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| ヌーディクス | |||||||||
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 結核菌由来の Nudix 加水分解酵素 MT-ADPRase の構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | ヌーディクス | ||||||||
| パム | PF00293 | ||||||||
| ファム一族 | CL0261 | ||||||||
| エコド | 221.4.1 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
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| NUDIXのような | |||||||||
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 大腸菌k12由来のNADHピロホスファターゼ（1790429）の2.20Å解像度での結晶構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | NUDIXのような | ||||||||
| パム | PF09296 | ||||||||
| ファム一族 | CL0261 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| SCOP2 | 1vk6 / スコープ / SUPFAM | ||||||||
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NUDIX加水分解酵素は、x（任意の部分）に結合したヌクレオシド二リン酸を切断できる加水分解酵素のスーパーファミリーであり、その名前の由来となっている。 [1] [2] [3] [4]この反応により、ヌクレオシド一リン酸（NMP）とXPが生成される。Nudix酵素によって加水分解される基質には、ヌクレオシド二リン酸および三リン酸、ジヌクレオシドおよびジホスホイノシトールポリリン酸、ヌクレオチド糖、RNAキャップなど、さまざまな有機ピロリン酸が含まれており、基質特異性はさまざまである。[3] NUDIXスーパーファミリーの酵素は、真核生物、細菌、古細菌など、あらゆる種類の生物に見られる。[3]
NUDIXファミリーには2つの構成要素がある。両側にαヘリックスを持つβシートのいわゆるNUDIXフォールドと、触媒アミノ酸と金属結合アミノ酸を含むNUDIXモチーフである。NudixモチーフはGXXXXXEXXXXXXXREUXEEXGUで、Uはイソロイシン、ロイシン、またはバリン、Xは任意のアミノ酸である。これは（通常）触媒アミノ酸を含む短いヘリックスを形成する。NUDIX加水分解酵素には、脱キャップ複合体のDcp2 、ADP-リボースジホスファターゼ、MutT、ADPRase、Ap4A加水分解酵素、RppHなどがある。[5]
参考文献
- ^ Bessman MJ、Frick DN、O'Handley SF (1996 年 10 月)。「MutT タンパク質または「Nudix」加水分解酵素は、多用途で広く分布する「ハウスクリーニング」酵素のファミリーです。」J. Biol. Chem . 271 (41): 25059–62. doi : 10.1074/jbc.271.41.25059 . PMID 8810257。
- ^ Mildvan AS、Xia Z、Azurmendi HF、他 (2005 年 1 月)。「Nudix 加水分解酵素の構造とメカニズム」。Arch . Biochem. Biophys . 433 (1): 129–43. doi :10.1016/j.abb.2004.08.017. PMID 15581572。
- ^ abc McLennan AG (2006年1月). 「Nudix加水分解酵素スーパーファミリー」. Cell. Mol. Life Sci . 63 (2): 123–43. doi : 10.1007 /s00018-005-5386-7 . PMC 11136074. PMID 16378245. S2CID 30202446.
- ^ カレーラス・プイグベール、ジョルディ;ツィトニク、マリンカ。ジェムス、アン・ソフィー。カーター、ミーガン。ウンターラス、ジュディス E.ハルストレム、ビョルン。ロセヴァ、オルガ。カレム、ジル。カルデロン・モンターニョ、ホセ・マヌエル。リンツコッグ、セシリア。 Edqvist、Per-Henrik (2017-11-16)。 「ヒトNUDIX加水分解酵素ファミリーの包括的な構造的、生化学的、生物学的プロファイリング」。ネイチャーコミュニケーションズ。8 (1): 1541。ビブコード:2017NatCo...8.1541C。土井：10.1038/s41467-017-01642-w。ISSN 2041-1723。PMC 5688067。PMID 29142246。
- ^ Mildvan, AS; Xia, Z.; Azurmendi, HF; Saraswat, V.; Legler, PM; Massiah, MA; Gabelli, SB; Bianchet, MA; et al. (2005). 「Nudix加水分解酵素の構造とメカニズム」。生化学および生物物理学のアーカイブ。433 (1): 129–143。doi : 10.1016 /j.abb.2004.08.017。PMID 15581572 。