グラフモデリング言語

グラフ モデリング言語(GML) は、グラフを記述するための階層的なASCIIベースのファイル形式です。グラフ メタ言語とも呼ばれます。

GML 形式のシンプルなグラフ:

グラフ [
	コメント「これはサンプルグラフです」
	監督 1
	id 42
	ラベル「こんにちは、私はグラフです」
	ノード[
		id 1
		ラベル「ノード 1」
		これはサンプル属性 42
	]
	ノード[
		id 2
		ラベル「ノード 2」
		これはサンプル属性 43
	]
	ノード[
		id 3
		ラベル「ノード 3」
		これはサンプル属性 44
	]
	角 [
		ソース 1
		ターゲット2
		「ノード 1 からノード 2 へのエッジ」というラベル
	]
	角 [
		ソース2
		ターゲット3
		「ノード 2 からノード 3 へのエッジ」というラベル
	]
	角 [
		ソース 3
		ターゲット1
		「ノード 3 からノード 1 へのエッジ」というラベル
	]
]

• 分子相互作用ネットワークを視覚化するオープンソースの バイオインフォマティクス ソフトウェアプラットフォームであるCytoscape は、以前に構築された相互作用ネットワークを GML で読み込み、保存します。
• igraph は、複数のプログラミング言語へのインターフェースを備えたオープンソースのネットワーク分析ライブラリです。
• オープンソースのグラフ視覚化および操作ソフトウェアであるGephi。
• Graph-tool は、グラフの操作と統計分析のための無料のPython モジュールです。
• NetworkX は、複雑なグラフを研究するためのオープンソースの Pythonライブラリです。
• Tulip (ソフトウェア) は、巨大なグラフ (1,000,000 を超える要素) を操作できる情報視覚化の分野におけるフリー ソフトウェアです。
• 無料の Java ベースのグラフ エディターであるyEd は、GML からのインポートと GML へのエクスポートをサポートしています。
• Graphvizプロジェクトには、 DOTファイル形式との間で変換できる 2 つのコマンドライン ツール (gml2gv と gv2gml) が含まれています。
• 汎用的な非常に高水準なプログラミング言語であるWolfram Language は、GML のインポートとエクスポートをサポートしています。

• グラフクエリ言語(GQL)
• 翻訳

• GML: ポータブル グラフ ファイル形式、Michael Himsolt - 2010/11/30 (アーカイブ版)
• グラフ交換ファイル形式の解明、Matthew Roughan および Jonathan Tuke 著、2015 年、https://arxiv.org/pdf/1503.02781.pdf