アンドレ・フランケ

アンドレ・フランケ
生まれる	( 1978-10-16 )1978年10月16日（46歳）
市民権	ドイツ、アメリカ
職業	遺伝学者、学者、大学教授
学歴
教育	生物学の学位、遺伝学のレルム・ナチュラリウム博士
母校	クリスチャン・アルブレヒト・キール大学
論文	炎症性腸疾患に関する系統的ゲノムワイド関連解析（2006）
学術研究
機関	キールのクリスチャン アルブレヒト大学 (CAU) およびシュレースヴィヒ ホルシュタイン大学医療センター、キール キャンパス

アンドレ・フランケは1978年10月16日生まれの遺伝学者、学者、大学教授である。キール・クリスチャン・アルブレヒト大学の分子医学のW3教授であり、臨床分子生物学研究所のマネージングディレクターでもある。^[1]

フランケは遺伝学、ゲノムワイド関連研究、マイクロバイオーム、内科研究の分野で最もよく知られています。彼はバイオインフォマティクスの発展を新しい技術や慢性炎症性疾患と統合し、さまざまな複雑な疾患や形質の遺伝子構造を研究してきました。^[2]

フランケはキールのクリスチャン・アルブレヒト大学に入学し、2003年に生物学の学位を取得して卒業した。^{[3] 2004年から2006年まで、シュテファン・シュライバーとトーマス・CG・ボッシュの指導の下、臨床分子生物学研究所の}博士課程で複雑な疾患の遺伝学の研究を行った。彼の学位論文のタイトルは「炎症性腸疾患の系統的ゲノムワイド関連解析」であった。^[4]

フランケは、博士号取得と短期間のポスドクを経て、 2008年から2011年までDFG Cluster of Excellence 306の資金提供を受けて上皮バリア疾患の助教授として学術キャリアをスタートしました。 ^[5]

フランケはリチャード・S・ブルンバーグの指導を受けながら、 2011年にボストンのMITとハーバード大学のブロード研究所で客員研究員も務めた。^[6]彼はW3の教授に昇進し、2016年からこの職に就いている。^[7]

フランケは2011年以来、臨床分子生物学研究所の所長を務めている。^[8]

フランケは730以上の論文を執筆しており、Web of Scienceのh指数は110である。 ^[9]彼の研究対象は、遺伝学/ゲノミクス/免疫遺伝学、バイオインフォマティクス、ヒトマイクロバイオーム、ハイスループットシーケンシング技術などである。彼はゲノムワイド関連研究、一塩基多型に基づく解析、複合疾患に取り組んできた。彼は遺伝子構造、遺伝的変異性、集団遺伝学の側面を研究してきたが、彼の主な疾患の焦点はクローン病や潰瘍性大腸炎などの炎症性腸疾患であった。その他の研究対象は乾癬や原発性硬化性胆管炎である。^{[2] [10]}

フランケのゲノムワイド関連研究は、主にクローン病や潰瘍性大腸炎などの炎症性疾患の感受性遺伝子の特定に焦点を当てていました。2006年の博士課程では、クローン病患者と対照者を対象とした症例対照パネルで、非同義SNPのゲノムワイド関連スキャンを初めて実施しました。ATG16L1におけるクローン病関連コーディングSNPの特定により、クローン病患者ではオートファジーが障害されている重要な経路であることが説明されました。^[11]クローン病のゲノムワイド関連メタ分析と複製研究を実施した2010年の研究では、この疾患に関連する71の新しい遺伝子座が特定され、炎症性腸疾患の遺伝子構造がさらに完成しました。^[12]その後、フランケは国際IBD遺伝学コンソーシアム（IIBDGC）に参加し、管理委員会に所属しています。^[13]

フランケは、ヨーロッパ系、東アジア系、インド系、イラン系の人々を含むIBDに関する体系的な民族間関連研究を行った。従来のゲノムワイド関連解析に加えて、^[14]彼はまた、異なる民族のIBDコホートにおけるヒト白血球抗原（HLA）領域を体系的に調査した。^[15]

フランケは乾癬の遺伝学も研究しており、この疾患に関する遺伝的関連研究をいくつか実施しました。^[16] 追加の研究は、乾癬患者の乾癬性関節炎発症のリスク評価に焦点を当てており、乾癬のサブタイプ間の根本的な遺伝的差異が個別のサブタイプのリスク評価に使用できることを強調しています。^[17]彼はまた、胆石疾患の遺伝子変異を特定することを目的とした研究にも貢献しました。民族的に異なる集団における転写マッピング、変異検出、および関連分析を通じて、rs11887534 (ABCG8-D19H) が疾患関連因子として特定されました。^[18]

