Loading article…
 ブラスト2GO | |
| タイプ | バイオインフォマティクスソフトウェア |
|---|---|
| インセプション | 2011 |
| メーカー | バイオバンバイオインフォマティクス |
| 作られたモデル | デモ、ベーシック、トライアル、プロ、プラグイン、コマンドライン |
| Webサイト | https://www.blast2go.com |
2005年に初めて公開されたBlast2GO [1] [2] [3] [4]は、新規配列データ（遺伝子タンパク質）の自動かつ高スループットな機能注釈付けのためのバイオインフォマティクスソフトウェアツールです。BLAST [5]アルゴリズムを使用して類似配列を識別し、まだ特徴付けられていない配列の既存の機能注釈を新規配列に転送します。機能情報は、機能属性の制御された語彙である遺伝子オントロジー（GO）を介して表現されます。 [要出典]遺伝子オントロジー（GO ）は、すべての種にわたって遺伝子および遺伝子産物の属性の表現を統一するための主要なバイオインフォマティクスイニシアチブです。[6]
参照
参考文献
- ^ Conesa, A; Götz, S; García-Gómez, JM; Terol, J; Talón, M; Robles, M (2005 年 9 月 15 日). 「Blast2GO: 機能ゲノム研究における注釈、視覚化、分析のための汎用ツール」.バイオインフォマティクス. 21 (18): 3674–6. doi : 10.1093/bioinformatics/bti610 . PMID 16081474.
- ^ Götz, S; García-Gómez, JM; Terol, J; Williams, TD; Nagaraj, SH; Nueda, MJ; Robles, M; Talón, M; Dopazo, J; Conesa, A (2008 年 6 月)。「Blast2GO スイートによる高スループット機能注釈およびデータマイニング」。核酸研究 。36 ( 10 ): 3420–35。doi :10.1093/ nar /gkn176。PMC 2425479。PMID 18445632。
- ^ Conesa, A; Götz, S (2008). 「Blast2GO: 植物ゲノムの機能解析のための包括的なスイート」International Journal of Plant Genomics . 2008 : 1–12. doi : 10.1155/2008/619832 . PMC 2375974 . PMID 18483572.
- ^ ゲッツ、S;アーノルド、R;セバスティアン レオン、P;マルティン・ロドリゲス、S;ティシュラー、P;マサチューセッツ州ジェール;ドパゾ、J;ラッテイ、T;コネーサ、A (2011 年 4 月 1 日)。 「B2G-FAR、種中心の GO アノテーション リポジトリ」。バイオインフォマティクス。27 (7): 919–24。土井：10.1093/bioinformatics/btr059。PMC 3065692。PMID 21335611。
- ^ Altschul, SF; Gish, W; Miller, W; Myers, EW; Lipman, DJ (1990 年 10 月 5 日). 「基本的なローカルアラインメント検索ツール」. Journal of Molecular Biology . 215 (3): 403–10. doi :10.1016/S0022-2836(05)80360-2. PMID 2231712. S2CID 14441902.
- ^ 遺伝子オントロジーコンソーシアム (2008 年 1 月)。「2008 年の遺伝子オントロジープロジェクト」。Nucleic Acids Res . 36 (データベース号): D440–4。doi : 10.1093 /nar/gkm883。PMC 2238979。PMID 17984083。