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シーケンスタグサイト(またはSTS )は、ゲノム中に1回出現し、その位置と塩基配列が既知である短い(200〜500塩基対)DNA配列です。[1]
使用法
STS は、特定のプライマーを使用したポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって簡単に検出できます。このため、STSは、さまざまな研究室から報告された配列データから遺伝子マップと物理マップを作成するのに役立ちます。STS は、ゲノムの 物理マップの作成上のランドマークとして機能します。
STS遺伝子座に遺伝的多型(例:単純配列長多型、SSLP、一塩基多型)が含まれている場合、それらは貴重な遺伝マーカー、つまり個人を区別するために使用できる遺伝子座になります。
これらはショットガン シーケンシングで使用され、特にシーケンスのアセンブリを支援します。
STS は、一部の遺伝子の微小欠失を検出するのに非常に役立ちます。たとえば、一部の STS は、不妊男性の無精子症(AZF)遺伝子の微小欠失を検出するためにPCRによるスクリーニングに使用できます。
参考文献
- ^ 「シーケンスタグ付きサイト(STS)」。
外部リンク
- NCBI のシーケンスタグ付きサイト (STS) の説明
参照
