノム構成、単一細胞エピゲノミクス、空間オミクス、複雑な分子相互作用のための一連の新しい機械学習ソリューションを開発しました。彼の研究室では、発見を促進し実験を導くことを目的として、遺伝子制御メカニズムと細胞成分間の複雑なつながりを明らかにするために、大規模な言語モデルも調査しています。
2011年にNSF CAREER賞を受賞。[7] 2020年にはコンピュータサイエンス分野でグッゲンハイムフェローシップ[8] [9] [10]を受賞。アメリカ科学振興協会[11]およびアメリカ医学生物工学研究所[12]のフェローに選出されている。
彼はNIH 4D Nucleome Centerを率いて、細胞核をより深く理解するための機械学習アルゴリズムを開発しています。[5] [13]彼はRECOMB 2024のプログラム委員長を務めました。 [14]彼はまた、 Chan Zuckerberg Biohub Chicago（CZ Biohub Chicago）[15]の科学諮問委員会とRECOMB運営委員会のメンバーでもあります。[16]
2024年に彼はCMUにAI駆動型生物医学研究センター（AI4BIO）を設立しました。これはコンピュータサイエンス学部とキャンパス全体でAIと生物医学の交差点におけるイノベーションの触媒となるでしょう。 [17] [18]
最近の出版物
- Chen V #、Yang M #、Cui W、Kim JS、Talwalkar A*、およびMa J*。計算生物学における解釈可能な機械学習の応用 - 落とし穴、推奨事項、および新しい開発の機会。Nature Methods、21(8):1454-1461、2024年。
- Xiong K #、 Zhang R #、および Ma J. scGHOST: 単一細胞 3D ゲノムサブコンパートメントの識別。Nature Methods、21(5):814-822、2024。
- Zhou T、Zhang R、Jia D、Doty RT、Munday AD、Gao D、Xin L、Abkowitz JL、Duan Z*、Ma J*。GAGE-seqは、単一細胞におけるマルチスケール3Dゲノム構成と遺伝子発現を同時にプロファイリングします。Nature Genetics、56(8):1701-1711、2024。
- Zhang Y、Boninsegna L、Yang M、Misteli T、Alber F、Ma J. マルチスケール3Dゲノム組織を解析するための計算手法。Nature Reviews Genetics、5(2):123-141、2024。
- Chidester B #、Zhou T #、Alam S、およびMa J. SPICEMIXは、細胞アイデンティティの統合的な単一細胞空間モデリングを可能にします。Nature Genetics、55(1):78-88、2023。[表紙記事]
- Zhang R #、 Zhou T #、 Ma J. Fast-Higashi による超高速かつ解釈可能な単一細胞 3D ゲノム解析。Cell Systems、13(10):P798-807.E6、2022 年。[表紙記事]
- Zhu X #、Zhang Y #、Wang Y、Tian D、Belmont AS、Swedlow JR、およびMa J. Nucleome Browser：4D Nucleomeのための統合型マルチモーダルデータナビゲーションプラットフォーム。Nature Methods、19（8）：911-913、2022年。
- Zhang R、Zhou T、Ma J. Higashiによるマルチスケールおよび統合的な単一細胞Hi-C解析。Nature Biotechnology、40:254–261、2022。
参考文献
- ^ 「Jian Ma - Google Scholar Citations」。scholar.google.com 。 2020年5月22日閲覧。
- ^ 「カーネギーメロン大学のJian Maウェブページ」。
- ^ カーネギーメロン大学。「Jian Ma - 計算生物学部 - コンピューターサイエンス学部 - カーネギーメロン大学」。cbd.cmu.edu 。 2021年6月18日閲覧。
- ^ 「SCSの教員が寄付教授職を受け取る」。カーネギーメロン大学コンピュータサイエンス学部。 2021年12月23日閲覧。
- ^ ab カーネギーメロン大学。「カーネギーメロン大学、細胞核の構造を研究する新センターを設置 - ニュース - カーネギーメロン大学」www.cmu.edu 。 2021年6月19日閲覧。
- ^ Pennisi, Elizabeth (2005-06-03). 「絶滅ゲノム構築中」. Science . 308 (5727): 1401–1402. doi :10.1126/science.308.5727.1401b. ISSN 0036-8075. PMID 15933177. S2CID 83068891.
- ^ 「Jian Maが大規模ゲノム研究でCAREER賞を受賞 | Carl R. Woeseゲノム生物学研究所」www.igb.illinois.edu 。 2020年5月22日閲覧。
- ^ 「ジョン・サイモン・グッゲンハイム財団 | ジャン・マー」2020年5月22日閲覧。
- ^ 「ジョン・サイモン・グッゲンハイム財団 | 2020年グッゲンハイム・フェローシップ受賞者発表」。2020年5月22日閲覧。
- ^ カーネギーメロン (2020-04-10). 「Jian Ma がグッゲンハイムフェローシップを獲得 - ニュース - カーネギーメロン大学」www.cmu.edu 。 2020年5月22日閲覧。
- ^ 「Jian Maが2022年度AAASフェローに選出」。カーネギーメロン大学コンピュータサイエンス学部。 2023年2月2日閲覧。
- ^ 「CompBio教授がAIMBEのフェローに選出」。カーネギーメロン大学コンピュータサイエンス学部。 2024年10月12日閲覧。
- ^ 「CMU、細胞核の3Dマップを構築するNIH研究センターのリーダーに指名」ピッツバーグ・ポスト・ガゼット。 2021年6月19日閲覧。
- ^ “RECOMB 2024 | HOME”. recomb.org . 2023年9月23日閲覧。
- ^ 「CZ Biohub Chicagoの人々」CZ Biohub Chicago . 2024年12月8日閲覧。
- ^ 「運営委員会」。RECOMBカンファレンスシリーズ。 2024年12月8日閲覧。
- ^ 「CMUがAI主導型生物医学研究センターを開設」。カーネギーメロン大学コンピュータサイエンス学部。 2024年10月12日閲覧。
- ^ 「CMU が AI 主導型生物医学研究センターを開設 - ニュース - カーネギーメロン大学」。カーネギーメロン大学。2024 年 10 月 8 日。2024年 10 月 13 日閲覧。
外部リンク
- Google Scholar にインデックスされた Jian Ma の出版物