エルウィニア科

エルウィニア科
Pantoea piersonii（旧称Kalamiella piersonii）寒天培地上
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	ガンマプロテオバクテリア
注文：	腸内細菌
家族：	エルウィニア科 Adeolu 他、2016
属
ブフネラ エルウィニア ミクスタ パントエア ファゼオリバクター タトゥメラ ウィグルスワーシア カラミエラ

エルウィニア科はグラム陰性細菌の科で、多くの植物病原体と昆虫共生菌を含む。^{[1]この科は、}シュードモナス門ガンマプロテオバクテリア綱腸内細菌目に属する。この科のタイプ属はエルウィニアである。^[2]

Erwiniaceaeという名前は、ラテン語のErwiniaに由来しており、科のタイプ属と、科を表す接尾辞「-aceae」に由来しています。これらを合わせると、Erwiniaceae は命名上のタイプがErwinia属である科を指します。^[1]

出典: ^[1]

これらの細菌はカタラーゼ陽性、オキシダーゼ陰性であり、インドールや二硫化水素を生成しません。Erwinia toletana、Erwinia ypographi 、およびErwinia oleaeの一部の菌株を除き、ほとんどの種はVoges-Proskauer テストで陽性です。

ゲノム解析により、グルタミン酸システインリガーゼ、DNAジャイレース（サブユニットB）、LPSアセンブリタンパク質LptD、チオール：ジスルフィド交換タンパク質DsbA前駆体、2成分センサーヒスチジンキナーゼ、RNAヘリカーゼ、tRNAシュードウリジン（13）合成酵素TruD、グリシン/ベタインABCトランスポーターATP結合タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ、および定常期誘導タンパク質CsiEの12個の保存されたシグネチャーインデル（CSI）が、この科に特有のものとして特定されました。^{[1]これらのCSIは、}エルウィニア科の種を腸内細菌目の他の科や他の細菌から識別および区別するための信頼性の高い分子的方法を提供します。

2021年現在、エルウィニア科には8つの属が有効に公表されている。 ^[2]この科のメンバーはもともと腸内細菌科のメンバーであり、異なる生化学的特徴と異なる生態学的ニッチを持つ、系統学的に無関係な大きな種のグループであった。腸内細菌科への種の当初の割り当ては、主に16S rRNAゲノム配列解析に基づいていたが、これは識別力が低いことが知られており、その結果はアルゴリズムと使用される生物情報によって変わる。それにもかかわらず、解析は依然として多系統分岐を示しており、科内に異なるサブグループが存在することを示している。^[3]

2016年、Adeoluらは、比較ゲノム解析と、保存されたゲノム配列、16S rRNA配列、多座配列解析から構築されたさまざまな系統樹の分岐パターンに基づいて、腸内細菌科を7つの新しい科に分類することを提案しました。この科に特有の分子マーカー、特に保存されたシグネチャーインデルも、系統樹とは独立した分類を支持する証拠として特定されました。^[1]