ミイラ復活！伝説の始まり

地元の博物館で、プレスリー・カーノバンとミイラたちは、エジプトの遺物に関する新しい展示を発見する。展示品の中には、「キマス」と「サソリ」とラベルの貼られた2つの石棺があった。ジャカルがその石棺を見つけて見てみると、他のミイラたちは彼がどうやってその名前を覚えているのかに驚く。

ミイラたちとプレスリーが部屋を出ると、ジャ・カルは棺を開け始めますが、セトとアヌビスが彼を襲撃し、邪悪な魔術師スカラベのためにミイラを盗み、ジャ・カルや他の者たちと戦わせようとしていることを明かします。セトとアヌビスは無事に石棺を持って脱出し、スカラベの隠れ家に戻ります。そこで3人は「サソリ」と書かれた石棺の中にいるミイラ、アラクを呼び出し、蘇らせます。

一方、ジャ・カルは他のミイラたちに、1500年代にアメンホテプの槍持ちを務めていた兄アラクについて明かす。ジャ・カルがライオンからアラクの命を救った後、ジャ・カルが王家の狩猟隊のリーダーに任命されると、アラクは置き去りにされた。それ以来、アラクは死ぬまでスカラベと共謀し、ラプセス王子、そして最終的にはジャ・カルを殺害するという計画を進めていた。

ジャ・カルとアラクは博物館で対峙し、戦いを繰り広げる。一方、スカラベは隠れ家に戻り、ジャ・カルの甥でありアラクの息子であるもう一人のミイラ、キマスを呼び出す。ヘカの依頼で、キマスはサンフランシスコを探索し、後にネフェル・ティナとアルモンに出会う。しかし、スカラベとアラクが彼を利用して他のミイラを信用させ、ジャ・カルを殺害しようと企んでいるとは知る由もなかった。

ネフェル＝ティナとアルモンは彼を街の様々な場所に連れて行くが、スカラベと彼のシャブティが二人のミイラを襲撃し、キマスがミイラであり、自分たちと同じように鎧に変身できることを知る。彼らはすぐに脱出し、キマスは叔父のジャ＝カルと再会する。ジャ＝カルはキマスの様子を非常に心配し、やがてキマス、アラク、そしてミイラのリーダーとしてプレスリーを守るという自身の義務について考え始める。

スフィンクスに戻ったラスは、アラクのサソリのお守りの力を発見し、それが破壊されるとアラクは鎧と共に西の門の向こうに送り返されることを知り、アラクを送り返すためにお守りを探す計画を立てる。しかし、博物館がアラクとキマスの展示品（お守りが入っている）を持ち去ったことを知ったプレスリーがすぐに彼らの計画を中断させる。ミイラたちはバンを追いかけるが、スカラベが先に彼らを出し抜き、アラクのためにバンを取り戻す。ミイラたちがビーフィーバーガーでキマスと会うと、キマスはお守りの場所を教えるが、プレスリーはキマスが真実を言っているとは信じない。

翌晩、フォートポイントで、キマスはプレスリーの躊躇をよそに、ジャカルをスカラベの隠れ家の一つに連れて行き、お守りを探させる。ジャカルはすぐにその隠れ家が偽物だと気づき、スカラベ、彼のシャブティ、そしてアラクに襲われる。プレスリーの命令で他のミイラたちがキマスの悪事を暴こうとジャカルを探し回る中、キマス自身も、自分の父親であるアラクがジャカルの裏切りについて嘘をついていたこと、そして自分の嫉妬心からジャカルに対する武器として利用されていたことに気づく。

ミイラたちとスカラベは激しい戦いを繰り広げ、やがてアラクがジャ・カルの腕を負傷させる。キマスはアラクを倒し、ジャ・カルの方が彼よりも父親らしいと断言する。鎧を着たまま、アラクを戻すには他に方法がないと悟ったキマスは、アラクのサソリのお守りと鎧を破壊し、二人のミイラを西の門へと送り込む。敗北を悟ったスカラベはその場から逃げ出す。西の門が現れると、ジャ・カルとプレスリーはナイルテーター号で二人きりで旅をし、ジャ・カルはプレスリーにキマスとアラクへの想いと愛情を込めた矢を放つよう頼む。プレスリーが矢を放つと、矢は西の門へと飛び込み、二人の確執はついに終結する。