ルミノコッカス

ルミノコッカス
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	バシロタ
クラス：	クロストリジウム
注文：	真正細菌目
家族：	オシロスピラ科
属:	ルミノコッカス; シペステイン、1948年

ルミノコッカスは、クロストリジウム綱に属する細菌の属で。^[1]嫌気性グラム陽性腸内細菌である。この属の1種または複数種が、ヒトの腸内細菌叢に多数存在する。基準種はR. flavefaciensである。いつものように細菌の分類は流動的で、クロストリジウムは側系統であり、ルミノコッカス属の誤ったメンバーの一部は、 16S rRNA遺伝子配列に基づいて新しい属Blautia^{に再割り当てされている。 [2]}

ルミノコッカス属に関する最も引用されている論文の一つは、ルミノコッカス・アルバスとウォリネラ・サシノゲネスの間の種間水素移動を記述した論文である。^[3]

1972年にルミノコッカス・ブロミイがヒトの腸内で発見されたと報告されました。これは発見された数種のうちの最初のものでした。^{[4]これらは}結腸における植物細胞壁の分解に役割を果たしている可能性があります。^[5]

ある研究では、炎症性腸疾患の患者ではR. albus、R. callidus、R. bromiiが少ないことが分かりました。^[6]ルミノコッカスはパーキンソン病^[7]や筋萎縮性側索硬化症[ ^8]の患者でも少ないことが分かりました。^[9]R. gnavusはクローン病と関連しています。^[10]

種

ルミノコッカスアルバス
ルミノコッカス・ブロミ
ルミノコッカス・カリダス
ルミノコッカス・フラベファシエンス

[[Oscillospiraceae ^[11] ]]科に属し、再分類が必要な種：

ルミノコッカス・ガウブレアウイ
ルミノコッカス・グナバス
ルミノコッカス・ラクタリス
ルミノコッカス・オベウム
ルミノコッカストルク

参考文献

^ 分類。「分類ブラウザ（ルミノコッカス）」www.ncbi.nlm.nih.gov 。 2016年4月5日閲覧。
^ Liu C、Finegold SM、Song Y、Lawson PA (2008 年 8 月)。「Clostridium coccoides、Ruminococcus hansenii、Ruminococcus hydronotrophicus、Ruminococcus luti、Ruminococcus productus、および Ruminococcus schinkii の Blautia coccoides gen. nov.、comm. nov.、Blautia hansenii comb. nov.、Blautia hydronotrophica comb. nov.、Blautia luti comb. nov.、Blautia producta comb. nov.、Blautia schinkii comb. nov. への再分類、およびヒトの糞便から分離された Blautia wexlerae sp. nov. の説明」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。58 ( Pt 8)。一般微生物学会：1896–902 . doi：10.1099/ijs.0.65208-0 . PMID 18676476.
^ Iannotti EL、 Kafkewitz D、Wolin MJ、Bryant MP (1973 年 6 月)。「Vibrio succinogenes との連続培養で増殖した Ruminococcus albus のグルコース発酵産物: 種間 H2 移動による変化」。Journal of Bacteriology。114 ( 3): 1231– 40。doi : 10.1128 / JB.114.3.1231-1240.1973。PMC 285387。PMID 4351387。
^ Rajilić - Stojanović M、de Vos WM（2014年9月）。「ヒトの胃腸内微生物叢の最初の1000種の培養種」。FEMS微生物レビュー。38 （5）：996–1047。doi ： 10.1111 / 1574-6976.12075。PMC 4262072。PMID 24861948。
^ Ze, Xiaolei; Duncan, Sylvia H.; Louis, Petra; Flint, Harry J. (2012). 「Ruminococcus bromii はヒト結腸における難消化性デンプンの分解のキーストーン種である」. The ISME Journal . 6 (8): 1535– 1543. Bibcode :2012ISMEJ...6.1535Z. doi : 10.1038/ismej.2012.4 . PMC 3400402. PMID 22343308 .
^ Nagao-Kitamoto H, Kamada N (2017年2月). 「炎症性腸疾患における宿主-微生物クロストーク」.免疫ネットワーク. 17 (1): 1– 12. doi :10.4110/in.2017.17.1.1. PMC 5334117. PMID 28261015 .
^ Hill-Burns, EM; Debelius, JW; Morton, JT; Wissemann, WT; Lewis, MR; Wallen, ZD; Peddada, SD; Factor, SA; Molho, E; Zabetian, CP; Knight, R; Payami, H (2017 年 5 月)。「パーキンソン病とパーキンソン病治療薬には腸内微生物叢の明確な特徴がある」。運動障害。32 ( 5 ): 739– 749。doi :10.1002 / mds.26942。PMC 5469442。PMID 28195358。
^ Brenner, D; Hiergeist, A; Adis, C; Mayer, B; Gessner, A; Ludolph, AC; Weishaupt, JH (2018年1月). 「ALS患者の糞便マイクロバイオーム」Neurobiol Aging . 61 : 132–137 . doi :10.1016/j.neurobiolaging.2017.09.023. PMID 29065369. S2CID 296116.
^ Rowin, J; Xia, Y; Jung, B; Sun, J (2017年9月). 「ヒト運動ニューロン疾患における腸管炎症と腸内細菌叢異常」. Physiol Rep . 5 (18): e13443. doi :10.14814/phy2.13443. PMC 5617930 . PMID 28947596.
^ Henke, Matthew T.; Kenny, Douglas J.; Cassilly, Chelsi D.; Vlamakis, Hera; Xavier, Ramnik J.; Clardy, Jon (2019-06-25). 「クローン病に関連するヒト腸内微生物叢の一員であるRuminococcus gnavusは炎症性多糖体を産生する」。米国科学アカデミー紀要。116 ( 26): 12672– 12677。Bibcode : 2019PNAS..11612672H。doi : 10.1073 / pnas.1904099116。ISSN 0027-8424。PMC 6601261。PMID 31182571。
^ 「ルミノコッカス」.

