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| パラブルクホルデリア・フンゴラム | |
|---|---|
| 科学的分類 | |
| ドメイン: | 細菌 |
| 門: | シュードモナドタ |
| クラス: | ベータプロテオバクテリア |
| 注文: | バークホルデリア目 |
| 家族: | ブルクホルデリア科 |
| 属: | パラブルクホルデリア |
| 種: | P. フンゴラム
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| 二名法名 | |
| パラブルクホルデリア・フンゴラム (Coenye et al. 2001)Sawana et al . 2001 2015年[1]
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| 同義語 | |
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パラブルクホルデリア・フンゴラム(P. fungorum)はグラム陰性細菌の一種である。[2]農業において、生物防除や生物修復の媒介として有益な微生物として広く利用されている。パラブルクホルデリア・フンゴラムの菌株の中には、成長のためにウランを利用し、U(VI)をU(IV)に変換できるものがある。[3]
方法論
センザンコウP. fungorum (センザンコウ Pf) ゲノムのゲノムサイズは約 7.7 Mbps、N50 は 69,666 bps です。センザンコウ Pf は Paraburkholderia fungorum の一種であることが示されており、コアゲノムの SNP ベースの系統発生解析と機能解析によってサポートされる ANI 解析から、ストレス応答、毒性、病気、防御に関連する遺伝子がかなり多く存在することがわかりました。センザンコウ Pf のゲノムでは、細菌の環境への応答や、生存、接着、適応などの生理学的プロセスに関与する、高度に特殊化されたさまざまな種類の分泌システムが特定されています。
センザンコウPfは、既知の病原性を持つBurkholderiales目昆虫と共通の毒性遺伝子もいくつか持っています。これらの遺伝子は、接着、運動性、侵入において重要な役割を果たします。このゲノム配列の追加は、P. fungorumの将来の比較分析や機能研究にとっても重要です。[1]
参照
参考文献
- ^ Sawana A、Adeolu M、Gupta RS (2014)。「Burkholderia属の分子シグネチャーと系統ゲノム解析:病原性生物を含む修正されたBurkholderia属と環境種を含む新しい属Paraburkholderia gen. nov.へのこの属の分割の提案」。Front . Genet . 5 :429. doi : 10.3389/fgene.2014.00429 . PMC 4271702. PMID 25566316 。
- ^ Burkohlderia JP Euzéby: 命名法に定められた原核生物の名前の一覧
- ^ Koribanics, NM; Tuorto, SJ; Lopez-Chiaffarelli, N; McGuinness, LR; Häggblom, MM; Williams, KH; Long, PE; Kerkhof, LJ (2015). 「コロラド州ライフルのフィールド研究サイトでのウラン呼吸ベータプロテオバクテリアの空間分布」. PLOS ONE . 10 (4): e0123378. Bibcode :2015PLoSO..1023378K. doi : 10.1371 /journal.pone.0123378 . PMC 4395306. PMID 25874721.
