定量化
ヒトの分泌タンパク質は全プロテオームの13～20%を占め、成長因子、ケモカイン、サイトカイン、接着分子、プロテアーゼ、脱落受容体などが含まれる。[ 2 ]ヒトのタンパク質コード遺伝子（39%、19613遺伝子[ 7 ]）は、シグナルペプチドおよび/または少なくとも1つの膜貫通領域を持つと予測されており、対応するタンパク質が細胞外へ能動的に輸送される（分泌）か、細胞内の多数の膜系のいずれかに存在することを示唆している。タンパク質カーゴに加えて、脂質、マイクロRNA、メッセンジャーRNAなどの非タンパク質成分も、細胞膜からの脱落によるマイクロベシクル（直径100～1000 nm）と、エンドソームエキソサイトーシスイベントを介して放出されるエクソソーム（直径30～150 nm）の両方を介して細胞から分泌される可能性があることが、ますます多くの証拠によって示されている。[ 8 ]これらのオルガネラに存在する因子は、分泌タンパク質の最大 42% を占め、集合分泌タンパク質として組み込まれています。[ 9 ]植物細胞、哺乳類細胞、幹細胞、がん細胞の細胞分泌タンパク質を研究するための方法論は多岐にわたります。[ 9 ]
参考文献
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- ↑ Horton, Edward R.; Byron, Adam; Askari, Janet A.; Ng, Daniel HJ; Millon-Frémillon, Angélique; Robertson, Joseph; Koper, Ewa J.; Paul, Nikki R.; Warwood, Stacey; Knight, David; Humphries, Jonathan D.; Humphries, Martin J. (2015 年 10 月 19 日). "コンセンサス インテグリン接着複合体の定義と接着複合体の形成および分解中のその動態" . Nature Cell Biology . 17 (12): 1577– 1587. doi : 10.1038/ncb3257 . PMC 4663675 . PMID 26479319 .
- ↑ Uhlén M、Fagerberg L、Hallström BM、Lindskog C、Oksvold P、Mardinoglu A、et al. (2015年1月)。 「プロテオミクス。ヒトプロテオームの組織ベースのマップ」。Science。347 ( 6220 ) 1260419。doi : 10.1126 / science.1260419。PMID 25613900。S2CID 802377。
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- 1 2 Mukherjee P、Mani S (2013年11 月)。「細胞分泌タンパク質群を解読するための方法論」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics。1834 ( 11 ): 2226–32。doi : 10.1016 / j.bbapap.2013.01.022。PMC 3652893。PMID 23376189。
さらに読む
- Omics.orgのアルファベット順リストにある「omes」と「omics」の「Secretome」
- Lum G、Min XJ (2011)。「FunSecKB: 真菌分泌タンパク質知識ベース」。Database。2011 bar001。doi : 10.1093 / database / bar001。PMC 3263735。PMID 21300622。
- Meinken J、Walker G 、 Cooper CR、Min XJ (2015)。「MetazSecKB：ヒトおよび動物の分泌タンパク質と細胞内タンパク質の知識ベース」。Database。2015 bav077。doi ：10.1093 / database / bav077。PMC 4529745。PMID 26255309。
