GCM転写因子

分子生物学では、GCM転写因子はGCMモチーフを含むタンパク質のファミリーです。GCMモチーフは、ショウジョウバエGCMとその哺乳類ホモログ（ヒトGCM1 およびGCM2 ）を含む、基本的な発生プロセスに関与する転写調節因子ファミリーに属するタンパク質で同定されたドメインです。^[¹^]^[²^]^[³^]^[⁴^] GCM転写因子では、 N末端部分に150アミノ酸の DNA結合ドメインが含まれています。このGCMドメインでは配列の保存性が最も高くなっています。対照的に、C末端部分には1つまたは2つの転写活性化領域が含まれており、保存性は低いです。

GCMモチーフは、非回文構造のオクタマー5'-ATGCGGGT-3'を優先的に認識するDNA結合ドメインであることが示されています。^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} GCMモチーフには、多くの保存された塩基性アミノ酸残基、7つのシステイン残基、および4つのヒスチジン残基が含まれています。^{[ 1 ]}保存されたシステインは、ドメイン全体の立体構造の形成、DNA結合のプロセス、およびDNA結合の酸化還元調節に関与しています。^{[ 3 ]} GCMドメインは、他のどのDNA結合ドメインとも類似性のない、新しいクラスのZn含有DNA結合ドメインです。^{[ 5 ]} GCMドメインは、構造中に存在する2つのZnイオンのうちの1つによって結合された大きなドメインと小さなドメインで構成されています。大ドメインと小ドメインはそれぞれ5本鎖と3本鎖のβシートから構成され、3つの小さならせん状セグメントが2つの βシートの同じ側に密着している。GCMドメインは、5本鎖のβシートがDNAの主溝に挿入されるという、配列特異的なDNA認識という新しい様式を発揮する。βシートの端鎖から突き出た残基とそれに続くループおよび鎖は、両方のDNA鎖の塩基と骨格に接触し、DNA標的部位に対する特異性を提供する。

参考文献

1 2 3 Akiyama Y, Hosoya T, Poole AM, Hotta Y (1996 年 12 月). "gcm モチーフ: ショウジョウバエと哺乳類で保存されている新しい DNA 結合モチーフ" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (25): 14912– 6. Bibcode : 1996PNAS...9314912A . doi : 10.1073/pnas.93.25.14912 . PMC 26236 . PMID 8962155 .
1 2 Schreiber J、Sock E、Wegner M (1997 年 4 月)。「初期グリア細胞形成の調節因子であるグリア細胞欠損は、新規タイプの DNA 結合ドメインを持つ転写因子である」。Proc . Natl . Acad . Sci . USA。94 ( 9 ) : 4739–44。Bibcode : 1997PNAS...94.4739S。doi : 10.1073/ pnas.94.9.4739。PMC 20794。PMID 9114061。
1 2 3 Schreiber J、Enderich J、Wegner M (1998年5月)。「GCM タンパク質の DNA 結合のための構造的要件」。Nucleic Acids Res。26 ( 10 ) : 2337–43。doi : 10.1093 / nar/26.10.2337。PMC 147556。PMID 9580683。
↑ Tuerk EE、Schreiber J、Wegner M (2000 年 2 月)。「タンパク質の安定性とドメイントポロジーが、哺乳類グリア細胞欠損ホモログ GCMb の転写活性を決定する」。J . Biol. Chem . 275 (7): 4774–82 . doi : 10.1074/jbc.275.7.4774 . PMID 10671510 .
↑ Cohen SX、Moulin M、Hashemolhosseini S、Kilian K、Wegner M、Muller CW (2003 年 4 月)。「GCMドメイン- DNA 複合体の構造: 新しいフォールドと標的部位認識モードを持つ DNA 結合ドメイン」。EMBO J。22 ( 8 ): 1835–45。doi : 10.1093/ emboj / cdg182。PMC 154474。PMID 12682016。

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[pmid8962155-1] 1 2 3 Akiyama Y, Hosoya T, Poole AM, Hotta Y (1996 年 12 月). "gcm モチーフ: ショウジョウバエと哺乳類で保存されている新しい DNA 結合モチーフ" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (25): 14912– 6. Bibcode : 1996PNAS...9314912A . doi : 10.1073/pnas.93.25.14912 . PMC 26236 . PMID 8962155 .

[pmid9114061-2] 1 2 Schreiber J、Sock E、Wegner M (1997 年 4 月)。「初期グリア細胞形成の調節因子であるグリア細胞欠損は、新規タイプの DNA 結合ドメインを持つ転写因子である」。Proc . Natl . Acad . Sci . USA。94 ( 9 ) : 4739–44。Bibcode : 1997PNAS...94.4739S。doi : 10.1073/ pnas.94.9.4739。PMC 20794。PMID 9114061。

[pmid9580683-3] 1 2 3 Schreiber J、Enderich J、Wegner M (1998年5月)。「GCM タンパク質の DNA 結合のための構造的要件」。Nucleic Acids Res。26 ( 10 ) : 2337–43。doi : 10.1093 / nar/26.10.2337。PMC 147556。PMID 9580683。

[pmid10671510-4] Tuerk EE、Schreiber J、Wegner M (2000 年 2 月)。「タンパク質の安定性とドメイントポロジーが、哺乳類グリア細胞欠損ホモログ GCMb の転写活性を決定する」。J . Biol. Chem . 275 (7): 4774–82 . doi : 10.1074/jbc.275.7.4774 . PMID 10671510 .

[pmid12682016-5] Cohen SX、Moulin M、Hashemolhosseini S、Kilian K、Wegner M、Muller CW (2003 年 4 月)。「GCMドメイン- DNA 複合体の構造: 新しいフォールドと標的部位認識モードを持つ DNA 結合ドメイン」。EMBO J。22 ( 8 ): 1835–45。doi : 10.1093/ emboj / cdg182。PMC 154474。PMID 12682016。

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参考文献

関連するトピック

モチーフを含む

タンパク質のファミリー

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