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モザンビークでは、いくつかのレベルで代表者を選出する。
モザンビークの選挙は国家選挙委員会（CNE）によって運営されており、選挙法は頻繁に改正されている。2012年12月、選挙委員会の構成に関する新法では、8人の政党代表者で構成されることになっている。5人は現政権与党FRELIMO、2人は主要野党RENAMO、1人はモザンビーク民主運動（MDM）によって任命される。さらに、市民社会代表者によって指名される3人、司法長官高等評議会によって任命される裁判官1人、検察庁高等評議会によって任命される弁護士1人が加わる。[ 1 ]
1994年にモザンビークで初めて複数政党制による選挙が行われ、1986年からモザンビーク大統領を務めていたFRELIMOの候補者ジョアキン・シサノが当選し、野党で元ゲリラ組織のRENAMOも選挙結果を承認した。内戦のためモザンビークに平和維持部隊を派遣していた国連安全保障理事会は、決議960で選挙結果を自由かつ公正なものとして承認した。
1999年末の選挙では、FRELIMOのジョアキン・シサノ大統領が52.3%の得票率で再選され、FRELIMOは全250議席中133議席を獲得した。主要野党であるRENAMOのアフォンソ・ドラカマ候補は47.7%の得票率で、同党は残りの117議席を獲得した。
2004年12月1日～2日に行われた選挙では、FRELIMOの新候補アルマンド・ゲブサが63.7%の得票率で勝利し、RENAMOの候補アフォンソ・ドラカマ（31.7%）の2倍以上の票を獲得した。議会選挙では、FRELIMOが62%（180万票）、RENAMOが29.7%（90万5000票）を獲得し、残りの8%は18の小政党が分け合った。FRELIMOは議席の160議席、RENAMOは90議席を獲得する。
選挙は、国家選挙管理委員会によって公正かつ透明な方法で実施されなかったとして批判されている。複数の選挙不正が発生したが、処罰されなかった。これに対し、欧州連合モザンビーク選挙監視団やカーターセンターなどが批判している。しかし、選挙の不備は（EU監視団の見解によれば）大統領選挙の結果には影響を与えなかった可能性が高い。ただし、政党間の議席配分は多少変更されただろう（レナモはフレリモに議席を奪われた可能性が高い）。
2005年2月2日、ゲブザは共和国大統領に就任したが、ドラカマとレナモは就任式への出席も承認もしていなかった。しかし、レナモは議会と国家評議会への参加には同意した。
大統領選挙と議会選挙は、複数政党制導入後4回目となる2009年10月28日に実施された。共和国議会選挙では、FRELIMOとRENAMOが全13選挙区に候補者を擁立したが、新たに結成されたMDMは4選挙区にしか候補者を擁立できなかった。
大統領選挙と議会選挙は、複数政党制導入後5回目となる2014年10月15日に実施された。共和国議会選挙では、FRELIMO、MDM、RENAMOの3党が全13選挙区で候補者を擁立した。