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アンソニー・パグデンは、ジョン・ブライアン・ダーマー・パグデンとジョーン・メアリー・パグデンの息子です。パグデン氏は、チリのサンティアゴにあるグランジ・スクールとロンドンのウェストミンスター・スクールで教育を受けました。 1964年から1967年までバルセロナ大学に通いました。 1967年から1969年までは、トリアノン・プレス（パリ）でアシスタント編集者として働き、フリーランスの翻訳者としても活動しました。また、1967年と1968年にはキプロスにも滞在しました。1969年にオックスフォード大学オリエル・カレッジに入学し、ペルシア語とアラビア語を専攻しましたが、翌年には歴史とスペイン語に専攻を変更しました。1972年に学士号（最優等）を取得し、デ・オスマ奨学金を授与されました。1979年に修士号（オックスフォード大学）、1980年に博士号（オックスフォード大学）を取得しました。
彼は、ウースター・カレッジの上級研究員、マートン・カレッジのジュニア研究員、ウォーバーグ研究所の上級研究員を務め、1980年から1997年まではケンブリッジ大学で講師、その後知的歴史の准教授を務め、 1980年から1983年まではガートン・カレッジ、1985年から1997年まではキングス・カレッジのフェローであった。1997年には、ジョンズ・ホプキンス大学のハリー・C・ブラック歴史学教授に就任し、 JGA・ポコックの後任となった。彼はまた、ワシントンDCの高等国際問題研究大学院で国際関係論（グローバル理論と歴史）の教授講師を務めた。プリンストン高等研究所、イタリア・フィレンツェの欧州大学院大学、サンティアゴ・デ・コンポステーラ大学、デンマーク・オーフス大学文化研究センター、ハーバード大学、ビルバオ・ビスカヤ銀行哲学客員教授としてマドリード国立遠隔教育大学、ミシガン大学人文科学研究所、パリ社会科学高等研究院で客員教授を務めた。現在は、カリフォルニア大学ロサンゼルス校の政治学部と歴史学部の特任教授である。彼は作家で古典学者のジュリア・シッサと結婚しており、前妻との間にフェリックス・アレクサンダー・ザビエル・パグデン＝ラトクリフ（1990年生まれ）とセバスチャン・ジョージ・アウレリアン・パグデン＝ラトクリフ（1994年生まれ）という2人の子供がいる。