| コンテンツ | |
|---|---|
| 説明 | 高齢化研究のための非営利オープンアクセス知識管理システム |
| 接触 | |
| 著者 | アレックス・ザボロンコフ、チャールズ・カントール、コンスタンチン・ロマンツォフ、イーライ・モハマド、ゼリカ・スミット=マクブライド、オルガ・コボロワ、アントン・コレソフ、ヴァルバラ・コノヴァ、キリル・アリャヴディン、パベル・ポリアコフ、クリス・スメリク、デヴィッド・アスプレイ、ドミトリー・イワノフ、グリゴリー・ヴァイガント、ラッセル・ハン、ジェーン・ヤン、ヴァシリーサ・ルドネワ、ヴァレリヤ・コレスニコワ |
| 主要引用文献 | PMID 21799912 |
| 発売日 | 2011年2月24日 |
| アクセス | |
| Webサイト | http://www.agingportfolio.org/ |
| その他 | |
| ライセンス | クリエイティブ・コモンズ 表示ライセンス3.0 |
| バージョン | ベータ |
国際老化研究ポートフォリオ(IARP)は、自然科学および社会・行動科学分野の助成金、出版物、会議を網羅した、非営利のオープンアクセス型知識管理システムです。高度な検索機能と視覚的なトレンド分析ツールに加え、老化研究に関連するカテゴリに分類された研究プロジェクトのディレクトリも備えています。このシステムは、機械学習の要素を取り入れた自動分類アルゴリズムを用いて、研究プロジェクトを適切なカテゴリに分類します。ディレクトリは、多くの専門家であるカテゴリ編集者と科学諮問委員会のメンバーによって管理されています。科学諮問委員会の委員長は、チャールズ・カントール博士です。
加齢研究は、自然科学、社会科学、行動科学など多岐にわたる分野にまたがる学際的な分野であり、研究データは広範囲に分散している。PubMedやGoogle Scholarといった一般的なリソースでは、過去の論文だけでなく最新の論文の抄録や全文にもアクセスできる。しかし、国際的な科学論文データベース、研究助成金の抄録、臨床試験データベースを統合したリソースはほとんど存在しない。
研究助成金の概要は通常、資金提供機関によって公表され、査読付き学術誌への論文掲載に先立って公開されます。助成金概要に記載されている実験の中には、失敗に終わったり、査読付き論文として発表されなかったりするものもあります。重複を避け、科学協力を促進するためには、世界中で入手可能なすべての助成金情報を閲覧し、類似のプロジェクトが資金提供を受けているかどうかを確認することが重要です。
IARPデータベースは、複数の情報源からの研究助成金、査読付き論文、および発行済み特許出願に関する情報を統合しています。さらに、このデータベースは、柔軟なプロジェクト分類メカニズムと、プロジェクトの関連性や傾向を分析するためのツールを活用しています。このシステムにより、研究者は中央集約型のプロジェクトデータベースを検索し、老朽化したプロジェクトを分類・整理し、複数の研究分野にわたる資金調達状況を分析することができます。IARPは、限られた研究資金の配分と優先順位付けを改善し、プロジェクトの重複を減らし、科学的協力を促進することで、急速に発展している研究分野における科学的・医学的進歩を加速させることを目的としています。
IARPシステムは、米国国立衛生研究所(NIH)、欧州委員会(EC)、カナダ保健研究機構、米国国立科学財団、オーストラリア国立保健医療評議会など、多くの情報源からの助成金データと、 MEDLINEデータベースのライセンスを通じた出版物抄録データを集約しています。データベースは検索可能で、結果は傾向分析のためにチャートやグラフとして表示できます。IARPシステムの主な機能の1つは、研究プロジェクトを構造化されたディレクトリに自動および手動で分類することです。IARP科学諮問委員会とボランティアの専門家カテゴリ編集者が、データベースからプロジェクトを関連するカテゴリに分類します。これらの手動で分類されたプロジェクトは、機械学習の要素を含む自動分類アルゴリズムのトレーニングセットになります。IARPシステムは高度にモジュール化され、移植性が高く、老化研究のための他の知識管理システムを開発するためのプラットフォームとして使用できます。
国際老化研究ポートフォリオ(IARP)には、米国国立衛生研究所(NIH)、欧州委員会(EC)、米国科学財団( NSF ) 、カナダおよびオーストラリアの研究評議会、その他多くの機関からの過去の助成金データが含まれています。また、米国国立医学図書館のライセンスに基づき、 MEDLINEの論文抄録も収録されています。IARPのボランティア開発チームは、出版部門と直接連携し、データベースを自動更新または物理媒体で郵送されたデータを解析することで定期的に更新しています。
