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| 初回リリース | 2008年3月14日 |
|---|---|
| 安定版リリース | 3.0
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| リポジトリ |
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| 書かれた | C++、C# |
| オペレーティング·システム | Windows 、（ OS XおよびLinuxは部分的にサポート） |
| タイプ | バイオインフォマティクス/質量分析ソフトウェア |
| ライセンス | Apache ライセンス2.0 |
| Webサイト | 出典: |
ProteoWizardは、プロテオミクス データ分析用のオープンソースのクロスプラットフォーム ツールとライブラリのセットです。[1] [2]統一された質量分析データ ファイル アクセスのフレームワークを提供し、標準的な化学および LCMS データセットの計算を実行します。具体的には、ベンダー固有の独自形式の多くを読み取り、データをオープン データ形式に変換することができます。
アプリケーション レベルでは、ソフトウェアはデータ変換 (msConvert、msConvertGUI、idConvert)、データ視覚化 (msPicture、seeMS)、データ アクセス (msAccess、msCat、idCat、msPicture)、データ分析 (peekaboo、msPrefix14)、および基本的なプロテオミクス ユーティリティ (chainsaw) の実行ファイルを提供します。さらに、このプロジェクトでは、SRM実験などのターゲット プロテオミクス実験の作成、取得、分析に役立つ Skyline ソフトウェアもホストしています。
このプロジェクトの主な貢献者は、Tabb、MacCoss、Mallickの各研究室とInsilicosです。[3]
参照
参考文献
- ^ Kessner, D.; Chambers, M.; Burke, R.; Agus, D.; Mallick, P. (2008 年 11 月). 「ProteoWizard: 迅速なプロテオミクスツール開発のためのオープンソースソフトウェア」.バイオインフォマティクス. 24 (21): 2534–6. doi :10.1093/bioinformatics/btn323. PMC 2732273. PMID 18606607 .
- ^ Chambers, MC.; Maclean, B.; Burke, R.; Amodei, D.; Ruderman, DL.; Neumann, S.; Gatto, L.; Fischer, B.; et al. (2012年10月). 「質量分析とプロテオミクスのためのクロスプラットフォームツールキット」. Nat Biotechnol . 30 (10): 918–20. doi :10.1038/nbt.2377. PMC 3471674. PMID 23051804 .
- ^ ProteoWizard: チーム
外部リンク
- プロジェクトホームページ