アビベース

Avibase は、鳥類の分類と分布に関するデータを世界規模で整理するオンライン分類データベースです。このデータベースは、分類名^[3]ではなく、分類概念^{[1] [2]}という概念に基づいています。Avibaseは、主要な鳥類分類出版者 ( The Clements Checklist of Birds of the World、^[4] Handbook of the Birds of the World、BirdLife International、^[5] IOC Checklist ^[6]およびHoward and Moore Complete Checklist of the Birds of the World ^[7] ) およびその他の地域情報源 (例: 1886 年以降のアメリカ鳥類学会チェックリスト北米鳥類全版) からの分類データを統合し、整理しています。230 を超えるさまざまな分類情報源の分類概念が、Avibase の概念にマッピングされ、相互参照されています。

このウェブサイトでは、世界の 20,000 を超える地理的地域のチェックリスト、分類情報と同義語が記載された種のページ、観察者が独自の観察記録を管理し、対象種がいる国やeBirdホットスポットを示す地図などのレポートを取得するためのツールも提供しています。

Avibaseは、現在Birds Canadaのデータサイエンスおよびテクノロジーのシニアディレクターを務めるDenis Lepageによって作成され、管理されています。Avibaseに含まれるデータは、1991年頃から収集されてきました。^[8] Avibaseのウェブサイトは2003年6月に開始され、設立当初からBirds Canada（旧Bird Studies Canada）によってホストされています。

分類概念。データベースは主に、固有の分類概念の表を中心に構成されています。分類概念は、特定の種名に比べてより柔軟な方法で、データベース内で類似の分類群をグループ化する方法です。^{[9] [10] [11]}各概念は固有の生物学的範囲を表し、Avibase IDと呼ばれる固有の英数字IDが割り当てられています。Avibase IDにより、出版元間で一致する分類概念を追跡できます。Avibaseには約58,000の固有の分類概念が記載されています。これらには、種や亜種として伝統的に認識されている概念だけでなく、他の分類グループ（亜種グループ）、歴史的に認識されているさまざまな代替分類処理、および雑種、色変異、無効または疑わしい形態を 表す他の概念も含まれます。

命名データ。各学名は、引用データと元の説明に関連付けられた名前を含むように記述されています。Avibase には約 87,000 の学名が収録されており、さまざまな種類の同義語も利用できます。

地域別種チェックリストは、世界の 20,000 以上の地域で利用可能です。これには、すべての国、領土、従属国、およびGADM の地方レイヤーで定義されているほとんどの地域 (州、県、郡、部門、市町村、地区 (GADM レベル 1 および 2))、および 2,500 以上の島が含まれます。地域別チェックリストは、いくつかの分類形式で利用可能で、さまざまな言語の一般名を組み込むことができます。地域別チェックリストのデータは、eBird EBD データセットや Facebook Global Rare Bird Alert などのフォーラムなど、複数のソースから取得されます。

一般名と同義語は271 の異なる言語と地域変種で利用可能であり、一般名が知られている種の 85% 以上をカバーしている言語は 21 あります。

2013 年に開始されたMyAvibaseは、ユーザーがライフリストを維持し、観察者がまだ見ていない対象種や一般的な地域統計 (国別の種の総数など) を見つけることに重点を置いたレポートを生成するための無料ツールを提供します。

• ミッチ、レスリー (2004)、「ワシとスズメの挑戦」、サイエンス、304 :935、doi :10.1126/science.304.5673.935c、JSTOR  3836936、S2CID  220095931

• Lepage, Denis; Vaidya, Gaurav; Gulralnick, Robert (2014)、「Avibase – 分類概念の管理と整理のためのデータベース システム」、ZooKeys (420): 117–135、Bibcode :2014ZooK..420..117L、doi : 10.3897/zookeys.420.7089、PMC  4109484、PMID  25061375

• 名前には何がある? 生物学的な名前の意味の変化、Pensoft Publishers、2014年

• レムセン、デイビッド（2016）、「生物情報学における学名の使用と限界」、ZooKeys（550）：207–223、Bibcode：2016ZooK..550..207R、doi：10.3897/zookeys.550.9546、PMC  4741222、PMID  26877660

• ディキンソン、エドワード C. (2016)、「鳥類学命名法の基礎の強化: シャーボーンおよびリッチモンドの書誌調査の歴史的遺産におけるギャップの解消」、ZooKeys (550): 107–134、Bibcode :2016ZooK..550..207R、doi : 10.3897/zookeys.550.9546、PMC  4741222、PMID  26877660

• スターナー、ベケット; フランツ、ニコ M. (2017)、「人間またはコンピューターの分類法? ビッグデータの認知語用論」、生物学理論、12 (2): 99–111、doi :10.1007/s13752-017-0259-5、S2CID  90423947

• Christidis, Les; Garnett, Stephen T. (2017)、「分類学の無秩序が保全を妨げる」、Nature、546 (7656): 25–27、Bibcode :2017Natur.546...25G、doi : 10.1038/546025a、PMID  28569833

• Vaidya, Gaurav; Lepage, Denis; Gulralnick, Robert (2018)、「分類修正プロセスのテンポとモード: 分類学者は過去 127 年間にわたって北米の鳥類をどのように修正および再修正してきたか」、PLOS One、13 (4): e0195736、Bibcode :2018PLoSO..1395736V、doi : 10.1371/journal.pone.0195736、PMC  5909608、PMID  29672539

Wikidata には次のプロパティがあります:

• Avibase 分類群 ID (P2026) (用途を参照)

• 公式サイト