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| コンテンツ | |
|---|---|
キャプチャされたデータの種類 | タンパク質ドメイン |
| 接触 | |
| 研究センター | テキサス大学サウスウェスタン医療センター、グリシン研究室 |
| 著者 | H. Cheng、RD Schaeffer、Y. Liao、LN Kinch、J. Pei、S. Shi、BH Kim、NV Grishin。 |
| 主な引用 | 25474468 のID |
| 発売日 | 2014 |
| アクセス | |
| Webサイト | http://prodata.swmed.edu/ecod/ |
| その他 | |
| バージョン | 継続的に更新 |
| キュレーションポリシー | 新しいタンパク質については手動で、近い一致については自動化する |
タンパク質ドメインの進化的分類( ECOD )は、タンパク質データバンクから入手できるタンパク質ドメインを分類する生物学的データベースです。ECOD は、タンパク質間の進化的関係を判定しようとします。
Pfam、CATH、SCOPと同様に、ECODはタンパク質全体ではなくドメインをコンパイルします。しかし、ECODは進化関係に重点を置いています。タンパク質をフォールドでグループ化するのではなく（これは単に収斂進化を表す可能性があります）、ECODは実証可能な相同性のみでタンパク質をグループ化します。[1]
参考文献