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BitterDBは、ヒトに苦味があると報告された化合物のデータベースです。[ 1 ] BitterDBデータベースの目的は、苦味のある天然および合成化合物と、それらに対応する苦味受容体（T2RまたはTAS2R）に関する情報を収集することです。[ 2 ]
BitterDBには、ヒトが苦味を感じると報告されている670種類以上の化合物が収録されています。これらの化合物は、名称、化学構造、他の苦味化合物との類似性、特定のヒト苦味受容体との関連性、その他の特性などで検索できます。また、このデータベースには、苦味化合物による受容体活性化に影響を与えることが示されている苦味受容体の変異に関する情報も含まれています。
BitterDB には現在、文献で苦味があると記載されている 670 を超える化合物が収録されています。各化合物について、データベースには分子特性、化合物の苦味に関する参考文献、化合物の苦味のカテゴリーに関する追加情報 (例:「ほろ苦い」または「やや苦い」の注釈)、さまざまな化合物識別子 ( SMILES、CAS登録番号、IUPAC系統名)、化合物が天然由来か合成かの表示、化合物のPubChemエントリへのリンク、ダウンロード用のさまざまなファイル形式 (sdf、画像、smiles) に関する情報が提供されています。200 を超える苦味化合物が、対応するヒトの苦味受容体と実験的に関連付けられています。これらの化合物について、BitterDB は、これらのリガンドと受容体の相互作用を示す出版物へのリンク、受容体活性化の有効濃度および/またはEC50値、BitterDB 内の関連する苦味受容体エントリへのリンクなどの追加情報を提供しています。
苦味化合物は、さまざまな方法で検索および閲覧できます。たとえば、「詳細検索」オプションを使用すると、特定の物理的特性の組み合わせや、関連するヒトの苦味受容体の組み合わせなど、さまざまな条件に合致する化合物を検索できます。検索オプションに加えて、ユーザーはBitterDBに登録されているすべての化合物を一覧表示したソート可能な表を閲覧することもできます。
BitterDBには、既知のヒトの苦味受容体25種類に関するデータが含まれています。各受容体について、いくつかの特性が表示されます。苦味受容体は、名称、既知のリガンド、UniProtアクセッション番号など、さまざまな基準で検索できます。すべての苦味受容体とその情報を示す表を使用することで、ユーザーは受容体に関連付けられた苦味リガンドの数など、さまざまなオプションで閲覧および並べ替えを行うことができます。
BitterDBには、クエリ配列と様々なヒト苦味受容体との局所的な類似性を判断するローカルBLASTサービスと、25種類のヒト苦味受容体のグローバルアライメントという2つの追加機能があります。このアライメントはClustalW2を使用して生成され、TOPCONSサーバーによって予測された各受容体の二次構造を表示します。
BitterDBには「アップロード」機能があり、ユーザーは苦味成分に関する情報を投稿できます。投稿されたデータは著者によって審査され、データベースにアップロードされます。ユーザーはメーリングリストに登録することで、データベースの更新情報を受け取ることができます。