ロッププロテイン

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構造	スイスモデル
ドメイン	インタープロ

調節タンパク質ロップ
調節タンパク質ロップ
識別子
生物	大腸菌
シンボル	ロップ
ユニプロット	P03051
構造
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ドメイン	インタープロ

Rop（プライマーリプレッサー、またはRNA one モジュレーター（ROM）としても知られる）は、プレプライマーRNAであるRNA IIとそのアンチセンスRNAであるRNA Iとの対合速度を高めることにより、大腸菌におけるColE1ファミリーおよび関連細菌プラスミドのコピー数を低く保つ役割を担う小さな二量体タンパク質である。 ^[1] 構造的には、Ropは2つのヘリックス-ターン-ヘリックスモノマーの逆平行相互作用によって形成されるホモ二量体4ヘリックスバンドルタンパク質である。Ropタンパク質の構造は高解像度で解析されている。^[2] Ropはサイズが小さく構造が既知であるため、タンパク質設計作業においてヘリックストポロジーの再配置やループ領域の再設計に使用されてきている。^[3]一般に、4ヘリックスバンドルは、アミノ酸配列と構造の関係を理解するための単純なモデルとして、de novoタンパク質設計作業で広く使用されている。

外部リンク

プロテオペディアのRopタンパク質

参考文献

^ del Solar G、 Espinosa M (2000年8 月)。「プラスミドコピー数制御: ますます拡大する物語」。分子微生物学。37 (3): 492–500。doi : 10.1046/ j.1365-2958.2000.02005.x。PMID 10931343。
^ Banner, David W.; Kokkinidis, Michael; Tsernoglou, Demetrius (1987年8月). 「1.7Å解像度でのColE1 Ropタンパク質の構造」. Journal of Molecular Biology . 196 (3): 657–675. doi :10.1016/0022-2836(87)90039-8. PMID 3681971.
^ Kresse, HP; Czubayko, M.; Nyakatura, G.; Vriend, G.; Sander, C.; Bloecker, H. (2001 年 11 月 1 日)。「4 ヘリックスバンドルトポロジーの再設計: 異なるループ配置を持つモノマー Rop タンパク質バリアント」。タンパク質工学設計と選択。14 (11): 897–901。doi :10.1093/protein/14.11.897。PMID 11742109 。

[delSolar2000-1] ^ del Solar G、 Espinosa M (2000年8 月)。「プラスミドコピー数制御: ますます拡大する物語」。分子微生物学。37 (3): 492–500。doi : 10.1046/ j.1365-2958.2000.02005.x。PMID 10931343。

[banner-2] Banner, David W.; Kokkinidis, Michael; Tsernoglou, Demetrius (1987年8月). 「1.7Å解像度でのColE1 Ropタンパク質の構造」. Journal of Molecular Biology . 196 (3): 657–675. doi :10.1016/0022-2836(87)90039-8. PMID 3681971.

[kresse-3] Kresse, HP; Czubayko, M.; Nyakatura, G.; Vriend, G.; Sander, C.; Bloecker, H. (2001 年 11 月 1 日)。「4 ヘリックスバンドルトポロジーの再設計: 異なるループ配置を持つモノマー Rop タンパク質バリアント」。タンパク質工学設計と選択。14 (11): 897–901。doi :10.1093/protein/14.11.897。PMID 11742109 。