アルドケト還元酵素

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1a80 , 1abn , 1ads , 1ae4 , 1afs , 1ah0 , 1ah3 , 1ah4 , 1az1 , 1az2 , 1c9w , 1cwn , 1dla , 1ef3 , 1eko , 1el3 , 1exb , 1frb , 1gve , 1hqt , 1hw6 , 1iei , 1ihi , 1j96 , 1jez , 1k8c , 1lqa , 1lwi , 1m9h , 1mar , 1mi3 , 1mrq , 1mzr , 1og6 , 1pwl , 1pwm , 1pyf , 1pz0 , 1pz1 、1q13 、1q5m 、1qrq 、1qwk 、1r38 、1ral 、1ry0 、1ry8 、1s1p 、1s1r 、1s2a 、1s2c 、1sm9 、1t40 、1t41 、1ur3 、1us0 、1vbj 、1vp5 、1x96 、1x97 、1x98 、1xf0 、1xgd 、1xjb 、1ye4 、1ye6 、1z3n 、1z89 、1z8a 、1z9a 、1zgd 、1zq5 、1zsx 、2a79 、2acq 、2acr 、2acs 、2acu 、2agt 、2alr 、2bgq 、2bgs 、2bp1 、2c91 、2clp 、2dux 、2duz 、2dv0 、2f2k 、2f38 、2fgb、2fvl、2fz8、2fz9、2fzb、2fzd、2hdj、2he5、2he8、2hej、2hv5、2hvn、2hvo、2i16、2i17、2ikg、2ikh、2iki、2iq、2ine、2inz、2ipf、2ipg、2ipj、2ipw、2iq0、2iqd、2is7、2isf、2j8t、2nvc、2nvd、2p5n、2pd5、2pd9、2pdb、2pdc、2pdf、 2pdg、2pdh、2pdi、2pdj、2pdk、2pdl、2pdm、2pdn、2pdp、2pdq、2pdu、2pdw、2pdx、2pdy、2pev、2pf8、2pfh、2pzn、2qxw、2r9r、2vdg、3bcj、3bur、3buv、3bv7、3c3u、3cmf、3cot、3eau

アルド/ケト還元酵素ファミリー
アルド/ケト還元酵素ファミリー
	NADP+、クエン酸、および小分子阻害剤IDD594と複合体を形成したヒトアルドース還元酵素のリボン図。PDBより：1us0 。
識別子
シンボル	アルド・ケトレッド
パム	PF00248
インタープロ	著作権
プロサイト	PDOC00061
SCOP2	1広告 / スコープ / SUPFAM
医療機器	cd06660
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1a80 , 1abn , 1ads , 1ae4 , 1afs , 1ah0 , 1ah3 , 1ah4 , 1az1 , 1az2 , 1c9w , 1cwn , 1dla , 1ef3 , 1eko , 1el3 , 1exb , 1frb , 1gve , 1hqt , 1hw6 , 1iei , 1ihi , 1j96 , 1jez , 1k8c , 1lqa , 1lwi , 1m9h , 1mar , 1mi3 , 1mrq , 1mzr , 1og6 , 1pwl , 1pwm , 1pyf , 1pz0 , 1pz1 、1q13 、1q5m 、1qrq 、1qwk 、1r38 、1ral 、1ry0 、1ry8 、1s1p 、1s1r 、1s2a 、1s2c 、1sm9 、1t40 、1t41 、1ur3 、1us0 、1vbj 、1vp5 、1x96 、1x97 、1x98 、1xf0 、1xgd 、1xjb 、1ye4 、1ye6 、1z3n 、1z89 、1z8a 、1z9a 、1zgd 、1zq5 、1zsx 、2a79 、2acq 、2acr 、2acs 、2acu 、2agt 、2alr 、2bgq 、2bgs 、2bp1 、2c91 、2clp 、2dux 、2duz 、2dv0 、2f2k 、2f38 、2fgb、2fvl、2fz8、2fz9、2fzb、2fzd、2hdj、2he5、2he8、2hej、2hv5、2hvn、2hvo、2i16、2i17、2ikg、2ikh、2iki、2iq、2ine、2inz、2ipf、2ipg、2ipj、2ipw、2iq0、2iqd、2is7、2isf、2j8t、2nvc、2nvd、2p5n、2pd5、2pd9、2pdb、2pdc、2pdf、 2pdg、2pdh、2pdi、2pdj、2pdk、2pdl、2pdm、2pdn、2pdp、2pdq、2pdu、2pdw、2pdx、2pdy、2pev、2pf8、2pfh、2pzn、2qxw、2r9r、2vdg、3bcj、3bur、3buv、3bv7、3c3u、3cmf、3cot、3eau

