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染色体マイクロダイセクションとは、完全な染色体からDNAの大きな断片を物理的に除去する技術である。この方法で分離できる最小のDNA断片は1000万塩基対、つまり数百から数千の個々の遺伝子から構成される。
染色体を研究する科学者は細胞遺伝学者と呼ばれます。彼らは、それぞれの染色体の固有の濃淡の縞模様に基づいて染色体を識別します。しかし、特定の異常によって染色体の縞模様が通常とは異なるものになることがあります。例えば、ある染色体に別の染色体の一部が挿入され、余分な縞模様が生じることがあります。また、染色体の一部が繰り返し出現し、異常に幅の広い濃い縞模様（均一染色領域と呼ばれる）が生じることもあります。染色体異常の中には、癌や遺伝性疾患と関連付けられているものもあり、多くの腫瘍細胞の染色体には不規則な縞模様が見られます。これらの異常の原因をより深く理解するために、科学者たちは、これらの異常な縞模様の近くにある遺伝子やDNA配列を特定したいと考えています。染色体マイクロダイセクションは、これらの領域からDNAを分離し、そのDNAをさらなる研究に利用できるようにするための特殊な方法です。
染色体マイクロダイセクションのために細胞を準備するには、まず科学者が細胞を化学薬品で処理し、染色体が密に巻き付いて非常によく見える状態である中期に移行させます。次に、細胞を顕微鏡スライドに滴下し、すべての遺伝物質をまとめている核を破壊して染色体をスライド上に放出させます。その後、顕微鏡下で科学者は目的の特定のバンドを見つけ、非常に細い針を使ってそのバンドを染色体の残りの部分から引き剥がします。次に、研究者はPCR（ポリメラーゼ連鎖反応）と呼ばれる手順を用いて、分離したDNAの複数のコピーを作成します。科学者はこれらのコピーを使用して、問題となっている染色体の異常な領域のDNAを研究します。