IARPでの簡単な検索は、検索ウィンドウに主題の主要な要素を入力することで実行できます。
IARP はこの初期検索式を翻訳し、フィールド名、ブール演算子を自動的に追加し、特にテキストの単語を (OR 演算子を使用して) 日常的に組み合わせることにより、検索式を大幅に強化します。
は次のように翻訳されます
高度なプロジェクト検索機能を使用すると、作成日、研究内容、資金調達メカニズムから特定のプロジェクトまで、検索条件を絞り込むことができます。各研究プロジェクトには、説明に加えて、資金提供機関、受給機関、主任研究者に関する詳細情報が含まれています。さらに、現在のプロジェクトを他の類似プロジェクトや資金調達メカニズムとリンクさせる機能も備えています。
高度な検索機能を効果的に利用するには、ユーザーは研究分野に関するある程度の知識を持ち、関連性のある具体的なキーワードと絞り込み条件を使用する必要があります。このフォームでは、正確なデータ取得のために複数の値を指定できます。
[キーワード] . ユーザーは、プロジェクトの説明とタイトルフィールドの情報検索にブール演算子とマスクを使用できます。
検索クエリの例:
【研究分野】ユーザーはカテゴリツリーから希望する研究分野を選択することで検索を絞り込むことができます。
[老化の理論] 。ユーザーは老化の理論のリストから複数の値を選択できます。
さらに、ユーザーは以下の方法で検索を絞り込むことができます。
会計年度、プロジェクト番号、主任研究者、プロジェクトの開始日と終了日、受給者および資金提供機関、資金の種類。
トレンド分析チャート&ツールは、プロジェクトデータを図、グラフ、比較表として視覚化するためのツール群です。このインターフェースを使用すると、研究資金を年、機関、大学、主任研究者、地域、カテゴリ別に比較する2次元グラフを作成できます。
システムに保存されているデータの包括的な分析結果を表示します(プロジェクトの総数によるデータベースの内容の理解に役立ちます)。データベースに保存されている出版物とプロジェクトの現在の状態を詳細に表示します :合計、分類済み、手動分類済み、古い分類済み、未分類。総資金による上位50件のアクティブな完了済みプロジェクト、上位の国、米国の州、研究者、資金提供機関、および受領組織を総資金別に表示します。
このシステムには、助成金マッチングツール、人名録、資金提供機関、バイオテクノロジー関連イベントやウェブキャストなど、現在様々な開発段階にあるツールも組み込まれています。これらのツールの目的は、研究コミュニティが類似の研究プロジェクトに資金提供を行っている組織を特定したり、共同研究者候補を見つけたり、自身の研究分野に関連する会議を探したりできるようにすることです。
自動プロジェクト分類は、大規模データセットの中から老化研究に関連するプロジェクトを特定し、関連する意味グループに分類するために使用されます。このシステムは、機械学習の要素を含む 2 つの分類アルゴリズム、サポートベクターマシン ( SVM)とリカレントニューラルネットワークベースのブール因子分析 (BFA) を利用しています。[ 1 ] 2014 年以降、SVM アルゴリズムは、IARP の専門家によって割り当てられたラベルが少ない不完全なラベル付けデータセットのマルチラベル分類を容易にするように変更されました。これにより、分類精度が向上しました。[ 2 ]
現在の自動分類アルゴリズムには限界があり、各カテゴリに比較的大きなトレーニングデータセットが必要となるため、このシステムは専門のカテゴリ編集者による手動分類に大きく依存しています。SABおよびカテゴリ編集者の管理インターフェースにより、 SABメンバー、研究所長、研究室長は最上位カテゴリを管理し、下位カテゴリの管理を大学院生に委任することができます。
IARPは、プロジェクト概要、特許、出版物をアルゴリズムで分析することにより、データベース内の関連プロジェクトや類似プロジェクトを自動的に特定する機能を備えています。このような高度なプロジェクト分析は、プロジェクトの重複や類似プログラムへの資金提供の重複を回避するのに役立つ可能性があり、同時に、資金提供の対象となる可能性のある知識のギャップを明らかにすることにもつながります。
FundingTrendsプロジェクトは、世界中の主要な研究資金提供機関が支援する数百万件の生物医学プロジェクトを、キーワード検索で簡単に検索できるツールです。検索されたキーワードを含むプロジェクトについて、各年度の資金提供額を算出します。
Aging.CCプロジェクトは、世界中の主要な研究資金提供機関が支援する数百万件の生物医学プロジェクトを、キーワードで簡単に検索できるツールです。