アルドケト還元酵素ファミリーは、16のカテゴリーに分類されるタンパク質ファミリーであり、アルデヒド還元酵素、アルドース還元酵素、プロスタグランジンF合成酵素、キシロース還元酵素、ロークリスタリンなど、関連するモノマーNADPH依存性酸化還元酵素が多数含まれています。^[1]

構造

いずれも類似の構造を持ち、ヌクレオチド結合タンパク質に特徴的なβ-α-βフォールドを持つ。^[2]このフォールドは平行なβ-8/α-8バレルから成り、新しいNADP結合モチーフを含む。結合部位はβシートのC末端にある大きく深い楕円形のポケットに位置し、基質は伸長した構造で結合する。ポケットの疎水性により、高極性基質よりも芳香族基質や無極性基質が有利となる。^[3]

NADPH補酵素の結合は大規模な構造変化を引き起こし、ループの向きを変え、補酵素を効果的に所定の位置に固定します。この結合はNAD(P)結合酸化還元酵素よりもFAD結合酸化還元酵素に似ています。^[4]

例

このファミリーのいくつかのタンパク質にはカリウムチャネルβ鎖調節ドメインが含まれており、これらは酸化還元酵素活性を持つことが報告されている。^[5]

参照

参考文献

^ Bohren KM、Bullock B、Wermuth B、Gabbay KH (1989年6月)。「アルドケト還元酵素スーパーファミリー。ヒトアルデヒドおよびアルドース還元酵素のcDNAと推定アミノ酸配列」。J . Biol. Chem . 264 (16): 9547–51。doi : 10.1016 / S0021-9258 (18)60566-6。PMID 2498333。
^ Schade SZ、Early SL、Williams TR、Kézdy FJ、Heinrikson RL、Grimshaw CE、Doughty CC (1990 年 3 月)。「ウシ水晶体アルドース還元酵素の配列分析」。J . Biol. Chem . 265 (7): 3628–35. doi : 10.1016/S0021-9258(19)39639-5 . PMID 2105951。
^ Wilson DK、Bohren KM、Gabbay KH 、 Quiocho FA（1992年7月）。「糖尿病合併症に関与するヒトアルドース還元酵素ホロ酵素の1.65Å構造におけるありそうもない糖基質部位」。Science。257 （ 5066）：81–4。doi ：10.1126/science.1621098。PMID 1621098 。
^ Borhani DW、Harter TM、Petrash JM (1992 年 12 月)。「アルドース還元酵素と NADPH の二成分複合体の結晶構造」。J . Biol. Chem . 267 (34): 24841–7. doi :10.2210/pdb1abn/pdb. PMID 1447221。
^ Gulbis JM、Zhou M、Mann S、MacKinnon R (2000 年 7 月)。「電圧依存性 K+ チャネルの細胞質ベータサブユニット T1 アセンブリの構造」。Science . 289 ( 5476): 123–7。Bibcode : 2000Sci ...289..123G。doi : 10.1126/science.289.5476.123。PMID 10884227 。

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[pmid2498333-1] Bohren KM、Bullock B、Wermuth B、Gabbay KH (1989年6月)。「アルドケト還元酵素スーパーファミリー。ヒトアルデヒドおよびアルドース還元酵素のcDNAと推定アミノ酸配列」。J . Biol. Chem . 264 (16): 9547–51。doi : 10.1016 / S0021-9258 (18)60566-6。PMID 2498333。

[pmid2105951-2] Schade SZ、Early SL、Williams TR、Kézdy FJ、Heinrikson RL、Grimshaw CE、Doughty CC (1990 年 3 月)。「ウシ水晶体アルドース還元酵素の配列分析」。J . Biol. Chem . 265 (7): 3628–35. doi : 10.1016/S0021-9258(19)39639-5 . PMID 2105951。

[pmid1621098-3] ^ Wilson DK、Bohren KM、Gabbay KH 、 Quiocho FA（1992年7月）。「糖尿病合併症に関与するヒトアルドース還元酵素ホロ酵素の1.65Å構造におけるありそうもない糖基質部位」。Science。257 （ 5066）：81–4。doi ：10.1126/science.1621098。PMID 1621098 。

[pmid1447221-4] Borhani DW、Harter TM、Petrash JM (1992 年 12 月)。「アルドース還元酵素と NADPH の二成分複合体の結晶構造」。J . Biol. Chem . 267 (34): 24841–7. doi :10.2210/pdb1abn/pdb. PMID 1447221。

[pmid10884227-5] Gulbis JM、Zhou M、Mann S、MacKinnon R (2000 年 7 月)。「電圧依存性 K+ チャネルの細胞質ベータサブユニット T1 アセンブリの構造」。Science . 289 ( 5476): 123–7。Bibcode : 2000Sci ...289..123G。doi : 10.1126/science.289.5476.123。PMID 10884227 。