2020年、コロナウイルス流行の第一波の際に、フランケはSARS-CoV-2に対する遺伝的感受性を調査し、病気の重症度などCOVID-19の変異と発症に寄与する遺伝的要因の特定も試みた。^[19] COVID-19に関するこの初のゲノムワイド関連研究では、ABO式血液型システムがSARS-CoV-2感染の感受性の要因として特定された一方、染色体3p21.31上の遺伝子クラスターの変異が病気の重症度の重要な要因であることが判明した。^[20]

^{フランケはさらに遺伝子研究を調整し、慢性静脈疾患[21]}と痔疾患（この疾患の最初の102の疾患遺伝子座）の最初の疾患遺伝子の特定につながった。 ^[22]

彼はその後、当時は培養を必要としない配列ベースの分析で分析可能だったマイクロバイオームの配列分析に注力した。ニューヨークのドイツ研究イノベーションセンターとのインタビューで、彼は現在の研究が「宿主とマイクロバイオームの相互作用に関与している可能性のあるヒトゲノム内の関連遺伝子」を特定することを目指していると述べた。^[10]重要な科学的貢献は、宿主と細菌の相互作用に関与するヒトゲノム内のさまざまな遺伝子と変異体の特定につながった初のマイクロバイオームゲノムワイド関連研究 (mGWAS) である。これらの研究で発見された重要な遺伝子は、ビタミン D 受容体 (VDR) と ABO 血液型遺伝子である。^{[23] [24] [25]}

• 2008 – ヘンゼル賞、CAU キール^[26]
• 2011年 – ヤンセン賞、ヤンセン皮膚科学^[27]
• 2011 – W2 ピーター・ハンス・ホフシュナイダー寄付教授職、実験生物医学財団
• 2012年 – ルートヴィヒ・デムリング研究賞、ドイツクローン病・大腸炎財団^[28]
• 2017年 – タンハウザー賞、DGVS（ドイツ消化器・代謝疾患学会）^{[29] [30]}
• 2017年 – シュレスヴィヒ＝ホルシュタイン州エクセレンスチェア、エクセレンスクラスター「界面における炎症」^[31]
• 2020 – ピーターセン財団イノベーション・トランスファー賞

• Hampe, J., Franke, A., Rosenstiel, P., Till, A., Teuber, M., Huse, K., ... & Schreiber, S. (2007). 非同義SNPのゲノムワイド関連スキャンにより、ATG16L1におけるクローン病の感受性変異が特定される。Nature genetics, 39(2), 207–211.
• Franke, A., McGovern, DP, Barrett, JC, Wang, K., Radford-Smith, GL, Ahmad, T., ... & Parkes, M. (2010). ゲノムワイドメタアナリシスにより、クローン病感受性遺伝子座の確認数が71に増加。Nature genetics, 42(12), 1118–1125.
• Fischer, U., Forster, M., Rinaldi, A., Risch, T., Sungalee, S., Warnatz, HJ, ... & Yaspo, ML (2015). 致死的なTCF3-HLF−陽性急性リンパ性白血病のゲノム解析と薬剤プロファイリングにより再発性変異パターンと治療オプションが特定される。Nature genetics, 47(9), 1020–1029.
• Wang, J., Thingholm, LB, Skiecevičienė, J., Rausch, P., Kummen, M., Hov, JR, ... & Franke, A. (2016). ゲノムワイド関連解析により、腸内細菌叢に影響を与えるビタミンD受容体およびその他の宿主因子の変異が特定されました。Nature genetics, 48(11), 1396–1406.
• 重症COVID-19 GWASグループ。(2020) 呼吸不全を伴う重症COVID-19のゲノムワイド関連研究。ニューイングランド医学ジャーナル、383(16)、1522–1534。
• Rühlemann, MC, Hermes, BM, Bang, C., Doms, S., Moitinho-Silva, L., Thingholm, LB, ... & Franke, A. (2021). 8,956人のドイツ人を対象としたゲノムワイド関連研究により、ABO組織血液型が腸内細菌叢に与える影響が特定されました。Nature Genetics, 53(2), 147–155.