IQカルモジュリン結合モチーフ

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1b7t 、1br1 、1br2 、1br4 、1d0x 、1d0y 、1d0z 、1d1a 、1d1b 、1d1c 、1dfk 、1dfl 、1fmv 、1fmw 、1jwy 、1jx2 、1kk7 、1kk8 、1kqm 、1kwo 、1l2o 、1lkx 、1lvk 、1mma 、1mmd 、1mmg 、1mmn 、1mnd 、1mne 、1oe9 、1qvi 、1s5g 、1scm 、1sr6 、1vom 、1w7i 、1w7j 、1wdc 、2mys

IQカルモジュリン結合モチーフ
IQカルモジュリン結合モチーフ
	ホタテガイミオシンの調節ドメインの2Å解像度での構造。
識別子
シンボル	知能指数
パム	PF00612
インタープロ	著作権
頭いい	SM00015
プロサイト	PS50096
SCOP2	1wdc / スコープ / SUPFAM
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1b7t 、1br1 、1br2 、1br4 、1d0x 、1d0y 、1d0z 、1d1a 、1d1b 、1d1c 、1dfk 、1dfl 、1fmv 、1fmw 、1jwy 、1jx2 、1kk7 、1kk8 、1kqm 、1kwo 、1l2o 、1lkx 、1lvk 、1mma 、1mmd 、1mmg 、1mmn 、1mnd 、1mne 、1oe9 、1qvi 、1s5g 、1scm 、1sr6 、1vom 、1w7i 、1w7j 、1wdc 、2mys

IQカルモジュリン結合モチーフは、次の配列を含むアミノ酸配列モチーフです。

[FILV]Qxxx[RK]Gxxx[RK]xx[FILVWY]

「IQ」という用語は、モチーフの最初の 2 つのアミノ酸、つまりイソロイシン(一般的) とグルタミン(常に) を指します。

関数

カルモジュリン（CaM）は、多様な細胞タンパク質との相互作用を通じて、主要なカルシウム（Ca ^{2+ ）センサーおよび調節イベントのオーケストレーターとして認識されています。既知のCaM結合タンパク質の多くには、3つのクラスの認識モチーフが存在します。Ca}^{2+非依存結合のコンセンサスであるIQモチーフと、保存された}疎水性残基の位置に基づいて1-14および1-5-10と呼ばれるCa ²⁺依存結合の2つの関連モチーフです。^[2]

例

ホタテガイミオシンの調節ドメインは、Ca ²⁺結合に応じてこのモーターのスイッチを入れる 3 鎖タンパク質複合体です。側鎖相互作用により、2 つの軽鎖が IQ 配列モチーフを持つ重鎖の隣接セグメントに直列にリンクされます。Ca ²⁺結合部位は、必須の軽鎖上の新しいEF ハンドモチーフであり、重鎖と両方の軽鎖を含む結合によって安定化され、完全なミオシン分子での Ca ²⁺結合と調節には 3 つの鎖すべてが必要であることを説明しています。 ^[3]

参考文献

^ Houdusse A, Cohen C (1996年1月). 「2Å解像度でのホタテガイミオシンの調節ドメインの構造：調節への影響」. Structure . 4 (1): 21–32. doi : 10.1016/S0969-2126(96)00006-8 . PMID 8805510.
^ Rhoads AR、Friedberg F (1997年4月)。「カルモジュリン 認識のための配列モチーフ」。FASEB J. 11 (5): 331–40. doi : 10.1096/fasebj.11.5.9141499 . PMID 9141499. S2CID 1877645。
^ Xie X、Harrison DH、Schlichting I、Sweet RM、Kalabokis VN、Szent-Györgyi AG、Cohen C (1994 年 3 月)。「2.8 Å 解像度でのホタテガイミオシンの調節ドメインの構造」。Nature。368 ( 6469 ) : 306–12。Bibcode : 1994Natur.368..306X。doi : 10.1038 /368306a0。PMID 8127365。S2CID 4279198。

この記事にはパブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR000048からのテキストが組み込まれています。

[pmid8805510-1] Houdusse A, Cohen C (1996年1月). 「2Å解像度でのホタテガイミオシンの調節ドメインの構造：調節への影響」. Structure . 4 (1): 21–32. doi : 10.1016/S0969-2126(96)00006-8 . PMID 8805510.

[pmid9141499-2] ^ Rhoads AR、Friedberg F (1997年4月)。「カルモジュリン 認識のための配列モチーフ」。FASEB J. 11 (5): 331–40. doi : 10.1096/fasebj.11.5.9141499 . PMID 9141499. S2CID 1877645。

[pmid8127365-3] Xie X、Harrison DH、Schlichting I、Sweet RM、Kalabokis VN、Szent-Györgyi AG、Cohen C (1994 年 3 月)。「2.8 Å 解像度でのホタテガイミオシンの調節ドメインの構造」。Nature。368 ( 6469 ) : 306–12。Bibcode : 1994Natur.368..306X。doi : 10.1038 /368306a0。PMID 8127365。S2CID 4279198。