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| コンテンツ | |
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| 説明 | 実験的に検証された TF 結合部位のデータベース |
| 生物 | 細菌 |
| 接触 | |
| 著者 | キルチら（2014）[1] |
| 主な引用 | 24234444 のID |
| 発売日 | 2013 |
| アクセス | |
| データ形式 | FASTA、CSV、ARFF |
| Webサイト | collectf.org compbio.umbc.edu |
| ダウンロードURL | [1] |
CollecTFは細菌ドメインの転写因子 結合部位のデータベースです。 [1]
CollecTF は、実験的に検証された TF 結合部位のみをコンパイルします。これは、TF 結合部位の特定に使用される実験プロセスに特に重点を置いて、査読済みの文献を手動でキュレーションすることで実現されます。
CollecTF エントリは、定期的にNCBIに送信され、 RefSeq の完全なゲノム レコードにリンク アウト機能として統合されます。これにより、データの可視性が最大化され、RefSeq ファイルの注釈が規制情報で強化されます。CollecTF は、比較ゲノミクスと機械学習による規制相互作用の分析を容易にすることを目指して、最初のリリースで、2 つの TF ファミリー ( LexAとFur ) のドメイン全体のカバレッジと、臨床的に重要な細菌ファミリーであるVibrionaceaeの広範な表現を提供します。
参考文献
外部リンク
- 翻訳元: