ヤサラ

Yet Another Scientific Artificial Reality Application ( YASARA ) は、分子の視覚化、モデリング、ダイナミクスのためのコンピュータ プログラムです。このソフトウェアについて言及している科学論文が多数あることからもわかるように、このソフトウェアには多くの科学的用途があります。 ^[1] YASARA の無料版^[2]は、バイオインフォマティクスの教育に最適です。このソフトウェアを使用する、無料で利用できるバイオインフォマティクス コースが多数存在します。

一連の例については、分子・生体分子情報科学センター（CMBI）の教育ページを参照してください。 ^[3]

• Krieger E、Koraimann G、Vriend G ( 2002 年 5 月)。「自己パラメータ化力場である YASARA NOVA による比較モデルの精度向上」。タンパク質。47  ( 3 ) : 393–402。doi : 10.1002 /prot.10104。PMID 11948792。
• モデリング: Krieger E、 Vriend G (2002 年 2 月)。「Models@Home :スクリーンセーバー ベースのアプローチを使用したバイオインフォマティクスにおける分散コンピューティング」。 バイオインフォマティクス。18 (2): 315–8。doi : 10.1093/bioinformatics/18.2.315。PMID 11847079。
  
• ダイナミクス: Krieger E、Darden T、Nabuurs SB、Finkelstein A、Vriend G (2004 年 12 月)。「経験的エネルギー関数の最適な使用: 結晶空間における力場パラメータ化」。タンパク質。57 ( 4 ) : 678–83。CiteSeerX 10.1.1.472.6529。doi : 10.1002 /prot.20251。PMID 15390263  。
   

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