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| ハプログループ S-M230 (S1a1b) | |
|---|---|
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| 起源の可能性のある時期 | 現在から28,000～41,000年前（Scheinfeldt 2006） |
| 起源地の可能性 | ニューギニア/インドネシア |
| 祖先 | S1a1 (Z42413) [1] [2] |
| 子孫 | S1a1b1 (M254) |
| 突然変異の定義 | M230、P202 |
| 最高周波数 | エカリ74% (モナ 2007) |
ハプログループ S-M230は、 S1a1b (以前は S* または K2b1a4)とも呼ばれ、 Y 染色体 DNA ハプログループです。これは、ハプログループ S1a (および唯一の主要なサブクレードであるハプログループ S-P405)の中で、数的に最も大きなサブクレードです。
S-M230はパプアニューギニアの高地の住民の間でよく見られる（Kayser 2003）。インドネシアやメラネシアの隣接地域でも低頻度で見られる。[1]（Kayser 2003 Cox 2006）
起源
分布
ある研究では、ハプログループ S-M230 が、パプアニューギニア(PNG) 高地のサンプルの 52% (16/31) 、モルッカ諸島のサンプルの 21% (7/34) 、パプアニューギニア沿岸のサンプルの 16% (5/31)、ニューブリテン島のトライのサンプルの 12.5% (2/16) 、ヌサトゥンガラのサンプルの 10% (3/31) 、および西ニューギニア低地/沿岸のサンプルの 2% (2/89) で見つかったと報告されています。(Kayser 2003 Cox 2006)
1 つのサブクレード、ハプログループ S-M226.1 (S1a1b1d1a、以前は S1d) は、アドミラルティ諸島と PNG 本土の海岸沿いで低頻度に発見されています。(Kayser 2008)
系統学
ハプログループS内の構造と位置
- S1a
- S1a1 Z42413
- S1a1a
- S1a1a1 P60、P304、P308
- S1a1a2
- S1a1b M230、P202、P204 – 2016年に以前の基底ハプログループS*の位置から「降格」されました（それ以前はハプログループK5として知られていました）。
- S1a1b1 (M254) (以前はK2b1a4aとして知られていた)
- S1a1b1 (M254)
- S1a1b1a (P57)
- S1a1b1b (P61)
- S1a1b1c（P83）
- S1a1b1d (SK1891)
- S1a1a
- S1a2 P79、P307
- S1a3 P315
- S1a3a Z41763
- S1a3b〜P401
歴史
2002 年より前、学術文献には Y 染色体系統樹の命名システムが少なくとも 7 つありました。このため、かなりの混乱が生じました。2002 年に、主要な研究グループが集まり、Y 染色体コンソーシアム (YCC)が結成されました。彼らは共同論文を発表し、全員が使用することに同意した単一の新しい系統樹を作成しました。その後、集団遺伝学と遺伝系譜学に関心を持つ市民科学者のグループがワーキング グループを結成し、何よりもタイムリーであることを目指したアマチュア系統樹を作成しました。以下の表は、画期的な 2002 年の YCC 系統樹の時点でこれらすべての研究をまとめたものです。これにより、以前に発表された文献をレビューする研究者は、命名法間をすばやく移動できます。
研究出版物
YCC ツリーの作成には、以下の研究チームが各自の出版物に基づいて参加しました。
- α Jobling と Tyler-Smith 2000 および Kaladjieva 2001
- βアンダーヒル2000
- γハマー 2001
- δカラフェット 2001
- εセミノ 2000
- ζス 1999
- ηカペリ 2001
2005 YCC ツリー
2008 YCC ツリー
2002年から2008年まではハプログループK5として知られていました。[要出典]
参照
ウィキメディア・コモンズには、Y-DNA のハプログループ Sに関連するメディアがあります。
遺伝学
Y-DNA Sサブクラス
- S-M230
Y-DNAバックボーンツリー
参考文献
- ^ abc 国際遺伝子系譜学会（ISOGG; 2017）、Y-DNAハプログループツリー2017（2017年3月24日）。
- ^ 「記事を閲覧 | European Journal of Human Genetics」www.nature.com 。 2023年3月25日閲覧。
- ^ 国際遺伝子系譜学会（ISOGG; 2015）、Y-DNAハプログループツリー2015。（アクセス日：2015年2月1日）
脚注
引用文献
- Cox, Murray P.; Mirazón Lahr, Marta (2006)。「ソロモン諸島のオーストロネシア語とパプア語を話すコミュニティのペアでは、Y染色体の多様性は言語の所属と逆相関している」。American Journal of Human Biology。18 ( 1): 35–50。doi :10.1002/ajhb.20459。PMID 16378340。S2CID 4824401。
- Karafet, TM; Mendez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (2008). 「新しいバイナリ多型により、ヒト Y 染色体ハプログループ ツリーの形状が変わり、解像度が向上」。ゲノム研究 。18 ( 5 ): 830–8。doi :10.1101/ gr.7172008。PMC 2336805。PMID 18385274。
- Kayser, Manfred; Brauer, Silke; Weiss, Gunter; Schiefenhövel, Wulf; Underhill, Peter; Shen, Peidong; Oefner, Peter; Tommaseo-Ponzetta, Mila; Stoneking, Mark (2003). 「西ニューギニアのヒト集団におけるY染色体の減少、ミトコンドリアDNAの減少ではなく多様性」。アメリカ人類遺伝 学ジャーナル。72 (2): 281–302。doi :10.1086/346065。PMC 379223。PMID 12532283。
- Kayser, M.; Choi, Y.; Van Oven, M.; Mona, S.; Brauer, S.; Trent, RJ; Suarkia, D.; Schiefenhovel, W.; Stoneking, M. (2008). 「オーストロネシア人の拡大の影響: メラネシアのアドミラルティ諸島における mtDNA と Y 染色体の多様性からの証拠」.分子生物学と進化. 25 (7): 1362–74. doi : 10.1093/molbev/msn078 . PMID 18390477.
