ユーベロン

ユーベロン
コンテンツ
説明	Uberon、統合的な多種多様な解剖学オントロジー。
; キャプチャされたデータの種類	解剖学的構造
生物	後生動物
接触
主な引用	マンガルら（2012）
発売日	2012
アクセス
データ形式	OWLと OBO
Webサイト	http://obophenotype.github.io/uberon/
ダウンロードURL	http://purl.obolibrary.org/obo/uberon/merged.owl
Sparqlエンドポイント	http://sparql.hegroup.org/sparql
その他
ライセンス	開ける

超解剖学オントロジー（Uberon）は、肺、筋肉、骨、羽毛、ひれなど、動物に見られるさまざまな構造を表す比較解剖学オントロジーです。これらの構造は、一部やから発展するなどの関係を介して他の構造に接続されています。 ^[1]このオントロジーの用途の1つは、さまざまな生物学的データベースや、解剖学の基礎モデルなどの他の種固有のオントロジーからのデータを統合することです。^[2]^[3]^[4]

参考文献

^ ab Mungall, Christopher J; Torniai Carlo; Gkoutos Georgios V; Lewis Suzanna E; Haendel Melissa A (2012). 「Uberon、統合的な多種多様な解剖学オントロジー」Genome Biol . 13 (1). イギリス: R5. doi : 10.1186/gb-2012-13-1-r5 . PMC 3334586 . PMID 22293552.
^ Washington, NL; Haendel, MA ; Mungall, CJ; Ashburner, M.; Westerfield, M.; Lewis, SE (2009). Buetow, Kenneth H (ed.). 「オントロジーベースの表現型注釈を使用したヒト疾患と動物モデルの関連付け」. PLOS Biology . 7 (11): e1000247. doi : 10.1371/journal.pbio.1000247 . PMC 2774506. PMID 19956802 .
^ Hoehndorf, R.; Schofield, PN; Gkoutos, GV (2011). 「PhenomeNET: 疾患遺伝子発見への全フェノムアプローチ」. Nucleic Acids Research . 39 (18): e119. doi :10.1093/nar/gkr538. PMC 3185433. PMID 21737429 .
^ Chen, CK; Mungall, CJ; Gkoutos, GV; Doelken, SC; Köhler, S.; Ruef, BJ; Smith, C.; Westerfield, M.; Robinson, PN; Lewis, SE; Schofield, PN; Smedley, D. (2012). 「MouseFinder: マウス表現型データからの候補疾患遺伝子」. Human Mutation . 33 (5): 858–866. doi :10.1002/humu.22051. PMC 3327758. PMID 22331800 .