ターゲット（プロジェクト）

ターゲットは、オランダ北部におけるビッグデータの処理と管理に特化した共同研究プロジェクトの名前です。^[1]これは官民協力であり、2009年に開始され、政府の補助金によってサポートされています。^{[2]これは、}フローニンゲン大学が調整する10の学術機関とコンピューター業界のパートナーのコンソーシアムによって運営されており、天文学、生命科学、人工知能、医療診断の分野における科学プロジェクトのデータ管理を研究しています。

ターゲット プロジェクトには、フローニンゲン大学のさまざまな部門、同大学の医療センター、IBM、オラクル、ASTRON、オランダの IT 企業 Elkoog/ Heeiiおよび Nspyre が協力しています。

ターゲットのコンピュータセンターは、フローニンゲン大学のコンピューティングセンターである情報技術センターによってホストされており、IBMのGPFSストレージ技術^[5 ]に基づく10ペタバイト以上のストレージ^{[3] [4] 、}高性能コンピューティングクラスター、および欧州グリッドインフラストラクチャの一部であるグリッドクラスターで構成されています。

このプロジェクトは、天文学者の大量データ処理の専門知識を科学の他の分野に移転するために開始されました。Target は、Astro-WISE と呼ばれる分散コンピューティング環境を基盤としています。^{[6] [7]} Astro-WISE 自体は、新世代の広視野調査カメラからのデータを使用した研究、データ削減、データマイニングを容易にするための標準化された欧州調査システムを検討するために設立された OPTICON 広視野画像ワーキンググループの取り組みとして始まりました。 ^[8] Target プロジェクトは、欧州地域開発基金、オランダ経済省 (「Pieken in de Delta」プロジェクト)、フローニンゲン州およびドレンテ州から 5 年間で3,200 万ユーロ^[9]の資金提供を受けて2009 年に開始されました。このプロジェクトは、北ネーデルラント州連合 (SNN) およびフローニンゲン市の支援を受けて運営されています。

プロジェクト開始時の目標の 1 つは、マルチペタバイト規模のファイルシステム^[10]と数種類のグリッドおよびコンピューティングクラスター^{[11]で構成される単一の統合処理システムを開発することだった。最初の数年間で、} e-サイエンスの分野ごとに要件が異なることが明らかになった。一部の分野では、 Lofarのように大規模なデータストリーミングが行われている。天文学では、データオブジェクトの数は数十億に達する可能性があるが、データ列の数は限られている。^[12]ゲノミクスでは、行数は少ないが、列の数は数十万と膨大になることがある。歴史的写本用の Monk 検索エンジンでの視覚的なテキスト検索などの他の分野は、数億行と数千次元で中間の位置にある。さらに、ゲノミクスアプリケーションでは厳格なアクセス制御が必要になることが多いが^[13]、他の分野ではプライバシーの問題はない。その結果、Target 内のさまざまなサブプロジェクトでは、WISE テクノロジーの側面と Target ハードウェア インフラストラクチャのコンポーネントをそれぞれの分野に適用できる実用的なアプローチを採用しました。

ターゲットは、天文学、ビッグデータの視覚化（アムステルダムのeScienceセンターとの協力）^{[14] 、} 手書きテキスト認識アルゴリズム、健康的な老化に関する医学研究、パーキンソン病の診断ツールの開発など、数多くのデータ集約型科学プロジェクトに参加しています。

LOFAR望遠鏡からのデータの多くは、 ASTRONとTargetによって設計されたLOFAR長期アーカイブに保存され、そこからアクセスされ、アーカイブされます。 ^{[15] [16] [17]}データはTargetデータセンターと他のいくつかのヨーロッパのセンターでホストされます。

Monkは、フローニンゲン大学人工知能研究所（ALICE）のSchomakerと彼のグループによって開発されたシステムです。パターン認識と機械学習アルゴリズムを使用して、既存のさまざまなアーカイブにある手書きテキストを認識します。^{[18] [19] [20]}現在、オランダ国立公文書館の多数の書籍と、西洋、中世から手書きの中国写本まで70を超える国際的な歴史コレクションがMonkに取り込まれています。このシステムは、インターネットを介して継続的な（「24時間年中無休」）機械学習を適用し、基本的な結果を生み出しています。^{[曖昧] [21] MONKシステムは、Targetの計算およびストレージリソースを採用しています。最近、}フローニンゲン大学神学および宗教学部のPopovic教授が率いるコラボレーションの一部となり、炭素年代測定、古文書学、テキスト/画像認識技術を組み合わせて、人気の高い死海文書の写本の著者を特定しようとしています。^[22]

LifeLinesは、フローニンゲン大学医療センター（UMCG）が運営する長期医療研究プロジェクトです。5年に1回、合計30年間にわたり、165,000人から遺伝子型と表現型の一連のデータが収集されます。蓄積されたデータは、研究者や医療専門家が老化に関連するプロセスについての洞察を得たり、加齢に伴う健康状態の悪化がなぜこれほど大きく異なるのかを理解したりするために使用されます。^[23] Targetは、LifeLinesにデータの保存、アクセス、処理のためのインフラストラクチャを提供します。LifeLinesのデータ、およびSURFsaraとTargetのインフラストラクチャは、UMCG、LUMC、エラスムスMC、UMCU、アムステルダム自由大学のコンソーシアムが運営するオランダのゲノムプロジェクトで使用されました。オランダ人の人口構造と人口動態の歴史を推測するために全ゲノム配列を使用したプロジェクトの結果は、6月にNature Genetics誌に掲載されました。^{[24] [25]}

UMCGの神経学教授であるK. Leendersが運営するGLIMPSは、パーキンソン病のより迅速で信頼性の高い診断ツールを見つけることを目的とした研究プロジェクトです。^[26] GLIMPSは、パーキンソン病の早期発見のために複雑な画像ベースのアルゴリズムとPETスキャンを使用する可能性を模索しています。^[要出典] こうしたアルゴリズムの有効性をテストするために、GLIMPSはオランダの多数の病院から提供されたPETスキャンの大規模なデータベースを構築しています。Targetは、GLIMPSデータベースの構築と保守、およびコンピューティング施設での画像ベースのアルゴリズムの円滑な実行の確保を担当しています。

さらに、ターゲットは、OmegaCAMを使用したKiDs/VIKING天文調査[27] [28]、ESOのMUSE [31]機器（超大型望遠鏡に搭載）、MICADO（E-ELTに搭載予定）など、他の^{天文プロジェクトの}データ管理にも^携わっています。^さらに、ターゲットが推進するデータ中心のデータ管理アプローチは、ESAのユークリッドミッションにも採用されています。^[32]このプロジェクトのスピンオフ企業であるターゲット・ホールディングBVは、オランダ北部の民間企業と共同で数多くの商業プロジェクトも管理しています。^[33]

公共への啓蒙と教育もプロジェクトの任務の一部であり、ターゲットは多くの公開イベントを企画してきました。^[34]インフォバーサム3Dシアター^{[35] [36]}はターゲットプロジェクトのスピンオフであり、大規模なグループ向けに科学データの視覚化と説明のための施設を提供しています。