ベルギーの漫画家エドガー・P・ジェイコブスによる『アトランティスの謎』 (原題: l'Énigme de l'Atlantide )は、ブレイクとモーティマーシリーズの7作目の漫画で、1955年3月30日から1956年5月30日までタンタン誌に連載された。単行本としては1957年に刊行された。
アゾレス諸島の洞窟奥深くでの洞窟探検中、ブレイクとモーティマーは宿敵オルリックに阻まれ、ガスが充満する洞窟に閉じ込められてしまう。絶体絶命の危機を生き延びた二人は、アトランティスの生存者の子孫だと名乗る、高度な技術を持つ種族に捕らえられる。そして、賢明なバシレウスを打倒し、現代のアトランティスを率いて地上世界を征服しようとするマゴン司令官の陰謀に巻き込まれた二人は、マゴンの誇大妄想的な計画を阻止するため、イカロス皇太子と手を組む。しかし、その結末は未知数だった。
フィリップ・モーティマー教授は、アゾレス諸島のサンミゲル島で休暇を過ごし、洞窟探検をすることにした。地元の人々が「オ・フロ・ド・ディアボ(悪魔の洞窟)」と呼ぶ穴を探検している最中、放射性岩を発見し、プラトンが言及したオリハルコン、つまり伝説の文明アトランティスの謎の金属、波に飲み込まれたとされるアトランティスとの関連性に気づかずにはいられなかった。そこで彼はフランシス・ブレイク船長に連絡を取り、一緒にこの洞窟をさらに探検することにした。しかし、二人はすぐに、この件に興味を持っているのは自分たちだけではないことに気づく。実際、モーティマーからブレイク宛の手紙を傍受した外国勢力が、この潜在的な核エネルギー源に興味を持ち、オルリックという男を雇って岩を回収させようとしていたのだ。オルリックは現地の人間に変装し、ブレイクとモーティマーの探検に同行することに成功した。オルリックはオリハルコンを回収することはできなかったものの、ブレイクとモーティマーを洞窟に閉じ込めることに成功した。硫黄の煙に追い出された二人の友人は、別の出口を見つけようとトンネルの奥へと進むことを余儀なくされる。幾度となく死の危機を脱した後、彼らは大量のオリハルコンを発見するが、やがて放射線に被曝し、姿を消してしまう。
目覚めると、彼らは完全に回復しているだけでなく、洞窟を出て未来的な世界にいることに気づく。彼らはバシレウスと呼ばれる場所の長のもとに連れて行かれる。彼らはこの場所で生涯を終えるよう宣告される。ブレイクとモーティマーは、イケアという王子の保護下に置かれ、状況の説明を受ける。彼らはアトランティスにいるのだ。実際、12,000年前、アトランティスは大西洋の真ん中の島から世界を支配していた。しかし、地球と巨大な天体の衝突により、大陸の海岸と島が水没した。アトランティス文明のわずかな生存者は、地球の奥深くに新しい秘密のアトランティスを建設することを決めた。それ以来、オリハルコンを構成する膨大なエネルギー源のおかげで、地上の住民よりもはるかに進化したアトランティス人は、地球人が空飛ぶ円盤と呼ぶものを使って地球の表面を監視している。
ブレイクとモーティマーがアトランティスの首都ポセイドポリスで新たな生活を始めた矢先、彼らは暗殺未遂事件に巻き込まれる。その後、イカロスはアトランティスが深刻な危機に瀕していることを知らされる。イカロスは疑念を確かめるため、二人の地球人を伴って、アトランティス王国と蛮族を隔てる大門へと密かに向かった。蛮族とは、かつてアトランティスに住み、地下に暮らしていた野蛮人の子孫たちであり、反乱を企てた結果、大門の向こう側の領域に追放された人々である。
3人の男が警戒するのも無理はない。マゴンという名のフウラコンタルクは、野蛮人の助けを借りてバシレウスを打倒し、地球の表面を侵略しようとする陰謀の首謀者だからだ。イカロスの出発を知り、計画が露見することを恐れたマゴンは、船を破壊しようとするが、ブレイク、モーティマー、イカロスは生き延びる。彼らはついに聖なるゴングに到着する。そこはかつてポセイドポリスを野蛮人の攻撃から守るために使われていた大きな門と塔の上にある。その時、マゴンと陰謀者の護衛が、野蛮人の王トララクを訪ねるためにこの場所を通ってやってくる。トララクは、洞窟で転落して王宮にたどり着いたオルリクの推薦によるもので、オルリクはこの地位を人間に復讐する機会と捉えていた。しかし、マゴンとトララクが同盟の条件について話し合っている間に、ブレイク、モーティマー、イカロスが現れ、聖なるゴングでマゴンの護衛隊員になりすましていた。3人の友人は逃げ出し、分かれて行動した。ブレイクはポセイドポリスに直接警告しようとし、モーティマーとイカロスは低い道を進む。内海でブレイクは首都へ向かうために船を盗むが、台風に巻き込まれ、出発地点に戻され、陰謀者たちに捕らえられてしまう。一方、モーティマーとイカロスは、オルリックによって殺された弟の復讐を望む蛮族キシンの助けを借りて、蛮族の儀式の出発地点に身を隠す。彼らは聖なるゴングにたどり着き、そこで囚われの身となっていたブレイクを見つけ、モーティマーはなんとかゴングを鳴らす。
3人の友人はポセイドポリスの航空機に飛び立つが、攻撃は既に始まっていた。首都に到着すると、陰謀者たちがアトランティス人の武器を破壊したため、都市は既に蛮族に半分侵略されていた。宮殿では、マゴンがついにバシレウスに対するクーデターを公表し、トララク王とオルリックが蛮族の大群を引き連れて司令室に入ってくる。バシレウスにとって全てが失われたかに見えたその時、ブレイク、モーティマー、イカロスが秘密の通路を通って宮殿にたどり着き、立ち上がる。この邪魔者たちを始末しようとしたオルリックは、誤って海をせき止めていた水門を開けてしまう。アトランティスは失われる。バシレウスは、長い間計画されていた大規模な避難、つまり宇宙船の大艦隊でアトランティス人を別の惑星へ出発させることを決意する。アトランティスが他の空域と合流する準備を進める一方、野蛮人、トララク、マゴン、オルリクは上昇する海水に立ち向かう。ブレイクとモーティマーは解放され、イカロスが遠隔操縦する潜水艦によって避難する。地上に戻った彼らは、セテ・シダーデスのカルデラで、アトランティスの船団の壮大な出航を見送る。
『アトランティス・ミステリー』は、1990年にコムキャット・コミックス社から英語で出版された。翻訳はドワイト・デッカー、編集はベルント・メッツとジャン=ジャック・シュルベックが担当した。
その後、2012年1月にCinebook Ltd.によって再発売された。
1997年には、テレビドラマシリーズ「ブレイク&モーティマー」として脚色された。