微生物科

微生物科
	寒天培地上の Microbacterium gubbeenense
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	放線菌類
クラス：	放線菌
注文：	ミクロコッカス
家族：	ミクロバクテリア科; パークら1995
タイプ属
	微生物; オルラ・イェンセン 1919 (承認リスト 1980)
属
	本文を参照してください。

微生物科は放線菌目細菌科の一種です。^[1]グラム陽性の土壌微生物です。

属

ミクロバクテリア科は以下の属から構成される: ^[2]

アグレイア ・エフトゥシェンコら2001年
アグロコッカス グロスら1996
アグロミセス グレッドヒルおよびカシダ 1969 (承認リスト 1980)
アロフミバクター ・キムら。 2016年
アルピニモナス・ シューマン他2012
アムニバクテリ ウムキムとリー 2011
アレニビルガ 浜田ら。 2017年
オーランチミクロビウム 中井ら。 2015年
Canibacter Aravena-Román et al . 2014年
クラビバクター ・デイビスら。 1984年
クヌイバクター ・ゾウ他2016
Compostimonas Kim et al . 2012年
コニジコラ・ キム他2014
「クロセバクテリウム」ロジャース＆ドラン・ピーターソン 2006
クリオバクテリ ウム鈴木ら。 1997年
「クリオコーラ」ガブリッシュ他2003
Curtobacterium Yamada and Komagata 1972 (承認リスト 1980)
ジアミノ酪酸菌 Kim et al . 2014
ジアミノブチリシモナス Jang et al . 2013
フリゴリバクテリ ウム・ケンプファーら。 2000年
フロンディハビタンズ ・グリーンら2009年
ガルビタレア ・キム他2014
グラシバクター カタヤマら。 2009年
Glaciihavetans Li et al . 2014年
グリロタルピコラ ・キムら。 2012年
グロシバクター ・マナイアら。 2004年
ハービコニクス・ ベーレント他2011
ホモセリニバクター キム他2014
ホモセリニモナス ・キムら。 2012年
Huakuichenia Zhang et al . 2016年
フミバクター ・ヴァズ・モレイラ他2008
クルギエラ・ クック他2008
ラベデラ ・リー 2007
Lacisediminihavetans Zhuo et al . 2020年
レイフソニア ・エフトゥシェンコら2000年
ロイコバクター 竹内ら1996
「Luethyella」オニール他2017
「カンディダトゥス・ルンブリシディフィラ」コリッグ。ルンドら。 2018年
リシニバクター ・トゥオら2015
リシニモナス ジャン他2013
「Marinisubtilis」Qin et al . 2021年
マリセディミニ コラ・リーら。 2010年
Microbacterium Orla-Jensen 1919 (承認リスト 1980)
ミクロセラ ティアゴ他2005
ミクロテリコラ 松本他2008
ミセトコーラ 塚本ら。 2001年
ナシア ・ウェン他2013
オキバクテリウム ・エフトゥシェンコら。 2002年
パラフリゴリバクテリ ウムコングら。 2016年
プランクトモナス Liu et al . 2019
「カンジダトゥス・プランクトルーナ」ハーン 2009
プランティバクター ・ベーレントら2002
ポンティモナス・ ジャン他2013
プロタエティバクター ・ホエら2019
シュードクラビバクター ・マナイアら2004
シュードリシニモナス Heo et al . 2019
プジヘラ ・シェウ他2017
Rathayibacter Zgurskayaら1993年
ロドグロブス シェリダン他2003
ロドルーナ ・ハーン他2014
ルダイバクター・ キム他2013
サリニバクテリウム ・ハンら。 2003年
シューマンネッラ ・アン他2009
Subtercola Männistö et al . 2000年
テリメソフィロバクター・ ハーンら 2021

系統発生

現在受け入れられている分類法は、命名法に定められた原核生物名のリスト^[2]に基づいており、系統発生は全ゲノム配列に基づいています。^[3]^[a]

注記

^ アロフミバクター、アルピニモナス、アムニバクテリウム、アレニビルガ、カニバクター、クリュセオグロブス、コンポスティモナス、コニジコラ、ジアミノブチリシバクター、ジアミノブチリシモナス、フリゴリバクテリウム、フロンディハビタンス、ガルビタレア、グラシアハビタンス、ホモセリニバクター、ホモセリニモナス、フアクイケニア、クルーギエラ、ラベデラ、ラシセディミニハビタンス、リシニバクター、リシニモナス、マリセジミニコラ、ミクロセラ、ナアシア、パラフリゴリバクテリウム、プランクトモナス、ポンティモナス、プロテエティバクター、シュードリシニモナス、プジヘラ、ロドグロブス、ルダイバクター、シューマンネラ、およびSubtercola はこの系統樹には含まれません。

参考文献

^ ab Park YH, Suzuki K, Yim DG, Lee KC, Kim E, Yoon J, Kim S, Kho YH, Goodfellow M, Komagata K (1993). 「5S リボソーム RNA のヌクレオチド配列によるペプチドグリカングループ B 放線菌の超属分類」Antonie van Leeuwenhoek . 64 (3–4): 307–313. doi :10.1007/BF00873089. PMID 8085792. S2CID 32811031.
^ ab Euzéby JP, Parte AC. 「Microbacteriaceae」。命名法で定められた原核生物名のリスト（LPSN）。 2022年5月28日閲覧。
^ Nouioui I、Carro L、García-López M、Meier-Kolthoff JP、Woyke T、Kyrpides NC、Pukall R、Klenk HP、Goodfellow M、Markus Göker M (2018)。「放線菌門のゲノムベースの分類」。Front。Microbiol。9 ： 2007。doi ：10.3389 / fmicb.2018.02007。PMC 6113628。PMID 30186281。

[4] アロフミバクター、アルピニモナス、アムニバクテリウム、アレニビルガ、カニバクター、クリュセオグロブス、コンポスティモナス、コニジコラ、ジアミノブチリシバクター、ジアミノブチリシモナス、フリゴリバクテリウム、フロンディハビタンス、ガルビタレア、グラシアハビタンス、ホモセリニバクター、ホモセリニモナス、フアクイケニア、クルーギエラ、ラベデラ、ラシセディミニハビタンス、リシニバクター、リシニモナス、マリセジミニコラ、ミクロセラ、ナアシア、パラフリゴリバクテリウム、プランクトモナス、ポンティモナス、プロテエティバクター、シュードリシニモナス、プジヘラ、ロドグロブス、ルダイバクター、シューマンネラ、およびSubtercola はこの系統樹には含まれません。

[Park-1] Park YH, Suzuki K, Yim DG, Lee KC, Kim E, Yoon J, Kim S, Kho YH, Goodfellow M, Komagata K (1993). 「5S リボソーム RNA のヌクレオチド配列によるペプチドグリカングループ B 放線菌の超属分類」Antonie van Leeuwenhoek . 64 (3–4): 307–313. doi :10.1007/BF00873089. PMID 8085792. S2CID 32811031.

[LPSN-2] Euzéby JP, Parte AC. 「Microbacteriaceae」。命名法で定められた原核生物名のリスト（LPSN）。 2022年5月28日閲覧。

[Nouioui-3] Nouioui I、Carro L、García-López M、Meier-Kolthoff JP、Woyke T、Kyrpides NC、Pukall R、Klenk HP、Goodfellow M、Markus Göker M (2018)。「放線菌門のゲノムベースの分類」。Front。Microbiol。9 ： 2007。doi ：10.3389 / fmicb.2018.02007。PMC 6113628。PMID 30186281。