[1] 分類。「分類ブラウザ（ルミノコッカス）」www.ncbi.nlm.nih.gov 。 2016年4月5日閲覧。

[2] Liu C、Finegold SM、Song Y、Lawson PA (2008 年 8 月)。「Clostridium coccoides、Ruminococcus hansenii、Ruminococcus hydronotrophicus、Ruminococcus luti、Ruminococcus productus、および Ruminococcus schinkii の Blautia coccoides gen. nov.、comm. nov.、Blautia hansenii comb. nov.、Blautia hydronotrophica comb. nov.、Blautia luti comb. nov.、Blautia producta comb. nov.、Blautia schinkii comb. nov. への再分類、およびヒトの糞便から分離された Blautia wexlerae sp. nov. の説明」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。58 ( Pt 8)。一般微生物学会：1896–902 . doi：10.1099/ijs.0.65208-0 . PMID 18676476.

[3] ^ Iannotti EL、 Kafkewitz D、Wolin MJ、Bryant MP (1973 年 6 月)。「Vibrio succinogenes との連続培養で増殖した Ruminococcus albus のグルコース発酵産物: 種間 H2 移動による変化」。Journal of Bacteriology。114 ( 3): 1231– 40。doi : 10.1128 / JB.114.3.1231-1240.1973。PMC 285387。PMID 4351387。

[4] ^ Rajilić - Stojanović M、de Vos WM（2014年9月）。「ヒトの胃腸内微生物叢の最初の1000種の培養種」。FEMS微生物レビュー。38 （5）：996–1047。doi ： 10.1111 / 1574-6976.12075。PMC 4262072。PMID 24861948。

[5] Ze, Xiaolei; Duncan, Sylvia H.; Louis, Petra; Flint, Harry J. (2012). 「Ruminococcus bromii はヒト結腸における難消化性デンプンの分解のキーストーン種である」. The ISME Journal . 6 (8): 1535– 1543. Bibcode :2012ISMEJ...6.1535Z. doi : 10.1038/ismej.2012.4 . PMC 3400402. PMID 22343308 .

[6] Nagao-Kitamoto H, Kamada N (2017年2月). 「炎症性腸疾患における宿主-微生物クロストーク」.免疫ネットワーク. 17 (1): 1– 12. doi :10.4110/in.2017.17.1.1. PMC 5334117. PMID 28261015 .

[7] Hill-Burns, EM; Debelius, JW; Morton, JT; Wissemann, WT; Lewis, MR; Wallen, ZD; Peddada, SD; Factor, SA; Molho, E; Zabetian, CP; Knight, R; Payami, H (2017 年 5 月)。「パーキンソン病とパーキンソン病治療薬には腸内微生物叢の明確な特徴がある」。運動障害。32 ( 5 ): 739– 749。doi :10.1002 / mds.26942。PMC 5469442。PMID 28195358。

[8] Brenner, D; Hiergeist, A; Adis, C; Mayer, B; Gessner, A; Ludolph, AC; Weishaupt, JH (2018年1月). 「ALS患者の糞便マイクロバイオーム」Neurobiol Aging . 61 : 132–137 . doi :10.1016/j.neurobiolaging.2017.09.023. PMID 29065369. S2CID 296116.

[9] Rowin, J; Xia, Y; Jung, B; Sun, J (2017年9月). 「ヒト運動ニューロン疾患における腸管炎症と腸内細菌叢異常」. Physiol Rep . 5 (18): e13443. doi :10.14814/phy2.13443. PMC 5617930 . PMID 28947596.

[10] Henke, Matthew T.; Kenny, Douglas J.; Cassilly, Chelsi D.; Vlamakis, Hera; Xavier, Ramnik J.; Clardy, Jon (2019-06-25). 「クローン病に関連するヒト腸内微生物叢の一員であるRuminococcus gnavusは炎症性多糖体を産生する」。米国科学アカデミー紀要。116 ( 26): 12672– 12677。Bibcode : 2019PNAS..11612672H。doi : 10.1073 / pnas.1904099116。ISSN 0027-8424。PMC 6601261。PMID 31182571。

[11] 「ルミノコッカス」.

種

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細菌

バシロタ

クロストリジウム