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系統学において、情報部位とは、最大節約が系統樹の構築における最適基準である場合に使用される用語である。これは、その部位における形質状態の進化的変化の数が樹木のトポロジーに依存する特性を指す。[1]特性は、形態学的情報(羽や触手の存在など)やDNAやタンパク質の配列などの分子情報など、複数のタイプのデータを取ることができる。
情報サイトとは、関連する配列セット内の、少なくとも 2 つの異なる特性状態があり、それらの各状態が少なくとも 2 つの配列に発生する位置です。言い換えると、完全に保存された(つまり不変の) サイトになることも、1 つの配列のみが異なる (シングルトンの) サイトになることもできません (たとえば、一塩基多型や一塩基変異体に見られるように)。どちらの場合も、特性状態の変化の数はツリーのトポロジに関係なく同じで、それぞれ 0 と 1 に等しくなります。[1]
参考文献
- ^ ab Zvelebil, Marketa J. (2008).バイオインフォマティクスの理解. ニューヨーク: Garland Science. ISBN 978-0-8153-4024-9。