- Mona, S.; Tommaseo-Ponzetta, M.; Brauer, S.; Sudoyo, H.; Marzuki, S.; Kayser, M. (2007). 「Y染色体の多様性のパターンはトランスニューギニア仮説と交差する」Mol. Biol. Evol . 24 (11): 2546–55. doi : 10.1093/molbev/msm187 . PMID 17846104.
- Scheinfeldt, L.; Friedlaender, F; Friedlaender, J; Latham, K; Koki, G; Karafet, T; Hammer, M; Lorenz, J (2006). 「メラネシア北部島嶼における予期せぬ NRY 染色体変異」。分子生物学と進化。23 ( 8): 1628–41。doi : 10.1093/molbev/ msl028。PMID 16754639 。
変換表のソース
- Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; 他 (2001 年 2 月)。「島嶼部東南アジアおよびオセアニアのオーストロネシア語族の主に先住民族の父系遺産」。アメリカ 人類遺伝学ジャーナル。68 (2): 432–443。doi :10.1086/318205。PMC 1235276。PMID 11170891。
- Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd , Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (2001 年 7 月 1 日)。「ヒト Y 染色体のグローバル多様性の階層的パターン」。分子生物学 と進化。18 (7): 1189–1203。doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906。PMID 11420360。
- Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000)、「新しいハプロタイプの新しい用途」、Trends in Genetics、16 (8): 356–62、doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6、PMID 10904265
- カラジェヴァ、ルバ。カラフェル、フランセスク。ジョブリング、マークA;アンジェリチェワ、ドーラ。他。 (2001 年 2 月)。 「Y染色体とミトコンドリアDNA系統によって明らかにされたVlax Romaの集団間および集団内の遺伝的多様性のパターン」。欧州人類遺伝学ジャーナル。9 (2): 97-104。土井：10.1038/sj.ejhg.5200597。PMID 11313742。S2CID 21432405 。
- Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (2001 年 9 月). 「東アジアの父系人口史: 起源、パターン、およびミクロ進化プロセス」.アメリカ人類遺伝学ジャーナル. 69 (3): 615–628. doi : 10.1086/323299 . PMC 1235490. PMID 11481588 .
- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000)、「現存するヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産：AY染色体の観点」、Science、290 (5494): 1155–9、Bibcode :2000Sci...290.1155S、doi :10.1126/science.290.5494.1155、PMID 11073453
- Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; et al. (1999 年 12 月)。「最終氷期に現代人が東アジアに北方移住したことを示す Y 染色体の証拠」。 アメリカ人類遺伝学ジャーナル。65 (6): 1718–1724。doi :10.1086/302680。PMC 1288383。PMID 10577926。
- Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (2000 年 11 月)。「Y 染色体配列の変異と人類集団の歴史」。Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
さらに読む
- ハーバー、マーク。プラット、ダニエル E.アシュラフィアン・ボナブ、マジアル。ユハンナ、ソニア C.ソリア＝ヘルナンツ、デイビッド F.マルティネス・クルス、ベゴーニャ。ドゥアイヒ、ブシュラ。ガッシベ・サバグ、ミシェル。他。 （2012年）。カイザー、マンフレッド（編）。 「アフガニスタンの民族グループは、歴史的出来事によって構造化されたY染色体遺産を共有している」。プロスワン。7 (3): e34288。ビブコード:2012PLoSO...734288H。土井：10.1371/journal.pone.0034288。PMC 3314501。PMID 22470552。
- Karafet, Tatiana M.; Lansing, JS; Redd, Alan J.; Watkins, Joseph C.; Surata, SPK; Arthawiguna, WA; Mayer, Laura; Bamshad, Michael; et al. (2005). 「インドネシアの開拓におけるバリ島の Y 染色体の観点: 先新石器時代の狩猟採集民、オーストロネシアの農民、およびインド人商人の遺伝的寄与」. Human Biology . 77 (1): 93–114. doi :10.1353/hub.2005.0030. hdl : 1808/13586 . PMID 16114819. S2CID 7953854.
- カイザー、M.ブラウアー、S;コルドー、R;カスト、A;ラオ、O;ルイジアナ州ジボトフスキー。モイーズ・フォーリー、C;ラトリッジ、RB。他。 (2006)。 「ポリネシア人のメラネシアとアジアの起源：太平洋を越えたMtDNAとY染色体の勾配」。分子生物学と進化。23 (11): 2234–44。土井: 10.1093/molbev/msl093。hdl : 11858/00-001M-0000-0010-0145-0。PMID 16923821。