結晶学オープンデータベース

結晶学オープンデータベース (COD)
コンテンツ
説明	結晶構造と世界規模のコラボレーションのためのプラットフォーム
接触
研究センター	ヴィリニュス大学
著者	サウリウス・グラズリス
主な引用	グラジュリスら（2012）
発売日	2003
アクセス
データ形式	結晶構造情報ファイル(.cif)
Webサイト	http://www.crystallography.net
パブリックSQLアクセス	http://wiki.crystallography.net/howtoquerycod/

結晶学オープンデータベース（COD ）は、結晶構造のデータベースです。 ^[1]同様の結晶学データベースとは異なり、このデータベースは完全にオープンアクセスであり、登録ユーザーは、小分子および小〜中サイズの単位セル結晶の公開済みおよび未公開の構造をデータベースに提供できます。2024年11月現在、データベースには520,000件以上のエントリがあります。^[2]データベースにはさまざまな貢献者がおり、国際結晶学連合（IUCr）によって定義された結晶学情報ファイルが含まれています。現在、このデータベースをミラーリングするサイトは世界中に5つあります。化合物の3D構造は、3Dプリンターの入力ファイルに変換できます。^[3]

参照

参考文献

^ ab Gražulis, Saulius; Daškevič Adriana; Merkys Andrius; Chateigner Daniel; Lutterotti Luca; Quirós Miguel; Serebryanaya Nadezhda R; Moeck Peter; Downs Robert T; Le Bail Armel (2012 年 1 月). 「結晶学オープンデータベース (COD): 結晶構造のオープンアクセスコレクションおよび世界規模のコラボレーションのためのプラットフォーム」. Nucleic Acids Res . 40 (データベース号). イギリス: D420-7. doi :10.1093/nar/gkr900. PMC 3245043. PMID 22070882 .
^ オックスフォードジャーナル - 核酸研究結晶学オープンデータベース（COD）：結晶構造のオープンアクセスコレクションと世界的なコラボレーションのためのプラットフォーム2011年10月5日
^ Scalfani, Vincent F.; Williams, Antony J.; Tkachenko, Valery; Karapetyan, Karen; Pshenichnov, Alexey; Hanson, Robert M.; Liddie, Jahred M.; Bara, Jason E. (2016 年 11 月 23 日). 「Jmol を使用した結晶構造の 3D 印刷可能なファイルへのプログラムによる変換」. Journal of Cheminformatics . 8 (1): 66. doi : 10.1186/s13321-016-0181-z . PMC 5122160. PMID 27933103 .

外部リンク

https://www.crystallography.net
http://cod.ibt.lt/
https://archive.today/20130714225104/http://cod.ensicaen.fr/
https://qiserver.ugr.es/cod/
http://nanocrystallography.research.pdx.edu/search/codmirror/
https://nanocrystallography.research.pdx.edu
https://crystallography.io/

[pmid22070882-1] Gražulis, Saulius; Daškevič Adriana; Merkys Andrius; Chateigner Daniel; Lutterotti Luca; Quirós Miguel; Serebryanaya Nadezhda R; Moeck Peter; Downs Robert T; Le Bail Armel (2012 年 1 月). 「結晶学オープンデータベース (COD): 結晶構造のオープンアクセスコレクションおよび世界規模のコラボレーションのためのプラットフォーム」. Nucleic Acids Res . 40 (データベース号). イギリス: D420-7. doi :10.1093/nar/gkr900. PMC 3245043. PMID 22070882 .

[2] オックスフォードジャーナル - 核酸研究結晶学オープンデータベース（COD）：結晶構造のオープンアクセスコレクションと世界的なコラボレーションのためのプラットフォーム2011年10月5日

[3] Scalfani, Vincent F.; Williams, Antony J.; Tkachenko, Valery; Karapetyan, Karen; Pshenichnov, Alexey; Hanson, Robert M.; Liddie, Jahred M.; Bara, Jason E. (2016 年 11 月 23 日). 「Jmol を使用した結晶構造の 3D 印刷可能なファイルへのプログラムによる変換」. Journal of Cheminformatics . 8 (1): 66. doi : 10.1186/s13321-016-0181-z . PMC 5122160. PMID 27933103 .