5'-デオキシアデノシンデアミナーゼ

5'-デオキシアデノシンデアミナーゼ（別名「DadD」）は、 5'-デオキシアデノシンから5'-デオキシイノシンへの変換を触媒する酵素です。 ^{[1] [2]}程度は低いものの、この酵素は5'-メチルチオアデノシン、S-アデノシルホモシステイン、アデノシンの脱アミノ化も触媒します。^[1] DadD酵素の分子量は約230 kDaです。[ 1 ] ^DadDは、60℃で10分間加熱した後も酵素活性の90%を維持します。^[1] 5'デオキシアデノシンデアミナーゼの好ましいpHは9.0で、酵素はpH11で変性します。^[1] DadD酵素は5'デオキシアデノシンを好ましい基質としますが、5'-メチルチオアデノシン、S-アデノシルホモシステイン、アデノシンとも低い効率で反応します。^[1]

5'-デオキシアデノシンデアミナーゼのEC番号はEC:3.5.4.41です。^[1]酵素委員会番号は、酵素が触媒する反応に基づいて酵素を分類するシステムです。^[3] EC番号は特定の酵素に付けられるのではなく、酵素が触媒する反応に付けられるため、1つのEC番号で同じ反応を触媒するさまざまな酵素を表すことができます。^[4] 5'-デオキシアデノシンデアミナーゼのUniProt id番号はQ58936です。この番号は、酵素が触媒する反応だけでなく、酵素自体に固有のものです。

5'-デオキシアデノシンデアミナーゼは、反応経路に従って5'-デオキシアデノシンから5'-デオキシイノシンへの回収経路を触媒する。^{[1] [5]}この反応では、5'-デオキシアデノシンは5'-デオキシイノシンに変換され、副産物としてアンモニアが発生する。^{[1] [5]}${\displaystyle {\ce {C10H13N5O3 + H+ + H2O <=>> C10H12N4O4 + NH4+}}}$

この酵素には多くの活性部位があり、そのいくつかは特に亜鉛と相互作用する金属結合部位です。^[1]金属結合部位は、位置55、57、203、および292にあります。^[5]その他の結合部位には、位置84、176、206、および292があります。^[5] 5'-デオキシアデノシンデアミナーゼの解明された結晶構造は、こちらのSMRデータベースでご覧いただけます。

DadD酵素は、単一の生物、すなわち好熱性メタン生成古細菌Methanocaldococcus jannaschiiでのみ発見されているという点でユニークです。^[1] Methanocaldococcus jannaschiiなどのメタン生成菌では、酵素MTA/SAHヌクレオシダーゼ（EC 3.2.2.9）が欠如しているため、ラジカルSAM反応生成物を回収する典型的な代謝経路を使用できません。^[1]ラジカルSAM反応生成物の回収は、メタン生成菌にとって重要です。^[1]回収経路がなければ、5'-デオキシアデノシンが蓄積し、ビオチン合成酵素（BioB）とリポイル合成酵素（LipA）のプロセスが阻害されます。^{[1] [6]} DadD酵素は、メタン生成菌がMTA/SAHヌクレオシダーゼを使用せずにこれらのSAM反応生成物を回収するメカニズムを提供します。^[1]